Determination of genetic diversity of rhododendron species in turkey
Türkiye orman güllerinin genetik çeşitliliğinin belirlenmesi
- Tez No: 453624
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜGE TÜRET
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoloji, Genetics, Biology
- Anahtar Kelimeler: Biyoloji, Genetik varyasyon, Polimorfizm-genetik, Biology, Genetic variation, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
T urkiye'nin Ormang ulleri 10 takson ile temsil edilmekte ve do gudaki Artvin ilinden bat daki Istranca da glar na kadar Karadeniz ve Marmara k y lar nda do gal olarak b uy umektedirler. G un um uzde Rhododendron cinsi i cerisinde yer alan bitkiler, karakteristik ozelliklerinden dolay d s mek^an d uzenlemelerinde ve saks l s us bitkisi olarak kullan m a c s ndan son derece pop uler bitkilerdir. Kentsel peyzaj planlamalar nda k ult ure al nm s do gal orman g ul u t urlerinin yan s ra slah cal smalar ile geli stirilmi s ve g un um uzde say lar binlerle ifade edilen orman g ul u ce sitleri de s k ca kullan lmaktad r. Ulkemizde do gal olarak yay l s g osteren orman g ulleri g osteri sli s us bitkileri olmalar na ra gmen yerli t urler hen uz k ult ure al nmad g i cin kentsel peyzaj uygulamalar nda s us bitkisi olarak kullan lmamaktad r. Peyzaj planlamalarda kullan lan orman g ulleri ise ithal edilerek, y uksek yatlarla t uketiciye sunulmaktad r. T urkiye'nin do gal olarak yeti sen Rhododendron t urlerinin ex-situ korunmas i cin iyi belgelendirilmi s bir kaynak olu sturmak amac yla ulusal bir proje ba slat lm st r. Bu projenin ortaklar olarak, yer ve y uksekli gin ce sitlili ge olas etkilerini de dahil ederek genetik ce sitlili gi analiz etmeyi ama clanm st r. Ornekler aras ndaki genetik ce sitlilik ve logenetik ili skiyi incelemek i cin RAPD, ISSR ve ITS i saret cilerinden olu san toplam 22 primer se cilmi stir. K ume analizi olu sturmak i cin veri matrisinin genetik uzakl k hesaplamalar , Pearson ve Jaccard katsay s kullan larak UPGMA metodu ile ger cekle stirilmi stir. Genetik benzerli gi yans tan dendogramlar MATLAB kullan larak cizilmi stir. T um primerler, 200-3000 bp aras nda de gi sen amplikon uretmi s ve % 100 polimor zm g ostermi stir. Co gra aral g n t ur genetik ce sitlili gi uzerindeki etkisi, olduk ca geni s yay lm s yabani t urlerin cok dar do gal geli sim yerlerine sahip di ger yabani t urlerden ayr gruplar halinde k umelenmesyle a c k ca g or ulm u st ur.
Özet (Çeviri)
The Rhododendrons of Turkey are presented by 10 taxa and they grow naturally along the coast of the Black Sea region from Artvin province at the east to Istranca Mountains at the west. Although in many countries, cultivated natural forms or breeding varieties of Rhododendron genus are highly used in landscape planning and as ornamentals, in Turkey there are no cultivated local forms available and all commercial varieties are imported as potted plants. Recently, a national project has started with an objective to generate well documented ex-situ conservation of all naturally growing Rhododendron species of Turkey following a detailed morphological, molecular studies and tissue culture propagations. As partners of this project our aim is to analyze the genetic diversity by incorporating possible impacts of location and altitude to their diversity. The plant material has been collected from nature at di erent GPS locations and diverse altitudes along the cost of Black Sea and Marmara region. Total of 22 primers consisting of RAPD, ISSR and ITS markers were selected to study the genetic diversity and phylogenetic relationship among the samples. Genetic distance calculations of the data matrix to generate cluster analysis were performed by UPGMA using Pearson and Jaccard coe cient. The dendograms refecting the genetic distance were drawn using MATLAB. All primers have shown 100% polymorphism, producing amplicons ranging between 200-3000bp. The average number of bands obtained for ISSR and RAPD primers were 19.1 and 20.9 respectively. The impact of geographic range on the species genetic diversity were clearly observed in cluster analysis when highly wide spread wild species were clustered as separate groups from the other wild species which has very narrow range of natural growth locations.
Benzer Tezler
- Küre Dağları Milli Parkının vejetasyon ekolojisi ve iklim değişikliği senaryolarına göre değerlendirilmesi (Doğu kayını örneği)
Vegetation ecology of Küre Mountains National Park and assessment of climate change scenarios (Fagus orientalis sample)
MUHAMMET ÖZTEKİNCİ
- Determination of genetic diversity in watermelon (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum & Nakai) germplasms
Karpuz (Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum & Nakai) germplazmlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi
ZEHRA İPEK ULUTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANNE FRARY
- Determination of genetic diversity in national olive collection (Olea europaea L.) using SSR and SRAP markers and development of SNP marker for traceability of memecik olive cultivar
Ulusal zeytin koleksiyonundaki (Olea europaea L.) genetik çeşitliliğin SSR ve SRAP markörleri kullanılarak belirlenmesi ve memecik zeytin çeşidinin izlenebilirliği için SNP markörlerinin geliştirilmesi
NESLİHAN IŞIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANNE FRARY
- Determination of genetic diversity between eggplant and its wild relatives
Patlıcan ve yabani türleri arasındaki genetik çeşitliliğin belirlenmesi
YELİZ TÜMBİLEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SAMİ DOĞANLAR
DOÇ. DR. ANNE FRARY
- Determination of Genetic Diversity and Antioxidant Content of the National Melon (Cucumis melo) Collection
Ulusal kavun (cucumis melo) hatlarında genetik çeşitliliğin belirlenmesi ve antioksidant karakterizasyonu
HASAN ÖZGÜR ŞİĞVA
