Çift etkiye sahip potansiyel antioksidan ve anti-parkinson ilaç aktif maddelerin in siliko tasarımı
In silico design of potential drug active compounds possessing antioxidants and anti-parkinson dual effect
- Tez No: 432966
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE OGAN, PROF. DR. SAFİYE ERDEM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Kimya, Monoamin oksidaz inhibitörleri, Chemistry, Monoamine oxidases inhibitors
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Enzimler, canlılarda gerçekleşen metabolik reaksiyonların pek çoğunu hızlandıran protein yapısındaki biyolojik katalizörlerdir. Biyolojik sistemlerde endojen ve ekzojen kaynaklı faktörler sebebiyle sürekli olarak serbest radikaller ve diğer oksijen kökenli türler üretildiğinden, canlılar bu faktörlerle mücadele edebilmek amacıyla enzimatik ve non-enzimatik antioksidan savunma sistemleri geliştirmiştir. Vücudumuzda süperoksit üreten sistemlerden bir tanesi de monoamin oksidaz enzimidir. Monoamin oksidaz (EC-1.4.3.4, MAO) mitokondri zarının dışında bulunan, biyolojik aminlerin oksidasyonundan sorumlu bir flavoenzimdir. MAO'nun, MAO-A ve MAO-B olmak üzere iki fonksiyonel izoenzimi bulunmaktadır. Bunlardan MAO-A seçici olarak epinefrin ve serotonini oksitlerken, MAO-B ise dopamini oksitler. Dolayısıyla MAO-A ve MAO-B'nin inhibisyonu bu aminlerin yıkımını engelleyerek antidepresan ve anti-Parkinson etki sağlar. Bu bilgiler ışığında bu tez çalışmasında; 1. Yeni sentezlenmiş ve antioksidan aktiviteleri ölçülmüş 37 adet kumarin türevinden oluşan veri seti kullanılarak, sağlamlığı istatistiksel kriterlerle ispatlanmış matematiksel modeller geliştirilmiş ve kantitatif yapı-aktivite ilişkileri (KYAİ) tanımlanmış, 2. Aynı kumarin türevlerinin MAO enzimleri ile etkileşimleri doking metoduyla incelenerek seçicilik ve etkinlikleri araştırılmış, 3. Her iki çalışmadan elde edilen sonuçlar karşılaştırılıp değerlendirilerek, çift-etki gösterme potansiyeli olan bileşikler belirlenmiş ve 4. Oluşturulan KYAİ modelleri kullanılarak yeni çift-etkili kumarin türevleri tasarlanmıştır. Yapılan çalışmalar sonucunda veri seti olarak kullanılan kumarin türevlerinin ve yeni tasarlanan kumarin türevlerinin bir kısmının yüksek MAO inhibisyon ve antioksidan aktivitesine sahip olduğu tespit edilmiştir. Dolayısıyla da çift etkiye sahip olduğu düşünülen bu bileşikler gelecek çalışmalar için umut vaad etmektedir.
Özet (Çeviri)
Enzymes are biological catalysts having protein structure that speed up most of the metabolic reactions occuring in living organisms. As free radicals and oxygen based species are continuously produced in the biological systems depending on endogenous and exogenous factors, living organisms have developed enzymatic and non-enzymatic antioxidant defence mechanisms. One of the systems in our body that produce superoxide is monoamine oxidase enzyme. Monoamine oxidase (EC-1.4.3.4, MAO) is a flavoenzyme that is present outside the mitochondria membrane and is responsible for oxidation of biogenic amines. There are two functional isoenzymes of MAO; MAO-A and MAO-B. MAO-A selectively oxidizes epinephrine and serotonine, whereas MAO-B oxidizes dopamine. Hence, inhibition of MAO-A and MAO-B exhibits antidepressant and anti-Parkinson effect by preventing degradation of those amines. In the light of these, in this thesis; 1. Mathematical models that are proved to be reliable by statistical criteria have been developed by using data set comprising of recently synthesized 37 coumarin derivatives with measured antioxidant activities. The quantitative structure-activity relationships (QSAR) are described. 2. MAO binding affinity of the same coumarin compounds have been studied by examining their interactions with MAO enzymes through docking method. 3. Molecules that potentially exhibit dual-effect are specified by comparing and assessing the results of both QSAR and docking studies. 4. New coumarin derivatives have been designed by using the validated QSAR models developed in this work. It is confirmed that some of the coumarin derivatives that are used as data set and those that are newly designed exhibit both high MAO inhibition and antioxidant activities. Hence, those compounds are promising dual effect inhibitors for future studies.
Benzer Tezler
- Antioksidan, antimikrobiyal özellik kazandırılmış nanokompozit filmlerin geliştirilmesi ve gıda uygulamaları
Development of antioxidant, antimicrobial nanocomposite films and their food applications
ECE SÖĞÜT
Doktora
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATIF CAN SEYDİM
- The uniaxial and coaxial electrospun nanofiber encapsulation of sour cherry (Prunus cerasus L.) anthocyanins and their in vitro bioaccessibility
Vişne antosiyaninlerinin tek eksenli ve çift eksenli elektroeğirme yöntemiyle enkapsülasyonu ve biyoyararlılığının incelenmesi
BEYZA ŞÜKRAN IŞIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİLİZ ALTAY
- Evolutionary engineering strategy for the adaptation to cobalt stress in a carotenoid producing yeast
Evrimsel mühendislik yöntemiyle karotenoid üreten mayanın kobalt stresine adaptasyonu
CEREN GÖRAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Mikrobiyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Enzim içeren karbon pastasına dayalı amperometrik biyosensörlerin geliştirilmesi
Başlık çevirisi yok
O. LEVENT GÖKGÜNNEÇ
- Kürt-Türk çapraz evliliklerde çocuk yetiştirme pratiklerine sosyolojik bir bakış: İzmir ve Ankara üzerine nitel bir çalışma
A sociological perspective on child-rearing practices in kurdish-turkish intermarriages: A qualitative study on İzmir and Ankara
AYŞE ÇANDIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
SosyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiSosyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜL ÖZATEŞLER ÜLKÜCAN