Geri Dön

Phenotypic analysis of pash-1ts mutant to understand the roles of miRNAs in UPRER

Mikro RNAların endoplazmik retikulumdaki katlanmamış protein tepkisi (KPTER)'ndeki rollerini anlamak için pash-1ts suşunun fenotipik analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 414066
  2. Yazar: GÜLKIZ BAYTEK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. FUNDA ŞAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Mikro RNA'lar 22 nükleotid uzunluğunda, kodlamayan transkripsiyon sonrası gen düzenleyicileridir. Güncel araştırmalar pash-1ts suşunun yüksek sıcaklıklarda idame ettirilmesiyle, miRNA biyosentezinin ilk aşamasının engellenmesinden dolayı, olgun miRNA üretemediğini göstermiştir. Yine aynı çalışmada miRNA'ların kurtçukların normal fizyolojik yapıları ve normal yaşama süreçleri için gerekli olduğu gösterilmiştir. miRNAların sentezlenmemesi durumundaki azalan yaşama ömrü ve fizyolojik malformasyonlar gözlemlendiğinde, miRNA'ların proteostatik mekanizmalardaki fonksiyonları gündeme gelmektedir. Hücreler hayatları boyunca çeşitli streslerle karşı karşıya kalırlar ve bu streslerle baş etmek için bazı mekanizmalar geliştirmişlerdir. Bunlardan bir tanesi endoplazmik retikulumdaki katlanmamış protein tepkisidir (KPTER). KPTER sadece protein katlanmasında değil bağzı farklı fizyolojik durumlarda da önemlidir; örneğin amino asit metabolizması, enerji homeostasisi ve embryonik gelişim. Tezimin amacı ER stresi altındaki miRNA'ların stres yanıtı mekanizmalarının aktivasyonu ve KPTERın düzenlenmesindeki rollerini aydınlatmaktır. Bu mekanizma pash-1ts mutantındaki stres genlerinin farklı ER streslerine gösterdiği tepkiyle araştırılmıştır. Sonuçlarımız göstermiştir ki, miRNA üretiminin durdurulması HSP-4, memelilerdeki BiP homoloğu, aktivasyonuna neden olmaktadır. Fakat ilginç bir şekilde pash-1ts mutantları kronik ER stresine karşı resistant fenotip göstermiştir. Normalde ölümcül ER stres konsantrasyonları apoptotik yolakların aktive olmasına neden olurken gözlemlediğimiz bu sonuç miRNA'ların olmayışının apoptotik yolak aktivasyonunda gecikmelere yol açabileceğini göstermiştir. Sonuçlarımızın doğruluğunun ispatı daha çok araştırma ile mümkündür. Ayrıca normalde yaşam ömrünü uzatan aktif XBP-1 proteininin pash-1ts suşunun yaşam ömrüne bir etkisi olmadığı gözlemlenmiştir.

Özet (Çeviri)

MiRNAs in ̴22 nucleotide long, noncoding RNAs that are post transcriptional gene regulators. Recent studies using conditional temperature‐sensitive (ts) mutant of the miRNA pathway, pash‐1(ts), have established that post‐developmental expression of miRNA is essential for normal lifespan and physiology. Due to the tight link between reduced lifespan and protein quality control, these observations suggest a potential involvement of miRNAs in the regulation of protein homeostasis (proteostasis). During their lifetime, cells are faced with the variety of stresses which are the reason of protein misfolding and aggregation. Throughout evolution, organisms improve stress response mechanisms to deal with the disruption of protein homeostasis. One of the stress response mechanisms is endoplasmic reticulum unfolded protein response (UPRER). UPRER is crucial not just as a stress response mechanism but also as a regulator of amino acid metabolism, the energy homeostasis and also it is indispensable for the embryonic development. The overall aim of my thesis is to investigate and establish the mechanisms by which miRNAs are involved in the regulation of UPRER upon activation of the stress response mechanisms. This has been examined by testing the effects of pash-1(ts) mutant on expression and regulation of stress genes involved in the cellular protein quality control and testing the ability of pash‐1(ts) mutants to respond to ER stress challenges that induce the UPRER. Our results demonstrated that compromised miRNA production leads to the activation of HSP-4, C. elegans homolog of BiP, in various tissues. Surprisingly, pash-1ts mutants were resistant to chronic applications of ER stressors in detrimental concentrations, which normally lead to the activation of pro-apoptotic branch of UPRER. So that our data suggest a model in which the absence of miRNA production may confer resistance to the upregulation of apoptotic pathways upon ER stress although it needs to be further studied. We also showed that XBP-1s, a cell-non-autonomous regulator of UPRER leading to the extension of lifespan, exhibited no change in lifespan of the worms lacking miRNA production. These results suggest that pash-1ts animals can be used as a new tool to study miRNA functions in the non-autonomous cell signaling in the future.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    442668

    Çiçekli dişbudak (Fraxinus ornus L.) döl denemeleri: 5 yıllık sonuçlar

    Fifth year results in progeny test of manna ash (Fraxinus ornus L.)

    SELİN TEKOCAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Ormancılık ve Orman MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEBİ BİLİR

  2. Tez No

    442760

    Çiçekli Dişbudak'ta (Fraxinus ornus subsp. cilicica L.) aileler arası morfolojik farklılıklar

    Morphological variation among manna ash (Fraxinus ornus subsp. cilicica L.) families

    NURDAN TUNÇBİLEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Ormancılık ve Orman MühendisliğiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Orman Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEBİ BİLİR

  3. Tez No

    57293

    Süt protein polimorfizm ve polimorfizm ile tütün bazı kompenintlerinin ilişkisi

    Polymorphism of milk preteins and its relation to some components of milk

    MAHMUT DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Gıda MühendisliğiTrakya Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET DEMİRCİ

  4. Tez No

    735249

    Phenotypic and genetic analysis of the German sweet cherry germplasm collection in terms of blooming time

    Başlık çevirisi yok

    MARİA CHİCHASHVİLİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    ZiraatEge Üniversitesi

    Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİRSEN ÇAKIR AYDEMİR

    DR. SUSAN SCHRÖPFER

  5. Tez No

    816051

    Phenotypic and genotypic analysis of macrolide-lincosamide-streptogramin B resistance among methicilin-resistant staphylococcus aureus and methicilin-susceptible staphylococcus aureus isolates

    Metisilin dirençli ve metisilin duyarlı staphylococcus aureus izolatlarında makrolid-linkozamid-streptogramin B direncinin fenotipik ve genotipik analizi

    NOURA SAED MAHMOUD AETEER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    MikrobiyolojiBaşkent Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYLİN ALTAY KOÇAK

Geri Dön