Functional study of common bean isoliquiritigenin 2'-O- methyltransferase gene under salt stress
Fasulye bitkisi“isoliquiritigenin 2'-o- methyltransferase”geninin tuz stresi altında fonksiyonel analizi
- Tez No: 387427
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜGE TÜRET
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Botanik, Biology, Biotechnology, Botany
- Anahtar Kelimeler: Abiyotik faktörler, Taze fasulye, Transgenik bitkiler, Tuz toleransı, Abiotic factors, Green beans, Transgenic plants, Salt tolerance
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Ekilebilir alanlarda tuz oranlarının artışı yıllardır tarımın gelişmesinin önündeki en büyük sorunlardan biri olmuştur. Dünyadaki tarım alanlarının yüzde 20'si tuz stresi altındadır ve bu miktarın gelecekte artması üretim miktarlarında daha fazla düşüşe neden olacaktır. Baklagiller familyasının bir üyesi olan fasulye bitkisi dünyada besinsel ve tarımsal değerleriyle öne çıkmaktadır ve tuza karşı duyarlılık göstermektedir. Bu yüzden fasulye bitkisinin tuz koşullarında verdiği tepki mekanizmalarının anlaşılması, dayanıklı çeşitlerin geliştirilmesi için bir gereklilik olmuştur. Fasulye bitkisinin tuz stresi altındaki transkriptom analizi strese dayanıklılıkta ikincil bitki metabolizmasının önemini göstermiştir. Transkriptom verisinin biyoinformatik analizi tuzlulukta etkin olan bir çok geni ortaya çıkarmıştır. Tuza dayanıklı bir fasulye çeşidi olan İspir'in transkriptomundaki tuz tarafından indüklenen genlerin in siliko analizi, bitki ikincil metabolizmasının bir parçası olan, isoliquiritigenin 2'-O-methyltransferase (ChOMT) adlı genin tuza dayanıklılık tepkilerinde önemli bir yeri olabileceğini göstermiştir. Bu genin Arabidopsis bitkisinde anlatımının arttırılması transgenik bitkilerde muhtemel olarak (i) organik çözünen miktarının artması ve kök yapısının değişmesine neden olarak ozmotik stressin etkilerini kompanse etmiş ve bitkinin suya ulaşımı kolaylaştırarak biyokütle korunumunu sağlamış ve de (ii) tohum bütünlüğünü koruyarak çimlenme oranını arttırmıştır. Sonuçlar ChOMT geninin tuza dayanıklı tahıllar geliştirilebilmek için önemli bir aday gen olabileceğini ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Soil salinity has been one of the major problems in agriculture for many years. Nearly 20% of all cultivated land and half of irrigated land of world soil are saline and these levels are expected to rise in the future which will result in further crop yield reduction. Phaseolus vulgaris L. (common bean) is a legume crop with great value in the world with its nutritional and agricultural features, yet it is fairly susceptible to salt stress. Thus to understand the underlying mechanism of salt stress tolerance in plants become a necessity to eventually develop salt tolerant varieties. Our previous studies on transcriptome analysis of common bean under salt stress has revealed a major differential expression in transcripts of secondary metabolism which undoubtedly plays role in both biotic and abiotic stress responses. Further bioinformatics analysis on the transcriptome data has pointed out many salt responsive genes. A secondary metabolism gene, Isoliquiritigenin 2'-O-methyltransferase (ChOMT) has emerged as a prominent gene in salt-tolerance responses from the in silico analysis of salt induced transcripts in a salt-tolerant common bean variety. Overexpression of common bean ChOMT gene in Arabidopsis thaliana model enhanced salt tolerance of transgenic plants possibly by creating an impact on (i) accumulation of organic solute content and architectural change in root tissues to compensate adverse effect of osmotic stress and increase in the chance to absorb and conduct water to ensure biomass, and (ii) protection of seed integrity via increase in the viability and vigor of seeds.
Benzer Tezler
- Functional study of certain genes selected from SSH library of common bean under salinity stress
Tuz stresi altındaki fasülye bitkisine ait SSH kütüphanesinden seçilen bazı genlerin fonksiyonel analizi
BALKAN CANHER
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜGE TÜRET
- Transcriptome analysis of common bean under salt stress and functional study of salt responsive genes
Tuz stresi altında taze fasulye bitkisinin transkriptom analizi ve tuza cevap veren genlerin işlevsel analizleri
MAHMUT CAN HIZ
Doktora
İngilizce
2015
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜGE TÜRET
- Türkiye'de yetiştirilen fasulye çeşitlerinden izole edilen proteinlerin çeşitli fizikokimyasal ve fonksiyonel özelliklerinin incelenmesi
Functional properties and physicochemical characterisation of proteins isolated from bean varieties grown in Turkey
RUKİYE GÜNDOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI CAN KARAÇA
- Fasulye'de DGK (Diacylglycerol kinaz) genlerinin genom düzeyinde tanımlanması ve gen ifade düzeylerinin abiyotik stres faktörleri ile ilişkisi
Genome-wide identification of DGK (Diacylglycerol kinase) genes in common bean and association of gene expression levels with abiotic stress factors
MEHMET ZAHİT YEKEN
Doktora
Türkçe
2021
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VAHDETTİN ÇİFTÇİ
DOÇ. DR. GÖKSEL ÖZER
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde demir (Fe) ve çinko (Zn) birikiminin değerlendirilmesi için metal iyon taşıma proteinlerinin tanımlanması ve gen ifade analizi
Gene expression and identification of metal ion transport proteins to assess iron (Fe) and zinc (Zn) accumulation in common bean (Phaseolus vulgaris L.)
HİLAL YILMAZ
Doktora
Türkçe
2022
ZiraatBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VAHDETTİN ÇİFTÇİ
DOÇ. DR. FAHEEM SHAHZAD BALOCH