Molecular characterization of the effects of valdecoxib on colon cancer cell lines (HT29 and SW 620) using ATR-FTIR spectroscopy
Valdekoksib in kolon kanseri hücreleri (HT29 ve SW 620) üzerine olan etkilerinin ATR-FTIR spektroskopisi ile moleküler karakterizasyonu
- Tez No: 355309
- Danışmanlar: PROF. DR. FERİDE SEVERCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Kolon kanser, COX-2 inhibitörleri, VLX, HT 29, SW 620, ATRFTIR Spektroskopi, Colon cancer, COX-2 inhibitors, VLX, HT 29, SW 620, ATR-FTIR spectroscopy
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanser, malignant türler arasında en yaygın üçüncü türdür ve dünya genelinde kanser ölümleri arasında dördüncü sıradadır. Gelişmiş ülkelerde her yıl 945,000 yeni vaka ve 492,000 ölüm olması tahmin edilmektedir. Bağırsaklardaki kronik inflamasyonun; yüksek uyarılma sonucu öncü inflamasyon sitokinlerinin salgılanmasında artışa neden olduğu gösterilmiştir. Bu durum kanser gelişiminde önemli bir rol oynamaktadır. Arakidonik asit yolağının önemli enzimlerinden olan COX-2 seviyesi kronik inflamasyon sırasında ciddi şekilde artış göstermektedir. Yapılan deneysel çalışmalar göstermiştir ki; bu grup ilaçların pek çok kanser türü üzerinde koruyucu ve tedavi edici etkileri vardır. Bu nedenle COX-2 inhibitörlerinin kanser tedavisindeki etkileri ilgi çeken bir alandır. Bu çalışmada Valdecoxib, COX-2 grubuna ait bir ilaç olarak seçilmiştir. Moleküler seviyede COX-2 inhibitörlerinin kanser üzerine olan etkileriyle ilgili pek çok çalışma olmasına rağmen makromoleküler düzeyde çok az çalışma vardır. Bu çalışmada, Valdecoxib'in (VLX) HT 29 ve SW 620 kolon kanseri hücre hatlarındaki makromoleküler düzeyde yapacağı etkilerin ATR-FTIR spektroskopisi tekniği kullanılarak araştırılması hedeflenmiştir. 3030-2800 cm-1 (C-H bandı) bölgesi spektral analizleri, her iki hücre hattında da lipit konsantrasyonu, düzenliliği ve membran akışkanlığında VLX uygulamasının önemli değişikliklere neden olduğunu göstermiştir. Ayrıca fingerprint (1800-900 cm-1) bölgesi bant analizleri de protein konsantrasyonu parametrelerinin VLX uygulamasından etkilendiğini göstermiştir. Bütün bunlara ek olarak, elde edilen bu sonuçların COX-2 den bağımsız olduğu da tespit edilmiştir. Yapılacak yeni çalışmalarla, VLX in kolon kanseri tedavisinde destekleyici tedavi ajanı olarak kullanılmasının önü açılabilecektir.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancer is the third most common malignancy and the fourth most frequent cause of cancer deaths worldwide, with 945,000 estimated new cases and 492,000 deaths per year in industrialized countries. Chronic inflammation of the bowel is associated with increased levels of pro-inflammatory cytokines and the increased signaling, which plays important roles in the development of carcinoma. During chronic inflammation COX-2 levels are dramatically increased which is the main enzyme in the arachidonic acid pathway. It is observed from the previous studies that COX-2 inhibitors have chemopreventive as well as therapeutic effects on different cancer types. Therefore, the effect of COX-2 inhibitors on cancer therapy is an area of high interest. In this study Valdecoxib (VLX) is chosen as a member of COX-2 inhibitors. There are lots of studies related to the effect of COX-2 inhibitors on colon cancer at molecular level, but there is a limited number of studies at structural level. In this study, it was aimed to investigate the alterations in the macromolecules of HT 29 and SW 620 colon cancer cell lines after VLX treatment using ATR-FTIR spectroscopic techniques. Spectral analysis at C-H region (3030-2800 cm-1) revealed that lipid concentration, order and membrane fluidity of two colon cancer cell lines were highly affected due to VLX treatment. Furthermore, spectral analysis at fingerprint region (1800-900 cm-1) showed that protein concentration parameters were also affected due to VLX treatment. In addition, in this study it was also observed that the above results were COX-2 independent. After additional research, VLX may have a chance as an adjuvant therapy in the treatment of colon cancer.
Benzer Tezler
- The effects of sequential inoculation of non-saccharomyces and saccharomyces yeasts from spontaneously fermented grape must varieties on kalecik karasi wine and molecular characterization of saccharomyces and lachancea thermotolerans isolates
Doğal fermente üzüm şırasından izole edilen saccharomyces ve saccharomyces olmayan mayaların sıralı inokülasyonunun kalecik karası şarabı üzerine etkileri ve saccharomyces ve lachancea thermotolerans izolatlarının moleküler karakterizasyonu
GİZEM PINAR ARSLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜZİN CANDAN GÜLTEKİN
PROF. DR. AYŞE GÜL GÖZEN
- Mutant parkin proteininin moleküler karakterizasyonu ve nöroblastoma hücre proteomu üzerindeki etkisi
Molecular characterization of mutant parkin protein and the effects on neuroblastoma cell proteome
SİNEM ÖZGÜL
- Kör farelerde hipoksi ve normoksinin TRAIL aracılı hücre ölümünde rol oynayan ligand, reseptör ve anti-apoptotik yapılar üzerindeki etkilerinin araştırılması ve DR4, DR5, DcR1, DcR2, OPG, cIAP-1, cIAP-2, XIAP ve FLIP genlerinin moleküler karakterizasyonu
Investigation of the effects of hypoxia and normoxia on ligand, receptor and anti-apoptotic structures in TRAIL-mediated cell death in blind mole rats and molecular characterization of DR4, DR5, DcR1, DcR2, OPG, cIAP-1, cIAP-2, XIAP and flip genes
BARIŞ YILDIZ
Doktora
Türkçe
2018
FizyolojiKafkas ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NADİDE NABİL KAMİLOĞLU
YRD. DOÇ. DR. CEM ÖZİÇ
- Molecular characterization of the GTF2A-1 antisense long non coding RNA
Gtf2A-1'in antisens uzun kodlamayan RNA'sının moleküler karakterizasyonu
MURAT CANER YARIMÇAM
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Biyokimyaİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
- Molecular characterization of biofilm properties of Listeria monocytogenes in the presence of o-coumaric acid and 4-hydroxybenzoic acid
Listeria monocytogenes'in o-kumarik asit ve 4-hidroksibenzoik asit varlığında biofilm özelliğinin moleküler karakterizasyonu
UMUT EKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FERDA SOYER DÖNMEZ
DOÇ. DR. İKBAL AGAH İNCE