Geri Dön

Fasulye (Phaseolus vulgaris L.)'de ekonomik öneme sahip bazı agronomik karakterleri kontrol eden dna markırlarının ilişki haritalaması ile saptanması

Detection of dna markers controlling some economically important agronomic characters by association mapping in common bean (Phaseolus vulgaris L.)

PDF İndir

  1. Tez No: 335216
  2. Yazar: SEDA NEMLİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. M. BAHATTİN TANYOLAÇ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bağlantı dengesizliğine (Linkage Disequilibrum, LD) dayanan ilişki haritaları, kantitatif özellik lokusu (Quantitative Trait Locus, QTL) haritalarına alternatif ve önemli özellikleri kontrol eden genlerin belirlenmesinde etkili bir metotdur. Bu çalışmada 66 fasulye genotipi kullanılmış ve 233 Amplified Fragment Lenght Polymorphism (AFLP), 105 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) ve 80 Simple Sequence Repeat (SSR) markırı analiz edilmiştir. Bu populasyonda LD ve populasyon yapısı belirlenmiştir. Tüm genomu kapsayacak şekilde yüksek LD değeri saptanmıştır (r2?0.1, p<0.01). STRUCTURE programında populasyon yapısı belirlenmiştir ve 66 fasulye genotipi kendi arasında 7 (K=7) ana gruba ayrılmıştır. TASSEL (Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage) programında Genel Lineer Model (General Linear Model, GLM) metodu kullanılarak markır ve 5 fenotipik özellik (liflilik özelliği, tohum taslağı sayısı, bitki tipi, bitki büyüme şekli ve çiçeklenme zamanı) arasında ilişki saptanmıştır. Beş fenotipik özellik ile ilişkili toplamda 62 markır önemli olarak belirlenmiştir (r2?0.1, p<0.01). Bu çalışma ile ilk kez 66 fasulye genotipi arasında ilişki haritası yapılmıştır. Fasulyede yapılan bu ilişki haritalama çalışması QTL haritalama metodlarına alternatif olacaktır.

Özet (Çeviri)

Association mapping (AM), based on linkage disequillibrum (LD), is an alternative method for quantative trait locus (QTL) mapping and is a powerful tool for detection of genes controlling important traits. In this study, 66 common bean accessions were used and genotyped using 233 Amplified Fragment Lenght Polymorphism (AFLP), 105 Single Nucleotide Polymorphism (SNP) and 80 Simple Sequence Repeat (SSR) markers. LD of pairwise loci and population structure were analyzed. High level of LD (r2?0.1, p<0.01) was found in the accessions at the whole genome level. Population structure was determined using STRUCTURE software and mainly seven groups (K=7) were identified among 66 common bean genotypes. The association analysis between markers and five agronomical traits (pod fiber, seed per pod, plant type, growth habit and days to flowering) was performed using a General Linear Model (GLM) in TASSEL (Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage). Marker and quantitative trait associations were identified and 62 markers were found to be associated with five traits (r2?0.1, p<0.01). The results of this study were determined first time of the significant potential and of association mapping of quantitative traits in 66 common bean accessions. Also, these results suggest that association mapping in common bean could be a useful alternative to QTL mapping.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    414168

    Organik koşullarda yetiştirilmiş fasulyede (Phaseolus vulgaris L.) anlatımı artan genlerin SSH yöntemiyle izolasyonları

    Analysis of genes isolated from common bean grown under organic conditions using SSH method

    ÖZLEM TURAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikYıldız Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT

    DR. ESRA YÜCA

  2. Tez No

    45426

    Tokat ekolojik koşullarında ekim sıklığının kuru fasülye (phaseolus vulgaris L.) çeşitlerinde verim ve verim unsurlarına etkileri

    Başlık çevirisi yok

    İBRAHİM TAYYAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    ZiraatGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Y.DOÇ.DR. CEVDET AKDAĞ

  3. Tez No

    155607

    Erzurum ve Erzincan illerinde fasulye bitkisinde (Phaseolus vulgaris L.) görülen bakteriyel hastalık etmenlerinin tanılanması ve Pseudomonas syringae pv. phaseolicola ve Xanthomonas campestris pv. phaseoli`ye karşı çeşitli fasulye genotip/varyeteleri

    Identification of bacterial pathogen caused disease on bean (Phaseolus vulgaris L.) in Erzurum and Erzincan, and determination of bean genotypes/cultivars for resistance against Pseudomonas syringae pv. phaseolicola and Xanthomonas campestris pv. pha

    MESUDE FİGEN DÖNMEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatAtatürk Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

  4. Tez No

    654939

    Eco-friendly management of common bacterial blight disease caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli on beans

    Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bakteriyel yanıklık etmeni Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli'nin çevre dostu mücadelesi

    TİBEBU BELETE CHANE

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    ZiraatSelçuk Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KUBİLAY KURTULUŞ BAŞTAŞ

  5. Tez No

    373845

    İki noktalı kırmızıörümcek, Tetranychus urticae Koch'un bazı sebze türlerindeki zararlanma düzeylerinin akarın popülasyon gelişimi ile ilişkisi üzerine araştırmalar

    Investigations on injuring levels of two spotted spider mite, Tetranychus urticae Koch on some vegetable species associated with mite's population development

    AYSUN ALSAN PINAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    ZiraatUludağ Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NABİ ALPER KUMRAL

Geri Dön