Geri Dön

Nörofibromatozis tip 1 olgularında DNA tamir genlerinin ekspresyonunun klinik önemi

Clinical significance of DNA repair genes expressions in neurofibromatosis TYPE 1 cases

PDF İndir

  1. Tez No: 331441
  2. Yazar: DUYGU DURSUN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NUR OLGUN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Onkoloji, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Nörofibromatozis Tip 1, DNA onarım genleri, klinik ili ki, DNA, DNA hasarı, DNA onarımı, Gen ifadesi, Nörofibromatozis, neurofibromatosis type 1, DNA repair genes, clinical relationship, DNA, DNA damage, DNA repair, Gene expression, Neurofibromatoses
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Nörofibromatozis Tip 1 Olgularında DNA Tamir Genlerinin Ekspresyonunun Klinik Önemi Duygu Dursun DEÜ, Sa lık Bilimleri Enstitüsü, Onkoloji Enstitüsü, Temel Onkoloji Bölümü Yazı ma Adresi: E itim Mah. / Ekrem Güer Sok. / No:42/5 / Murat Öz Apartmanı Balçova/ ZM R AMAÇ: Nörofibromatozis Tip 1 (NF1), çe itli fenotiplere sahip, sık görülen otozomal dominant genetik bir hastalıktır. NF1 hastalarının klinik çe itlili inin genetik nedeni sorgulanmaktadır. DNA onarım genleri DNA? daki hataların onarımından sorumludur. Biz DNA onarım genlerinin ekspresyonunu ve onların NF1 hastalarındaki klinik önemini nörofibrom, hamartomatöz lezyon, di er tümörler ya da ailesel NF1 varlı ı ile kar ıla tırarak analiz etmeyi amaçladık. Bu çalı manın di er amacı gen ekspresyonları ile klinik bulgular arasında ili ki olup olmadı ını belirlemekti. METOD: NF1? li hastalar ve NF1 ile birlikte malignitesi olan hastalar çalı maya alındı. Kontrol grubu olarak da benzer ya grubundaki her hangi bir hastalı ı olmayan çocuklar ve NF1 ile ilgisi olmayan maligniteli olgular olu turdu. Çalı ma toplam 46 olgu içermekteydi: 36 NF1 hastası (30 çocuk; 6 ebeveyn), hiç bir hastalı ı olmayan 8 kontrol olgusu, rabdomiyosarkomlu NF1 olmayan 2 kontrol olgusuydu. 8 kontrol olgusunun ya ortalaması 17±7,03 (10-30 ya ) (ortanca 13 ya ) idi. NF1 olgularının 17? si kadın 19? u erkekti. NF1? li olgularımız için tanı anındaki ya ortalaması 10,08±8,86 (9 ay- 38 ya ) (ortanca 8 ya ) iken hastalarımızın çalı maya alınan ebeveynlerinin ya ortalaması 40,50±1,22 (39-42 ya ) (ortanca40 ya ) idi. 36 hastanın, 17? si nörofibromlu, 17? si hamartomatöz lezyonluydu. 1 hastada rabdomiyosarkom gözlenmi , 1 hasta meme kanseri ve 4 hasta da optik gliomluydu. Her bir hasta ve kontrol grubundan periferik kandan mononükleer hücre izolasyonu yapıldı. RNA izolasyonu ve cDNA dönü ümünden sonra, her bir olguda Real-Time PCR ile DNA onarımı ile ili kili 84 genin ekspresyonu (standart array, SABiosciences) belirlendi. Ekspresyonların kontrol grubuna göre kat de i iklikleri ve T test ile p de eri kar ıla tırmalı gruplarda de erlendirildi. BULGULAR: Ara tırma grubunu 36 NF1 hastası, kontrol grubunu ise 8 sa lam çocuk ve 2 adet de NF1 ile ili kisi olmayan maligniteli olgu (rabdomiyosarkom) olu turmaktadır. NF1 olgularında, PNKP, RAD18, XAB2, XRCC3, XRCC4 ve XRCC5 genlerinin ekspresyonu kontrol grup ile kar ıla tırıldı ında azaldı (p<0.05, T test). Nörofibromlu NF 1 olgularında, nörofibromsuz NF 1 olgularıyla kar ıla tırıldı ında POLB ekspersyonu artarken; ERCC3,LIG1,MGMT, MRE11A, MPG, MSH6, PARP2, PRKDC, RAD51B, RAD52, RPA3, SMUG1, TREX1, UNG ekspresyonu azaldı. RAD18 ailesel NF 1 varlı ında ekspresyonu azalmı ve istatistiksel olarak önemli oldu u saptandı. Malign tümör olgularında NF 1? li ya da NF 1? siz gruplar kar ıla tırıldı ında gen ekspresyonunda kat de i iklikleri vardı. DDB2, MGMT, MLH1, POLB UNG, XPA ekspresyonları arttı. NF 1?li RMS olgusu ile NF 1? siz RMS olguları kar ıla tırıldı ında DDB2, MGMT, MLH1, POLB, UNG, XPA olmak üzere 6 genin ekspresyonu 10 kattan fazla arttı. SONUÇ: Bulgularımız NF 1 olgularındaki klinik bulguları öngörmek için DNA onarım sistemi ili kili gen ekspresyon de i ikliklerinin rolü olabilece ini göstermi tir.

Özet (Çeviri)

Clinical Significance of DNA Repair Genes Expressions in Neurofibromatosis Type 1 Cases Duygu Dursun DEU, Institute of Health Sciences, Oncology Institute, Fundamental Oncology Departure Corresponding Adress: Egitim Quarter/ Ekrem Guer street No:42/5 Murat Oz Apartment Balcova IZMIR/ TURKEY OBJECTIVE: Neurofibromatosis Type 1 (NF1) is a a common autosomal dominant genetic disorder that has a variable phenotype. The genetical causes of clinical variability of NF1 patients is questioned. DNA repair genes are responsible for proofreading the missing in the DNA. We aimed to analyze expression of DNA repair genes and their clinical significance in NF1 patients; comparing exsistance of neurofibroma or hamartomatous lesions or other tumours or existance of NF1 in the family. The other aim of this study was to determine whether any relationship between gene expressions and clinical findings. METHOD: NF1 patients and malignancy with NF1 pateints were included and in this study. In the control gruop children that they are in the similar age group and they have no disease and no malignacy group were included. This study included total 46 cases. 36 NF1 patients (30 children; 6 parents), 8 control cases without any disease, two control cases with rhabdomyosarcoma without NF1 were included in this study. The mean age of control group was 17±7,03 (10-30 age) (median 13 age). In the NF1 pateints gruop 17 of them are female, and 19 are male. The mean age at diagnosis is 10,08±8,86 (9 months- 38 age)(median age 8) for children and 40,50±1,22 (39-42 age) (median age 40) for parents. Among 36 patients, 17 had neurofibromas, 17 had hamartomatous lesions. Rhabdomyosarcoma (RMS) was observed in one patient, breast cancer in one patient and four patients suffered optic glioma. Peripheral blood was obtained from each cases and mononuclear cells were separated. After RNA isolation and cDNA converting, expressions of 84 genes related with DNA Repair in standard array (SABiosciences) were determined by Real-Time PCR for each case. Fold changes and p values compared with control groups and fold changes evaluated with T test and p value in the comperative groups. RESULTS: 36 NF1 patients, 8 healty children as a control and 2 cases no NF1 realtionship with malignancy (rhabdomyosarcoma) were included in the study group. In NF1 cases PNKP, RAD18, XAB2, XRCC3, XRCC4 and XRCC5 genes were downregulated compared with control group. In NF1 cases having neurofibromas, POLB was overexpressed; while ERCC3, LIG1, MGMT, MRE11A, MPG, MSH6, PARP2, PRKDC, RAD51B, RAD52, RPA3, SMUG1, TREX1, UNG were downregulated compared with the NF1 cases without neurofibromas (p<0.05, T test). RAD18 is the downregulated and statistical significant gene for existance of NF1 in the family. There are gene expression fold change differences determined when malign tumor cases with/without NF1 were compared. DDB2, MGMT, MLH1, POLB UNG, XPA are increased. CONCLUSION: Our results may point toward a role of gene expression changes of DNA repair system to be predictive for clinical manifestations in NF1 cases.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    820861

    Nörofibromatozis tip 1 geninde belirlenen kırpılma bölgesi varyasyonlarının RNA düzeyindeki etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of splicing region variations determined in neurofibromatosis type 1 gene on RNA level

    CEYHAN ÜNLÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiTrakya Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SELMA DEMİR

  2. Tez No

    513883

    Çocukluk çağı nörofibromatozis tip 1 tanılı olgularda kardiyak tutulumun belirlenmesi, rasopatili olguların tanımlanması

    Assessment of cardiac involvement in childhood neurofibromatosis TYPE 1diagnoses, identification of rasopathic cases

    İLYAS EMRE TEKDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DENİZ YÜKSEL

  3. Tez No

    193271

    Ankara ilindeki üç ilköğretim okulu öğrencilerinin epilepsiye yaklaşımı ve hastalık hakkındaki bilgi düzeyleri

    Knowledge of epilepsy and attitudes towards the condition among three elementary schools students in Ankara

    İKBAL OK BOZKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Çocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE SERDAROĞLU

  4. Tez No

    876689

    Genodermatozların klinik ve moleküler açıdan değerlendirilmesi

    Clinic and moleculer evaluation of genodermatosis

    ARZU DENİZ ŞAMA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TAHİR ATİK

  5. Tez No

    156472

    Nörofibromatoz tip 1 olgularında kemik mineral yoğunluğu

    Başlık çevirisi yok

    KUTLUHAN YILMAZ

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MERAL ÖZMEN

Geri Dön