Aktinomiset kaynaklı lipaz geninin klonlanması, dizilenmesi ve ekspresyonu
Cloning, sequencing and expression of actinomycetes lipase gene
- Tez No: 315508
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NALAN YILMAZ SARIÖZLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Aktinomisetler, Genler, Klonlama, Lipazlar, Actinomycetes, Genes, Cloning, Lipases
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada daha önceki çalışmalarda çeşitli toprak örneklerinden izole edilmiş 250 aktinomiset izolatı kullanılmıştır. Canlandırılabilen 149 izolatın kültürel ortamda derin difüzyon yöntemi ile lipaz aktiviteleri incelenmiş ve izolatların belirli derecelerde lipaz aktivitesi gösterdiği görülmüştür. Bunlardan 53 tanesi (% 36) 1 cm ve daha az, 92 tanesi (% 62) 2 cm ve daha az, 4 tanesi (% 2) ise 2 cm'den daha fazla derinlik oluşturmuştur. En yüksek lipaz aktivitesini gösteren izolatın 16S rRNA gen bölgesine dayalı moleküler identifikasyonu yapılmıştır. NCBI veri tabanında BLAST programı kullanılarak yapılan analiz sonucu izolatın veritabanındaki erişim numarası EU283368.1 olan `uncultured actinobacterium clone AS42 16S ribosomal RNA gene' e % 97 oranında benzediği görülmüştür. Bu izolatın genomik DNA'sının rastgele parçalanarak klonlanması sonucu 16 adet klon elde edilmiştir ve izolatın genomik DNA kütüphanesi oluşturulmuştur. Elde edilen klonların kültürel ortamda lipaz aktiviteleri incelenmiş, fakat klonların lipaz aktivitesi göstermediği görülmüştür
Özet (Çeviri)
In this study there are 250 actinomycet isolates which were isolated from different soil samples were used. There were 149 isolates? lipase activities were analyzed which were able to be animated within 250 samples by using deep diffusion method. It was observed that the isolates show lipase activity. 53 of them (36 %) 1 cm and less, 92 of them (62 %) 2 cm and less, 4 of them (2 %) more than 2 cm depth produced too. The isolate?s which showed the highest lipase activity molecular identification has been made which based on 16S rRNA gene. As a result of the study has been made on the NCBI database by using BLAST program, it was observed that, isolate showed 97% similarity `uncultured actinobacterium clone AS42 16S ribosomal RNA gene? which?s access number on the database is EU283368.1. There are 16 clones derived from this isolate?s DNA by breaking down randomly. Genomic DNA library of the isolate is constructed. The derived clones?s lipase activities analyzed in the cultural medium, however the clones have not showed lipase activity.
Benzer Tezler
- Denizel kökenli mikrobiyal suşlardan ürikaz terapötik enziminin üretimi ve karakterizasyonu
Production and characterization of uricase therapeutic enzyme from marine derived microbial strains
MERVE ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyomedikal Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELİF ESİN TUNA
- Farklı kaynaklardan izole edilen aktinomisetlerden ekstraselüler pigment karakterizasyonu ve bazı biyofonksiyonel özelliklerin incelenmesi
Characterization of extracellular pigments from actinomycetes isolated from different sources and investigation of some biofunctional properties
MEHMET ONUR KARTAL
Doktora
Türkçe
2025
MikrobiyolojiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MELİKE BARAN EKİNCİ
- Biosynthesis of pigment by bacteria isolated from antarctica
Antarktika'dan izole edilen bakterilerden pigment biyosentezi
GÜLDEN AÇIL
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiKutup Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. FATMA ELİF GENCELİ GÜNER
- Deniz kaynaklı streptomyces türlerinden yeni antimikrobiyal ve antiproliferatif bileşiklerin araştırılması
Investigation of novel antimicrobial and antiproliferative compounds from marine streptomyces species
ELİF COŞKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Eczacılık ve FarmakolojiTrakya ÜniversitesiTemel Eczacılık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM DEMİRKIRAN
- Aktinomiset genomlarında yeni glikopeptid bileşiklerin genetik olarak taranması
Screening of novel glycopeptide compounds in actinomycetes genomes by using genetic tools
MEHMET ALİ ÖZCAN