Mikroglial aktivasyonda lipopolisakkarit uyarımıyla ekspresyonu değişen mikroRNA'ların belirlenmesi
Characterization of deregulated microRNA in microgliai activation by endotoxin stimulation
- Tez No: 304491
- Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL KÜRŞAD GENÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Nöroloji, Biology, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Lipopolisakkaritler, Makrofaj aktivasyonu, Makrofajlar, Merkez sinir sistemi hastalıkları, RNA, Lipopolysaccharides, Macrophage activation, Macrophages, Central nervous system diseases, RNA
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Temel Sinirbilimler Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mikroglial hücreler, merkezi sinir sisteminin (MSS) hematopoetik kökenli yerel makrofajları olarak görev yapmaktadırlar. MSS'nde, pek çok nörodejeneratif hastalığın patogenezinde mikroglial aktivasyonla indüklenen inflamasyon yer almaktadır. MikroRNAlar (miRNA) post-transkripsiyonel regülasyon mekanizmalarında rol alan kodlanmayan küçük RNA'lardır. Bu çalışmamızda, MSS'nde inflamasyon ile ilişkili miRNA'ların ve hedeflerinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Çalışmada N9 fare mikroglia ve 293T insan embriyonik böbrek hücre hatları kullanılmıştır. Deneylerde 10-1000 ng/ml Lipopolisakkarid (LPS) dozlarında N9 hücreleri inkübe edildi. Ön çalışmada 100 ng/ml LPS dozu kullanılarak miRNA ekspresyon değişimleri mikroarray yöntemiyle belirlendi. Mikroarray analizinde ekspresyonu değişen miRNA'lardan miR-125b-3p, miR-132, miR-146a ve miR-155'in ekspresyon değişiklikleri kantitatif PCR (qPCR) yöntemiyle incelendi. Ekspresyon değişikliği doğrulanan miRNA'ların hedef genleri biyoinformatik analizle belirlendi. Lusiferaz testi ile hedef genler için validasyon deneyleri yapıldı.Yapılan mikroarray analizinde en fazla ekspresyon değişimi gösteren 30 tane miRNA belirlendi. qPCR analizinde miR-125b-3p ekspresyonunun azaldığı, miR-146a ve miR-155'in ekspresyonun arttığı gösterildi. Hedef validasyonu deneyleri ile biyoinformatik araçlarla belirlenen hedef genler (TNF-?, IL-1ß, IL-6, IRAK1, TRAF6 ve MyD88) doğrulandı.Bu çalışmanın sonucunda mikroglial aktivasyonla ilişkili miRNA'lar karakterize edilmiştir. Bu miRNA'lardan miR-125b'nin TNF-? ve IL-1ß'yı, miR-132'nin IL-6'yı, miR-146a'nın IRAK1 ve TRAF6'yı ve miR-155'in MyD88'i hedeflediği gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Microglial cells are the hematopoietic originated immune cells of the central nervous system (CNS). They are resident macrophages of CNS. In CNS, they play a role in inflammation mechanism of most neurodegenerative diseases. MicroRNAs (miRNAs) are the non-coding small regulatory RNAs playing role in post-transcriptional regulation. In this study, neuro-inflammation related miRNAs and their targets were aimed to be determined.In this study, N9 murine microglial and 293T human embryonic kidney cell lines were used. In the experiment, N9 cells were treated with 10-1000ng/ml doses of Lipopolysaccharide (LPS). In preliminary study, by using 100 ng/ml LPS, miRNA expression changes were determined by microarray. Of microarray-characterized miRNAs, miR-125b-3p, miR-132, miR-146a and miR-155 were further analyzed by quantitative PCR (qPCR). Of verified miRNAs, miRNA target genes were determined by bioinformatic analysis and targetes were validated by luciferase assay.According to miRNA array analysis, 30 mostly changed miRNAs are detected. As a result of qPCR analyses, miR-125-3p expression was reduced while miR-146a and miR-155 expressions were increased. Target validation experiments verified the bioinformatically determined miRNA target genes (TNF-?, IL-1ß, IL-6, IRAK1, TRAF6 and MyD88).This study helped the characterization of the miRNAs related to microglial activation. Of these microRNAs, it was shown that miR-125b targets TNF-? and IL-1ß mRNAs, miR-132 targets IL-6 mRNA, miR-146a targets IRAK1 and TRAF6 mRNAs and miR-155 targets MyD88 mRNA.
Benzer Tezler
- Lipopolisakkarit ile indüklenen in vitro nöroinflamasyon modelinde sitikolinin mikroglial farklılaşma üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of citicoline on microglial differentiation in a lipopolysaccharide-induced in vitro neuroinflammation model
SEMANUR GÜNER
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Eczacılık ve FarmakolojiMarmara ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE KÜBRA ELÇİOĞLU
- Dimetil fumarat'ın mikroglial hücrelerde nlrp3 inflamazom aktivasyonu üzerine etkisi
The effects of dimethyl fumarate on nlrp3 inflammasome activation in microglial cells
BORA TAŞTAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiTemel Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERMİN GENÇ
- Etil piruvat'ın mikroglial hücrelerde NLRP3 inflamazom aktivasyonuna etkisi
The effects of ethyl pyruvate on NLRP3 inflammasome activation in microglial cells
İREM NUR GÖKBAYRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
NörolojiDokuz Eylül ÜniversitesiSinir Bilimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERMİN GENÇ
- Arı ekmeğinin mikroglia hücre hatlarındaki sitotoksik, genotoksik, antigenotoksik ve nöroinflamatuar etkilerinin araştırılması
Investigation of the cytotoxic, genotoxic and neuroinflammatory effects of bee bread on microglia cell lines
FAYSAL YILMAZ
- Astroglial hücre kültüründe eritropoietin ve interlökin-1 B'nin NGF ve nitrik oksid üretimi üzerine in vitro etkileri
In vitro effects of erythropoietin and interleukin-1 beta on production of nitric oxide and NGF in astroglial cell culture
BAŞAK BİNGÖL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
BiyokimyaDokuz Eylül ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. FİLİZ KURALAY