Mathematical modeling of MMPs in cancer
Kanserdeki MMP?lerin matematiksel modellenmesi
- Tez No: 301693
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Fizik ve Fizik Mühendisliği, Onkoloji, Biophysics, Physics and Physics Engineering, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Anjiyogenez, Biyofizik, Ekstrasellüler matriks, Hücre dışı proteaz, Matematiksel modelleme, Neoplazmlar, Angiogenesis, Biophysics, Extracellular matrix, Extracellular protease, Mathematical modelling, Neoplasms
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Biyolojide, matematiksel modelleme gibi yeni yaklaşımlar, tümör gibi karmaşık biyolojik sistemler hakkındaki kapsamlı veri birikimini açıklamak için ortaya çıkmıştır. Yaklaşık elli yıldır araştırılan matematiksel tümör modelleri, temel biyoloji prensiplerini klinik ve deneysel verilerle birleştirerek, tümör gelişiminin dinamiklerini ve karakteristiklerini incelemeyi ve öngörüde bulunmayı amaçlamıştır. Kanser gelişimi esnasında, genetik ve mikro-ortamsal faktörler, karşılıklı olarak birbirini moleküler ölçekte etkilerler ve bu, doku ölçeğinde hastanın hayatını tehlikeye sokan bir davranışa neden olur. Moleküler ve doku ölçeğinde gerçekleşen olaylar çoğunlukla bilinmekle beraber, bu ikisinin arasındaki ilişkiyi, lineer mantıkla keşfetmek imkânsızdır. Bu olayların birbiriyle nasıl ilintilendiğinin keşfi, tedaviler için potansiyel hedefler görmemize ve mevcut tedavilerle deney yapmamıza yardımcı olur. Bu motivasyon sayesinde, bu tezde tümör gelişiminin matematiksel bir modelini oluşturduk. Sürekli modelleme yaklaşımını kullanarak tümör gelişimini, karışım teorisi çerçevesinde modelledik. Ekstra-selüler matris parçalayıcı enzimin aktivitesine, MMP'ye ve MMP'nin inhibisyonuna odaklandık. MMP inhibitörlerinin taşınmasını incelemek amacıyla, kanla taşınan kimyasalların ve diğer maddelerin aktivitesini simüle etmemize de yardımcı olabilecek bir dinamik damar ağı oluşturduk.
Özet (Çeviri)
New approaches like mathematical modeling appeared in biology to explain the accumulation of extensive data about complex biological systems like tumors. Mathematical models of tumors which have been studied for over 50 years, aimed to explore the dynamics and characteristics of tumor progression and to make predictions by combining the elementary principles of biology to clinical and experimental data. During cancer progression, genetical and microenvironmental factors mutually affect each other in molecular scales and, this results in a behavior in tissue scale which threatens the patients? life. What happens in molecular and tissue scales, are mostly known, but the relation between these two is impossible to discover with linear thinking. The discovery of how these events are linked, helps us to see the potential targets for treatments and to experiment on current treatments. With this motivation, we build a mathematical model of tumor growth in this thesis. We used continuous modeling approach and model the tumor progression within the framework of mixture theory. We focused on the activity of matrix degrading enzyme, MMP and its inhibition. In order to study delivery of MMP inhibitors, we set up a structure for a dynamic vessel web which also can help us to simulate activities of other substances and chemicals delivered by blood.
Benzer Tezler
- A mathematical model of drug delivery by modifying the tumor microenvironment:MMP activation
Tümör mikroçevresinin değiştirilmesi yoluyla ilaç iletiminin matematiksel modellemesi: MMP aktivasyonu
DUYGU KABA
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
MatematikBoğaziçi ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURAK GÜREL
DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Unpacking teacher knowledge for bridging in- and out-of-school mathematics using mathematically-rich and contextually-realistic problems
Matematiksel açıdan zengin bağlamsal açıdan gerçekçi problemlerle okul içi ve dışında kullanılan matematik arasında köprü kurduracak öğretmen bilgisinin incelenmesi
ŞERİFE SEVİNÇ
Doktora
İngilizce
2016
Eğitim ve ÖğretimIndıana UnıversıtyEğitim Programları ve Öğretim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RICHARD LESH
- Mathematical modeling of in situ combustion process and development of a numerical model
Başlık çevirisi yok
SERAP KARAN(ÖZOĞLU)
Yüksek Lisans
İngilizce
1988
Petrol ve Doğal Gaz MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiYRD. DOÇ. DR. FARİBORZ RASHİDİ
- Mathematical modeling of the behavior of atmospheric fluidized bed combustors (AFBC's)
Başlık çevirisi yok
REZA ROOSTAAZAD
Yüksek Lisans
İngilizce
1990
Kimya MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN SELÇUK
- Mathematical modeling of three-dimensional coastal circulation and application to Marmaris Bay
Başlık çevirisi yok
FARHOOD MASHROUTECHİ