Acınetobacter baumannıı'nin klinik izolatlarının çoklu ilaç direncinde AdeABC aktif pompasının rolü
The role of AdeABC efflux pump in multi-drug resistance acinobacter baumannsi clinical isolates
- Tez No: 247659
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, çoklu ilaç direnci, aktif pompa, AdeABC, NMP, PAßN, Acinetobacter baumannii, çoklu ilaç direnci, aktif pompa, AdeABC, NMP, PAßN
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Acinetobacter baumanii, özellikle yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda, ciddi, hayatı tehdit eden enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Çoklu ilaç direnci gösteren A. baumanii izolatlarının sayısının giderek artışı böyle dirençli izolatların neden olduğu enfeksiyonların tedavisine yaklaşımda ciddi sorunlar yaratmaktadır. Son yıllarda yapılan çalışmalar bu mikroorganizmanın çoklu ilaç direncinde, `resistance-nodulation-division' RND tipi bir aktif ilaç pompa sisteminin, AdeABC'nin, etkin rol oynadığına dikkat çekmektedir. Bu çalışmada biz 2008 yılı boyunca hastanemizde izole edilen 14 A. baumanii izolatının çoklu ilaç direncinde bu pompa sisteminin etkinliğini araştırmayı hedefledik. Bu amaçla, izolatlarda 6 antibiyotiğin (siprofloksasin, gentamisin, eritromisin, kloramfenikol, tetrasiklin, trimetoprim) minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK), RND tipi pompa inhibitörleri `phenylalanyl-arginyl-ß-naphtylamide' (PAßN) ve `1-(1-naphythylmethyl)-piperazine' (NMP) varlığında ve yokluğunda sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmış ve pompa inhibitörleri varlığında antibiyotik MİK'lerindeki değişimler kaydedilmiştir. Öte yandan, AdeABC çoklu ilaç direnç pompasının esas transport proteini olan AdeB'yi kodlayan adeB geninin transkripsiyon düzeyleri de izolatlarda RT-PCR'la araştırılmıştır. İzolatların 8'inde %57,1'inde ortamda aktif pompa inhibitörleri varlığında test edilen antibiyotiklerin MİK'lerinde 2-8 kat düşüş gözlenmiştir. Grup I olarak adlandırılan bu izolatlarda test edilen antibiyotiklerin MİK'lerinde NMP ortalama 3,74 katlık; PAßN ise ortalama 1,4 katlık düşüşe neden olmuştur. Bu bulgular izolatlarımızın önemli bir bölümünün çoklu ilaç direncinde, RND tipi bir aktif ilaç pompasının etkin rol oynadığını göstermektedir. Test ortamında NMP varlığı grup I izolatlardan 7 no.lu izolatta trimetoprim ve tetrasiklin MİK'lerinin duyarlılık sınır değerlerinin altına düşmesine neden olmuştur. Benzer şekilde 5 no.lu izolat için de sıvı mikrodilüsyon testinde ortamda NMP varlığı, siprofloksasin MİK'iniiiiorta hassas sınırına kadar çekmiştir. Bu saptamalar söz konusu izolatların adı geçen antibiyotiklere direncinden, esas olarak RND tipi bir aktif ilaç pompasının sorumlu olduğunu kuvvetle düşündürmektedir. Antibiyotik MİK'lerinde NMP'nin PAßN'e kıyasla daha belirgin düşüşlere yol açması, bu pompa inhibitörünün A.baumanii'de RND tipi aktif ilaç pompasının inhibisyonunda daha etkin olduğunu göstermektedir. Çalışmamızda kloramfenikol ve siprofloksasin, NMP ve PAßN'in MİK'lerinde en fazla düşüşe yol açtığı antibiyotikler olarak saptanmışlardır.İzolatlarımızın adeB transkripsiyon düzeylerinin saptandığı RT-PCR çalışması sonuçları, pompa inhibitörleri (özellikle NMP) varlığında yapılan sıvı mikrodilüsyon testlerinde antibiyotik MİK'lerinde belirgin düşüşlerin saptandığı grup I izolatların adeB transkripsiyon düzeylerinin (0,75-1,5); pompa inhibitörlerine duyarlı fenotip göstermeyen grup II izolatlarınkine (0,04-0,66) kıyasla belirgin olarak yüksek olduğunu ortaya koymuştur. RT-PCR çalışması ayrıca grup I izolatların önemli bir kısmının (5,7,9,13,14) adeB transkripsiyon düzeylerinin, AdeB proteinini yüksek düzeyde eksprese ettiği bilinen standart SBMox2 izolatından daha yüsek düzeyde transkribe ettiklerini göstermiştir.Tüm bu sonuçlar ışığında, A.baumannii izolatlarımızın çoklu ilaç direncine, RND tipi bir aktif pompanın, büyük olasılıkla da AdeABC pompasının, önemli katkıda bulunduğu kanısındayız.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumanii, özellikle yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda, ciddi, hayatı tehdit eden enfeksiyonlara neden olan fırsatçı bir patojendir. Çoklu ilaç direnci gösteren A. baumanii izolatlarının sayısının giderek artışı böyle dirençli izolatların neden olduğu enfeksiyonların tedavisine yaklaşımda ciddi sorunlar yaratmaktadır. Son yıllarda yapılan çalışmalar bu mikroorganizmanın çoklu ilaç direncinde, `resistance-nodulation-division? RND tipi bir aktif ilaç pompa sisteminin, AdeABC?nin, etkin rol oynadığına dikkat çekmektedir. Bu çalışmada biz 2008 yılı boyunca hastanemizde izole edilen 14 A. baumanii izolatının çoklu ilaç direncinde bu pompa sisteminin etkinliğini araştırmayı hedefledik. Bu amaçla, izolatlarda 6 antibiyotiğin (siprofloksasin, gentamisin, eritromisin, kloramfenikol, tetrasiklin, trimetoprim) minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK), RND tipi pompa inhibitörleri `phenylalanyl-arginyl-ß-naphtylamide? (PAßN) ve `1-(1-naphythylmethyl)-piperazine? (NMP) varlığında ve yokluğunda sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmış ve pompa inhibitörleri varlığında antibiyotik MİK?lerindeki değişimler kaydedilmiştir. Öte yandan, AdeABC çoklu ilaç direnç pompasının esas transport proteini olan AdeB?yi kodlayan adeB geninin transkripsiyon düzeyleri de izolatlarda RT-PCR?la araştırılmıştır. İzolatların 8?inde %57,1?inde ortamda aktif pompa inhibitörleri varlığında test edilen antibiyotiklerin MİK?lerinde 2-8 kat düşüş gözlenmiştir. Grup I olarak adlandırılan bu izolatlarda test edilen antibiyotiklerin MİK?lerinde NMP ortalama 3,74 katlık; PAßN ise ortalama 1,4 katlık düşüşe neden olmuştur. Bu bulgular izolatlarımızın önemli bir bölümünün çoklu ilaç direncinde, RND tipi bir aktif ilaç pompasının etkin rol oynadığını göstermektedir. Test ortamında NMP varlığı grup I izolatlardan 7 no.lu izolatta trimetoprim ve tetrasiklin MİK?lerinin duyarlılık sınır değerlerinin altına düşmesine neden olmuştur. Benzer şekilde 5 no.lu izolat için de sıvı mikrodilüsyon testinde ortamda NMP varlığı, siprofloksasin MİK?iniiiiorta hassas sınırına kadar çekmiştir. Bu saptamalar söz konusu izolatların adı geçen antibiyotiklere direncinden, esas olarak RND tipi bir aktif ilaç pompasının sorumlu olduğunu kuvvetle düşündürmektedir. Antibiyotik MİK?lerinde NMP?nin PAßN?e kıyasla daha belirgin düşüşlere yol açması, bu pompa inhibitörünün A.baumanii?de RND tipi aktif ilaç pompasının inhibisyonunda daha etkin olduğunu göstermektedir. Çalışmamızda kloramfenikol ve siprofloksasin, NMP ve PAßN?in MİK?lerinde en fazla düşüşe yol açtığı antibiyotikler olarak saptanmışlardır.İzolatlarımızın adeB transkripsiyon düzeylerinin saptandığı RT-PCR çalışması sonuçları, pompa inhibitörleri (özellikle NMP) varlığında yapılan sıvı mikrodilüsyon testlerinde antibiyotik MİK?lerinde belirgin düşüşlerin saptandığı grup I izolatların adeB transkripsiyon düzeylerinin (0,75-1,5); pompa inhibitörlerine duyarlı fenotip göstermeyen grup II izolatlarınkine (0,04-0,66) kıyasla belirgin olarak yüksek olduğunu ortaya koymuştur. RT-PCR çalışması ayrıca grup I izolatların önemli bir kısmının (5,7,9,13,14) adeB transkripsiyon düzeylerinin, AdeB proteinini yüksek düzeyde eksprese ettiği bilinen standart SBMox2 izolatından daha yüsek düzeyde transkribe ettiklerini göstermiştir.Tüm bu sonuçlar ışığında, A.baumannii izolatlarımızın çoklu ilaç direncine, RND tipi bir aktif pompanın, büyük olasılıkla da AdeABC pompasının, önemli katkıda bulunduğu kanısındayız.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen acinetobacter spp. suşlarında antibiyotik direnç profili ve yeni nesil antibiyotiklerin in-vitro etkinliklerinin araştırılması
Investigation of the antibiotic resistance profile and in-vitro effects of new generation antibiotics acinetobacter spp. strains i̇solated from clinical samples
YASEMİN BÖLÜKBAŞI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- Çok ilaca dirençli gram negatif ve gram pozitif bakterilerin direnç inhibisyonuna efluks pompa inhibitörlerinin etkilerinin in vitro araştırılması
In vitro investigation of the effects of the efflux pump inhibitors to the resistance inhibition of multidrug resistant gram negative and gram positive bacteria
EBRU ÇETİNKAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET YILMAZ ÇOBAN
- İnvaziv enfeksiyonlardan izole edilen çoklu ilaç dirençli asinetobakter suşlarında, direncin moleküler karakterizasyonu, suşlar arası klonal ilişkinin PFGE (Pulse field gel elektrophoresis) ve MLST (Multi locus sequencing typing ) ile karşılaştırılması
Molecular characterization resistance in MDR (Multi drug resistance) acinetobacter strains isolated from invasive infections, comparison of the relationship between strains with karakterizasyonu, suşlar arası klonal ilişkinin PFGE (Pulse field gel elektrophoresis) and MLST (Multi locus sequencing typing )
FERİDE AKIŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında bazı karbapenemazların genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of some carbapenemases by genotypic methods in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens
NİDA ÖZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiDicle ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. KADRİ GÜL
- Klinik kaynaklı acinetobacter baumannii izolatlarında patotip- rezistotip-genotip kümelenmesi varlığının araştırılması
Investigation of pathotype, resistotype and genotype clustering in acinetobacter baumannii isolates of clinical origin
İNCİ DENİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Moleküler TıpYeditepe ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM ÇAĞATAY ACUNER