Identification and characterization of a cDNA encoding zip transporter protein in Triticum dicoccoides
Yabani buğdayda, Triticum dicoccoides, zıp tasıyıcı proteini sentezleyen cDNA dizisinin tanımlanması ve karakterizasyonu
- Tez No: 223782
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HİKMET BUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyomühendislik, Biology, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2007
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yabani emmer buğdayı, ekilen buğday türlerinin verimini yükseltmek ve kalitesiniartırmak açısından potansiyel genetik zenginlik içermektedir. Çinko (Zn) eksikliği, buğdaydahem verimin hem de tane besin kalitesinin düsmesine yol açmaktadır. Bu çalısmada, altı farklıyabani buğday genotipi, Triticum dicoccoides, Zn stresine maruz bırakıldı ve yapılan seraçalısmaları Zn eksikliğine karsı verilen cevaplarda genotipler arası çesitlilik bulunduğunuortaya koydu. Yabani buğday genotiplerinin yanı sıra üç tane T. durum buğdayı (Balcalı 85,Ç-1252 , Meram) da referans bitki olmaları açısından bu çalısma içine alındı.Zn eksikliği stresinde, dayanıklılığa katkıda bulunan mekanizmalar henüz tam olarakbilinmemektedir. Fakat gün geçtikçe Zn eksikliğinde rol alan daha çok proteinbelirlenmektedir. Bu çalısmada, yabani buğdaylardaki ZIP proteininin tamamlanmıs DNA(cDNA) dizisi belirlenmis ve bu dizilerle kültüre alınmıs buğday genotiplerinin dizileriarasında önemli bir fark bulunmadığı gözlemlenmistir. Zn noksanlığına maruz bırakılanbitkilerin kök ve yesil aksamlarından elde edilen örneklerindeki ZIP ekpresyon seviyeleriQRT-PCR yöntemiyle ölçülmüstür. Elde edilen sonuçlara göre, tüm genotiplerde besiyerindeki Zn miktarı azaldıkça ZIP cDNA ekpresyon seviyesi artmıstır. Zn stresine endayanıklı olan genotip MM 5/4'ün kök hücrelerinde, Zn stresine en duyarlı genotiplerden biriolan 19-36'nın kök hücrelerine nazaran daha az ZIP ekspresyonu saptanmıstır. Bunun nedenibüyük olasılıkla, duyarlı genotipin, 19-36, kök hücrelerinin dayanıklı genotipin, MM 5/4, kökhücrelerine nazaran stresi daha çabuk hissedip daha çabuk ZIP seviyesini artırmayaçalısmasından kaynaklanmaktadır. Toksik Zn uygulamasında (10-4 M Zn) ZIP ekpresyonseviyesinin kontrol bitkisine kıyasla artmaması, bu çalısmada kullanılan yabani buğdaylardandizisi çıkarılan ZIP proteininin Zn'ye özel olabileceği olasılığını kuvvetlendirmektedir.
Özet (Çeviri)
Wild emmer wheats exhibit a potential genetic resource for wheat improvement andincreased food production. In this study, different accessions of wild emmer wheat, Triticumdicoccoides, were studied for their Zn deficiency tolerance which is particularly prevalent inwheat leading to significant reduction in yield and nutritional quality of grains. T.dicoccoides, selected from a screening study, were grown under Zn deficient conditions.Three T. durum wheats, Balcali 85, Ç-1252 and Meram, were also included in this study asstandard.Increasing data are being accumulated to identify proteins that are involved in Zndeficiency. Hence, ZIP family of metal transporter proteins are extensively being studied. Inthis study, identification of cDNA encoding ZIP transporter protein in wild emmer wheat wasstudied. The result revealed that cDNA does not have high level of polymorphism comparedto cultivated wheats. The expression of identified ZIP transcript was measured using root andshoot of plants subjected to Zn deficiency. Quantitative Real-time PCR results revealed thatZIP transcript levels are elevated with decreasing Zn supply in all accessions. ZIP transcriptaccumulation was lower in root of MM5/4 accession, which is the most tolerant accession toZn deficiency, than that of 19-36 accession, which is one of the most susceptible accessions.This is most likely because the susceptible genotype senses the Zn deficiency stress earlierthan the tolerant does so that the response of 19-36 root cells are much quicker than theresponse of MM 5/4 root cells. The low level expression and the absence of ZIP transcript at10-4 M Zn concentration suggested that this ZIP metal transporter found in these accessionswas Zn-specific.
Benzer Tezler
- Identification and characterization of chicken neuronal p80 katanin
Tavuk nöronal p80 kataninin tanımlanması ve karakterizasyonu
AYŞEGÜL YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Structure prediction A. thaliana G protein alpha subunit using bioinformatics tools based on sequence alignments
Dizi eşleşmelerine bağlı biyoinformatik araçlar kullanılarak A. thaliana G protein alfa alt biriminin yapısının belirlenmesi
MERT ŞAHİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
BiyolojiSabancı ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEHRA SAYERS
YRD. DOÇ. DR. UĞUR SEZERMAN
- Kalkopirit flotasyonunda bakteriyel şartlandırmanın mineral yüzeyine etkileri
Effect of bacterial conditioning on mineral surface in chalcopyrite flotation
H. MUSTAFA TARHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Maden Mühendisliği ve Madencilikİstanbul Teknik ÜniversitesiCevher-Kömür Hazırlama ve Değerlendirme Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. A. EKREM YÜCE
- Molecular analysis of B-thalassemia and hemoglobin S by“The B-globin strip assay”A Novel diagnostic approach
B-talasemi ve hemoglobin S'nin“B-globin strıp assay”ile moleküler analizi: Yeni bir tanı yöntemi
ONUR BİLENOĞLU
- Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemilerinde TEL-AML1 (Translocation Ets Leukemia-Acute Myeloid Leukemia 1) füzyon geni tespiti ve prognostik önemi
The Detection of TEL-AML1 fusion gene and it is prognostic significance in childhood acute lymphoblastic leukemia
SEMA SIRMA