Van ilindeki kliniklerden izole edilen staphylococcus aureus izolatlarının fenotipik özellikleri, plazmit dna ve protein profillerine göre karakterizasyonu
Characterization of staphylococcus aureus isolates isolated from clinical sources in Van according to phenotypic properties, plasmid dna and protein profiles
- Tez No: 213632
- Danışmanlar: Y.DOÇ. İSMET BERBER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Biology, Microbiology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Karakterizasyon, PAGE, Plazmit, Protein Profilleri, S. aureus, Plazmitler, Protein profili, Staphylococcus aureus, Characterization, PAGE, Plasmid, Protein Profiles, S. aureus, Plasmids, Protein profile, Staphylococcus aureus
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalısmada, 41 adet Staphylococcus aureus susu; fenotipik özellikleri, plazmit DNA ve 2 farklı poliakrilamid jel elektroforez (SDS-PAGE) yöntemi kullanılarak elde edilen protein profillerine göre karakterize edilmistir. Morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal özelliklerine göre, bütün susların S. aureus türüne ait oldukları belirlenmistir. Antibiyogram sonuçları test edilen susların en az iki antibiyotige dirençli oldugunu, fakat vankomisin antibiyotigine duyarlı olduklarını göstermistir. Bütün ırkların plazmit profillerini belirlemek için agaroz jel elektroforez metodu kullanılmıstır. Agaroz jel elektroforez sonuçlarına göre, susların tek plazmit içerdigi belirlenmistir. SDS-PAGE tekniginin kullanıldıgı nümerik analiz sonuçları; toplam hücre protein profilleri esas alındıgında benzerlik düzeyi %45.84'ün üzerinde 2 farklı grup ve hücre dısı protein profilleri esas alındıgında ise benzerlik seviyesi %68.81'in üzerinde 4 farklı grup olustugunu ortaya koymustur. Diger taraftan, Native-PAGE tekniginin kullanıldıgı nümerik analiz sonuçları; toplam hücre protein profilleri esas alındıgında benzerlik düzeyi %53.51'in üzerinde 3 farklı grup ve hücre dısı protein profilleri esas alındıgında ise benzerlik seviyesi %62.90'ın üstünde 2 farklı grup olustugunu ortaya koymustur. Arastırma SDS-PAGE yöntemiyle elde edilen toplam hücre ve hücre dısı protein profillerinin test edilen S. aureus suslarının taksonomik iliskilerinin incelenmesinde etkili bir yaklasım saglamadıgını göstermistir. Buna karsın, Native-PAGE yöntemiyle elde edilen toplam hücre ve hücre dısı protein profillerinin ise susların ayrımında daha faydalı oldugu belirlenmistir.
Özet (Çeviri)
In the present study, 41 Staphylococcus aureus strains were characterized according to phenotypic properties, plasmid DNA and protein profiles obtained from using two different polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) methods. According to the morphological, physiological and biochemical characteristics, all strains were consisted of S. aureus species. The antibiogram results indicated that all tested strains were resisted against at least two antibiotics, but susceptible to vancomycin. Agarose gel electrophoresis was employed to determine plasmid profiles. The agarose gel electrophoresis results confirmed that all strains consisted of only one plasmid. The numerical analysis of SDS-PAGE technique based on whole-cell protein patterns results revealed 2 distinct groups with a similarity level of above 45.84%. The extracellular protein pattern results revealed 4 distinct groups with a similarity level of above 68.81%. Afterwards, in the Native-PAGE technique, while whole-cell protein pattern results revealed 3 distinct groups with a similarity level of above 53.51%, the extracellular protein pattern results revealed 2 distinct groups with a similarity level of above 62.90%. The research indicated that whole-cell and extracellular protein profiles obtained by SDS-PAGE did not provide an effective approach to the investigation of taxonomic relationship within the tested S. aureus strains. On the other hand, it determined that whole-cell and extracellular protein profiles obtained by Native-PAGE were more suitable ror discrimination of the tested strains.
Benzer Tezler
- Van ilindeki lise birinci sınıflarda cinsiyet farklılığının matematik başarısı üzerindeki etkisinin araştırılması
Research of affect of gender difference on mathematics achievement in first of grade high school in Van
ADEM DURU
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
MatematikYüzüncü Yıl ÜniversitesiMatematik Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EKREM SAVAŞ
- Van ilindeki kanser hastaları populasyonunun büyüklüğünün tahmini
Estimation of population size of canser patients in Van city
CELALEDDİN ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZoolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF.DR. LEVENT TÜRKMUT
- Van ilindeki tarıma dayalı sanayi işletmelerinin çalışma alanları, sosyo-ekonomik yapıları ve kapasite kullanım durumları
The fields of occupation, socio-economic structures and capacity use of agribusiness firms in Van province
FATİH ULAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatYüzüncü Yıl ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. CENGİZ ÇAKIR
- Van ilindeki tarım üreticilerinin örgütlenmeye bakışı ve örgütlenmeye ilişkin sorunları
The approach of agricultural producers to organization in the province of Van and their diffuculties related to organization
MUSTAFA TERİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
ZiraatYüzüncü Yıl ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HACER ÇELİK ATEŞ
- Van ilindeki un fabrikalarının mevcut durumu ve üretilen unların bazı kalitatif özellikleri
The state of flour mills in Van province and some qualitative properties of the obtained flours
DİDAR MİRAHMETOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Besin Hijyeni ve TeknolojisiYüzüncü Yıl ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. İSMAİL SAİT DOĞAN