Adana ve Mersin illerinde domates lekeli solgunluk virüsü (tomato spotted wilt virus, TSWV)'nin değişik yöntemlerle saptanması
Detection of tomato spotted wilt virus (TSWV) in adana and Mersin provinces using different methods
- Tez No: 183550
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBROĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: TSWV, ELISA, Survey, Mekanik İnokulasyon, RT-PCR, Bitki virüsleri, Domates, Domates lekeli solgunluk virüsü, Lycopersicon esculentum, TSWV, ELISA, Survey, Mechanical Inoculation, RT- PCR, Plant viruses, Tomato, Tomato spotted wilt virus, Lycopersicon esculentum
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Adana ve Mersin illerinde yetiştirilen domates ve biberlerdezararlı Domates Lekeli Solgunluk Virüsü (Tomato Spotted Wilt Virus, TSWV)'ninsaflaştırılması, biyolojik, serolojik ve moleküler yöntemler kullanılarak tanısınınyapılması amacıyla 2005-2006 yılları arasında yürütülmüştür.Araziden toplanan virüslü olduğundan şüphelenilen bitkiler, öncelikle ELISAyöntemi ile testlenmiş ve hastalık oranı % 45.4 olarak hesaplanmıştır. TSWV ileinfekteli olan örnekler kodlanarak, mekanik inokulasyon çalışmalarındakullanılmıştır.E8, D2, M5 kodlu izolatlar ile aşılı bitkilerde 5-15 gün içerisinde simptomgözlenmiş, bununla birlikte T1 izolatı ise, 30-60 gün gibi bir sürede simptom çıkışınaneden olmuştur.SDS-PAGE'de virüse ait bir protein band gözlenmiş ve molekül ağırlığı 27kDa olarak saptanmıştır.TSWV, santrifüjleme yöntemi kullanılarak yarı saflaştırılmış, PEG çöktürmeve kolon kromotogrofisi yöntemleri başarılı olmamıştır.TSWV virionları saflaştırılmış ve SDS-PAGE'de dört band, agarose jelelektroforez'de ise tek band gözlenmiştir.TSWV ile infekteli test bitkilerinden total RNA ekstraksiyonu yapılmış vebunlar RT-PCR yönteminde kullanılmıştır. PCR ürünleri agarose jel elektroforez iletest edilmiş ve beklenen band büyüklükleri gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
The objectives of this study are purification and biological, serological andmolecular detection of TSWV in tomatos and peppers growing in Adana and Mersinprovinces between 2005 and 2006.Collected samples were firstly tested with ELISA and infection ratio wasdetermined as 45.4%. TSWV positives were coded and used for mechanicalinoculation. The symptoms were observed on E8, D2 and M5 isolates inoculated testplants in 5-15 days however, T1 inoculated ones showed in 1-2 months after TSWVinoculation.Only one protein of TSWV was observed in SDS-PAGE and molecularweight of it was estimated as 27 kDa.Centrifugation method was succesfully used for semi purification of TSWV.Column chromatography and PEG precipitation methods were not be successed forTSWV purification.TSWV virions were purified and four bands were obtained in SDS-PAGEand one band in agarose gel electrophoresis.Total RNA extraction was done from infected test plants and used for RT-PCR method. DNA bands were observed in respected sizes after the PCR productswere tested in agarose gel electrophoresis.
Benzer Tezler
- Domates bakteriyel solgunluk hastalığı etmeni [Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Smith) Davis et. al.]'nin tanılanması ve bitki büyüme düzenleyici rizobakteriler ile biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması
Domates bakteriyel solgunluk hastaliği etmeni [Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Smith) Davis et. al.]?nin tanilanmasi ve bitki büyüme düzenleyici rizobakteriler ile biyolojik mücadele olanaklarinin araştirilmasi
RAZİYE ÇETİNKAYA YILDIZ
- Hıyar mozaik virüsü (CMV)'nün kavun (CMV-K), domates (CMV-D), biber (CMV-B) izolatlarının biyolojik, serolojik, moleküler yöntemlerle karakterizasyonu ve satellit-RNA'lerin virüs üzerindeki etkisi
Characterization of melon (CMV-K), tomato (CMV-D), pepper (CMV-B) isolates of cucumber mosaic virus (CMV) by biological, serological, molecular methods and effect of satellite-RNAs on virus
BEHÇET KEMAL ÇAĞLAR
- Adana ve Mersin illerinde asma kısa doğum virüs hastalığının bağlarda ve virüs vektörü nematodlarda serolojik ve PCR yöntemleriyle belirlenmesi
The detection of grapevine fanleaf virus in grapevine and its vector nematodes using by serological and PCR methods in Adana and Mersin regions
GÜLCAN TARLA
- Çukurova bölgesi Adana ve Mersin illerinde süs bitkileri sektörünün bugünkü durumu ve gelişme olanaklarının araştırılması
The research of the present case and the progress possibility of the ornamental plants sector in Çukurova region in Adana and Mersin cities
GÜLAY TOKGÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Peyzaj MimarlığıÇukurova ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SEVİL ALTAN
- Mersin ve Adana illerindeki toplu besin üretimi yapan bazı yemek fabrikalarının hijyen ve sanitasyon uygulamalarının incelenmesi
Evaluation of hygiene and sanitation practices of some catering factories in Mersin and Adana cities
FİLİZ YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Gıda MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. CAHİDE YAĞMUR