Farklı gıdalardan izole edilen laktik asit bakterilerinin nümerik taksonomisi
Numerical taxonomy of lactic acid bacteria isolated from different food
- Tez No: 179461
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET HİLMİ ÇON
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Gıda Mühendisliği, Microbiology, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Laktik Asit Bakterisi, Nümerik Taksonomi, Dendogram, Starter Kültür, Probiyotik, Lactic Acid Bacteria, Numerical Taxonomy, Dendrogram, Starter Culture, Probiotic
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Pamukkale Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Arastırmada Lactobacillaceae familyasının üyelerinin geleneksel olarak uygulanan karbonhidrat fermantasyon testleri ile yapılan tanımlanmalarında karsılasılan yetersizlik ve süpheli durumların nümerik taksonomi ile asılması amaçlanmıstır. Bakteriyal izolatların tanımlanmasında morfolojik, metabolik ve fizyolojik karakterlerin, standart tip suslar (izolatlar) ile birlikte belirlenip nümerik taksonomi esasları dahilinde degerlendirilerek homojen gruplar halinde sınıflandırılmaları ve teknolojik özelliklerin tanımlanmaları gerçeklestirilmistir. Arastırmada peynir, tursu, sucuk, eksi hamur gibi farklı gıdalardan elde edilen 32 izolat, 10 tip örnegi ve rastgele seçilen 7 duplike izolat karbonhidrat fermantasyon, agır metallere dayanıklılık, antibiyotiklere duyarlılık, biyokimyasal testler (Farklı sıcaklık, tuz, pH, ox-bile katkılarında gelisebilme, arginin hidroliz ve -Galaktosidaz aktivitesi, Gram boyama) baslıkları altında denemeye tabi tutulmustur. Testler sonucunda elde edilen veriler X-Taxon Programı kullanılmak suretiyle +/- olarak kaydedilmistir. Duplike izolatların da dahil oldugu veri tabanındaki +/- sonuçlar 1/0 formatına dönüstürüldükten sonra NTSys-pc istatiksel bilgisayar destekli paket program kullanılarak analizler yapılmıstır. Nümerik taksonomi sonucu izolatların SSM-UPGMA analizine göre aralarındaki benzerlik iliskisine göre dendogramları olusturulmustur. Nümerik taksonomiye göre izolatlar 7 üyeli (benzerlik %89.4), 15 üyeli (benzerlik %89.4) ve 3 üyeli (benzerlik %90.7) olmak üzere 3 adet çok üyeli, 15 adet de tek üyeli kümeye ayrılmıstır. 3 çok üyeli kümenin birbiri ile benzerligi %80'dir. Bu degerler nümerik taksonomi degerlendirme kriterlerine göre taksonomik yapının iyi sonuçlandıgını göstermektedir. Arastırmada izolatların starter kültür üretimi ve probiyotik özellik açısından büyük önem tasıyan bazı endüstriyel karakterleri de belirlenmistir. Arastırmada kullanılan izolatların pH degerleri 7. gün için 3.30-4.41 pH arasında ve ortalama 3.86 pH, asitlik dereceleri %1.07-2.47 arasında ve ortalama %1.79 olarak bulunmustur. zolatların hidrofobisite degerleri %0-50.82 arasında saptanmıstır. zolatlardan L.plantarum ve P.pentosaceus'lar yüksek tuz ve safra tuzuna dayanıklılık, 3.5 ve 9.6 pH'da gelisebilme açısından daha toleranslı bulunurken; izolatların tamamı genellikle antimikrobiyal aktivite gösterme, gastrik suya, agır metallere, antibiyotiklere ve H2O2'ye dayanıklılık, -Galaktosidaz aktivitesi ve proteolitik aktivite gösterme ve %10-12 alkolde gelisme açısından starter kültür için aranan degerlere sahip bulunmuslardır. zolatların plazmid DNA profilleri de 0-8 plazmid aralıgında bulunmustur. Tüm bu veriler izolatların endüstriyel açıdan önemli özelliklere sahip olduklarını, starter ve probiyotik kültür olarak potansiyel tasıdıklarını göstermektedir.
Özet (Çeviri)
In the research, numeric taxonomic study has been aimed at overcoming insufficiency and uncertain conditions which were encountered in the identification of members of the family Lactobacillaceae with classical tests of carbohydrate fermentation. In the identification of bacterial isolates, it was performed that morphological, metabolic and physiological characters were classified in homogeneous groups and their technological properties were characterized by specifying them with standard type of strains (isolates) and evaluating within the bases of numeric taxonomic study. In the research, 32 isolates derived from different foods like cheese, pickle, sausage and sourdough; 10 specimens of them and the system of randomly selected 7 duplicate isolates carbohydrate fermentation tests have been subjected to the tests like endurance to heavy metals, sensitivity to antibiotics, biochemical tests (maturing at different temperature, salt, pH, ox-bile additives, activity of hydrolysis of arginine and - Galactosidase, Gram straining). Data collected from the tests were recorded as +/- using X-Taxon Program. After converting +/- results in the database, including duplicate isolates, into 1/0 format, analysis of data was performed by using NTSys-pc statistical computer-aided program. After numeric taxonomic study, by SSM-UPGMA analysis, dendrograms of the isolates were generated according to the similarities among them. According to numeric taxonomy, the isolates, having 7 members (similarity is 89.4%), 15 members (similarity is 89.4%) and 3 members (similarity is 90.7%) were seperated into groups of 3 multi-members and 15 single members. The similarity of the three groups is 80%. These values show that taxonomic structure led to a good result according to taxonomy valuation criterion. In the research, some industrial characters of the isolates, which were of vital importance in starter culture production and probiotic property, were specified as well. pH values of the isolates used in the research were found between 3.30-4.41 pH for the 7th day, 3.86 pH on average; and acidity degrees of which were found between 1.07- 2.47%, 1.79% on average. Hydrophobicity values of the isolates used in the research were determined between 0-50.82%. L.plantarum and P.pentosaceus isolates were found more tolerant in endurance to high salt, bile salt and maturation at 3.5 and 9.6 pH; all the isolates were generally found to have required values for starter culture in antimicrobial activity, endurance to gastric water, heavy metals, antibiotics and H2O2, showing -Galactosidase activity, proteolytic activity and maturing in 10-12% alcohol. Plasmid DNA profiles of the isolates were determined within the plasmid interval of 0- 8 . All these data show us that the isolates have industrially important characteristics and also have potentials as starter and probiotic culture.
Benzer Tezler
- Hücre duvarı protein profillleri ve pilazmid içeriklerine göre laktik asit bakterilerinin moleküler tanısı
Molecular identification of lactic acid bacteria based on their cell wall protein profiles and plasmid contents
FADİME KIRAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU
- Laktik asit bakterilerinin sakkaroz parçalanma aktivitelerinin bozada incelenmesi
Examination of saccharose degrading activity of lactic acid bacteria in boza
BANU BAYRAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK HEPERKAN
- Isolation and molecular characterization of lactic acid bacteria from raw milk
Çiğ sütten laktik asit bakterilerinin izolasyonu ve moleküler karakterizasyonu
ALİ EMRAH ÇETİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. HATİCE GÜNEŞ
PROF.DR. ŞEBNEM HARSA
Y.DOÇ.DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA
- Süt ve süt ürünlerinden probiyotik bakterilerinin izolasyonu ve tanımlanması
Isolation and identification of probiotic bacteria in milk and milk products
TÜLAY YİĞİT
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
MikrobiyolojiAnadolu ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERİH KIVANÇ
- Kuru incirlerde küf florası ve aflatoksigenik küflerin saptanması
Başlık çevirisi yok
SİBEL BÜYÜKŞİRİN