Detection and enumeration of acetoclastic methanogens in anaerobic bioreactors by quantitative fluorescent in situ hybridisation technique
Anaerobik biyoreaktörlerdeki asetoklastik metanojenlerin kantitatif floresanlı yerinde hibritleşme tekniği ile saptanması ve sayımı
- Tez No: 172089
- Danışmanlar: DOÇ.DR. EMİNE UBAY ÇOKGÖR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Çevre Mühendisliği, Environmental Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ANAEROBİK BİYOREAKTÖRLERDEKİ ASETOKLASTİK METANOJENLERİN KANTİTATİF FLORESANLI YERİNDE H İBRİTLEŞME TEKNİĞİ İLE SAPTANMASI VE SAYIMI ÖZET Floresanlı yerinde hibritleşme tekniği, 16S rRNA hedefti oligonukleotid problar ile Hexham Kanalizasyon Arıtım İşlerindeki (Birleşik Krallık) tam ölçekli konvensiyonel anaerobik biyoreaktörden ve mezofilik Hexham çamuru ile inokule edilmiş laboratuvar ölçekli anaerobik membran biyoreaktörden alman örneklerdeki milffoorganizmalann saptanması ve sayımı için kullanılmıştır. Her iki örnek; bakteri, arke ve asetoklastik metanojenlere spesifik floresanlı oligonukleotid problar ile hibritlenmiştir. İstatistiksel analiz için yerinde hibritleşme ve konfokal lazer tarama mikroskobisi kombine edilerek spesifik hücre sayımlan yapılmıştır. Kantitatif FISH prosedürünün sonuçlan, tam ölçekli anaerobik reaktörden alman örnek için, Methanoseate ve Methanosarcina konsantrasyon değerlerinin birbirine çok yakın olduğunu göstermiştir. Laboratuvar ölçekli reaktör örneği için ise Methanoseate konsantrasyonu, Methanosarcina konsantrasyonundan çok daha yüksektir. Bunun yanında, her iki örnek içinde arkeal hücre konsantrasyonun, bakteriyel hücre konsantrasyonundan daha yüksek olduğu belirlenmiştir. Analitik sürecin sonuçlan, bu çalışmadaki her bir örnek için yürütülen üç farklı dual hibritleşmede de arkeal hücre değişkenlilerinin homojen olduğunu göstermiştir. Aynca, dağılım tipleri Archaea, Methanoseate ve Eubacteria için poisson dağılım; Methanoarcina için ise negatif binominal dağılım olarak belirlenmiştir. Aynca, i) sıklık dağılım eğrileri çizilerek, ii) Anderson-Darling testleriyle normalite kontrol edilerek, iii) Box-cox çizimlerine göre normal dağılım için gerekli olan hücre konsantrasyonu dönüşümleri yapılarak ve iv) değişkenlik analizi kullanılarak; tam ve laboratuvar ölçekli anaerobik reaktörlerden alman örneklerin istatistiksel açıdan birbirlerinden farklı olduklan belirlenmiştir. xıı
Özet (Çeviri)
DETECTION AND ENUMERATION OF ACETOCLASTIC METHANOGENS IN ANAEROBIC BIOREACTORS BY QUANTITATIVE FLUORESCENT IN SITU HYBRTOISATION TECHNIQUE SUMMARY The fluorescent in situ hybridisation technique with 16S rRNA targeted oligonucleotide probes was used to detect and enumerate the microorganisms in the samples taken from a full-scale conventional single stage anerobic digester at Hexham Sewage Treatment Works (United Kingdom) and a lab-scale anaerobic membrane bioreactor that had been seeded with the mesophilic Hexham sludge. Each sample was hybridised with fluorescent oligonucleotide probes for Bacteria, Archaea and the defined group of methanogens namely, acetoclastic methanogens. Specific cell counts were determined by a combination of in situ hybridization and confocal laser scanning microscopy for statistical analysis. The results of quantitative fluorescent in situ hybridisation (FISH) procedure indicated that the concentration values of Methanoseate and Methanosarcina are very close to each other for the sample taken from full-scale anaerobic digester. Besides, Methanoseate concentration is much higher than Methanosarcina concentration in the sample of lab-scale anaerobic membrane bioreactor. In addition, it has been determined that the archaeal cell concentrations are higher than the eubacterial cell concentrations for both of the samples. The outcomes of analytical process showed that the variances of archaeal cells are homogenous for three dual hybridisations carried out for each sample in this study. Furthermore, the distribution types were determined as poisson distribution for Archaea, Methanoseate and Eubacteria and as negative binominal distribution for Methanosarcina, respectively. The statistical differences between the samples of the full-scale and the lab-scale anaerobic digesters were determined by means of i) plotting frequency distribution curves, ii) checking the normality with Anderson- Darling tests, in)transforming the cell concentration for normal distribution according to the Box-Cox plots and iv) using one-way ANOVA (analysis of variance). XI
Benzer Tezler
- İzmir'de piyasada açıkta satışa sunulan çeşitli gıdaların Staphylococcus aureus'un toksinleri açısından incelenmesi
Searching toxins of Staphylococcus aureus on various foods sold open in İzmir
FATMA ÖS
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL KARABOZ
- İzmir'de çeşitli marketlerde satışa sunulan tavuk ve hindi etlerinde Staphylococcus aureus aranması, sayımı ve tanımlanması
Detection enumeration and identification of Staphylococcus aureus in chicken and turkey meat sold in various market in İzmir
ALİ KOÇYİĞİT
- Sivas yöresindeki bazı kuyu sularında koliform bakteri araştırılması ve soyutlanan Escherichia coli kökenlerinin antibiyotiklere direnci
Detection of coliform bacteria in well water in Sivas and antibiotic resistance of isolated escherichia coli strains
SAADET DEMİRTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAHYA HAKGÜDENER
- Çeşitli kuru gıdalarda bacillus cereus aranması, sayımı ve identifikasyonu
Detection, enumeraton and identification of bacillus cereus in various dried foods
FİLİZ KARAOĞLU AYTAN
- Peynirlerde E.Coli sayımında kullanılan bazı yöntemlerin karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
ALKAR OĞUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNNUR TUNÇEL