Türkiye'deki yerli sığır ırklarının mikrosatellit DNA markırlarla genetik karakterizasyonu
The genetic characterization of Turkish native cattle breeds using micrisatellite DNA markers
- Tez No: 169975
- Danışmanlar: PROF.DR. NUMAN ÖZCAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Zooloji, Zoology
- Anahtar Kelimeler: Mikrosatellit, genetik karakterizasyon, Türk yerli sığır ırkları, soyağacı, F-istatistiği, Microsatellite, genetic characterization, Turkish native cattle breeds, phylogeny, F-statistics II
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
oz DOKTORA TEZİ TÜRKİYE'DEKİ YERLİ SIĞIR IRKLARININ MİKROSATELLİT DNA MARKTRLARLA GENETİK KARAKTERİZASYONU Adem ALTINALAN ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ZOOTEKNİ ANABİLİM DALI Danışman : Prof. Dr. Numan ÖZCAN Yıl : 2005, Sayfa: 175 Jüri :Prof Dr. Numan ÖZCAN Prof. Dr. Kemal ÖZKÜTÜK Prof. Dr. Mehmet TOPAKTAŞ Prof. Dr. Yüksel BEK Prof. Dr. Zeynel CEBECİ Bu çalışmanın amacı, sığıra özel 26 adet mikrosatellit markın kullanarak, dört Türk yerli sığır ırkı ve bir kültür sığır ırkı arasındaki genetik ilişkileri kurmak ve sahip oldukları genetik varyasyonu ortaya koymaktır. Bu nedenle Yerli Kara (YK), Boz Irk (BI), Güney Sarı-Kırmızısı Kilis (GSK) ve Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK) yerli sığırlar ile kültür sığır ırkı Siyah Alaca (SA) (kontrol) popülasyonlarından toplam 113 farklı DNA örneği popülasyon içi ve popülasyonlar arası genetik çeşitlilik indekslerini tahmin etmek üzere genotiplendirilmiştir. Ortalama allel sayılan YK'da 12.12, Bl'ta 13.27, GSK'da 11.65, DAK'ta 12.77 ve SA'da 11.04 olarak belirlenmiştir. Tüm lokuslar ve popülasyonlar için gözlenen ortalama heterozigotluk ile genetik çeşitlilik düzeyleri, sırasıyla 0,45(±0,26) ve 0,87(±0,059) olarak hesaplanmıştır. Ortalama akrabalı yetiştirme katsayısı (Fıs) ve standart hatası da Jackknife işlemi ile 0,497(±0,046) olarak belirlenmiştir. Mikrosatellit lokusları için Hardy- Weinberg dengesinden sapma heteroj enliği, ne lokuslar içi popülasyonlar arası, ne de popülasyon içi lokuslar arası bir farklılık göstermemiştir. Yaklaşık 5000'lik permütasyon testi ile elde edilen popülasyonlar arası standardize varyans değerleri (Fst) sıfırdan önemli bir şekilde farklı bulunmuştur (p<0,001). Komşu birleştirme soyağaçları ve faktöriyel birleştirme analizi ile Anadolu ırkları birlikte özgün küme oluşturmuşlardır. YK ve GSK ırkları birbirlerine yakın belirlenirken, SA ırkı ise BI ve DAK hariç diğer ırklardan oldukça farklı bir konumda yer almıştır. Irklar arasındaki genetik farklılıklar, kendi coğrafik ve tarihi geçmişleri ile uyumlu bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT PhD THESIS THE GENETIC CHARACTERIZATION OF TURKISH NATIVE CATTLE BREEDS USING MICRISATELLITE DNA MARKERS Adem ALTINALAN DEPARTMENT OF ANIMAL SCIENCE INSTITUTE OF NATURAL AND APPLIED SCIENCES ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ Supervisor : Prof. Dr. Numan ÖZCAN Year : 2005, Pages: 175 Jury : Prof. Dr. Numan ÖZCAN Prof. Dr. Kemal ÖZKÜTÜK Prof. Dr. Mehmet TOPAKTAŞ Prof. Dr. Yüksel BEK Prof. Dr. Zeynel CEBECİ The aim of the present study was to assess the genetic variation and establish the relationship among the four Turkish indigenous cattle breeds and one exotic breed using 26 bovine-specific microsatellite markers. A total 113 unrelated DNA samples from Anatolian Black (ABİ), Turkish Grey (TGy), South Anatolian Red Kilis (SARKi), East Anatolian Red (EAR) and Holstein (His) (control) breeds of cattle were genotyped to estimate within and between breed genetic diversity indices. The estimated mean allelic diversity was 12.12, 13.27, 11.65, 12.77, and 11.04 in ABİ, TGy, SARKi, EAR and His respectively. The average observed heterozygosity and gene diversity over all loci was 0,45(±0,26) and 0,87(±0,059) respectively. The average of inbreeding coefficient (Fıs) was also 0,497 Jackknifing over all loci. Heterogeneity of deviations from Hardy- Weinberg equilibrium for the microsatellites showed no differences for among loci within population as compared with among population within loci. All Fst values between pairs of breeds were significantly different from zero (p<0,001) after 5000 permutation test. Neighbour- Joining trees and FCA (Factorial Correspondence of Analysis) showed that Anatolian breeds tend to cluster together. ABİ and SARKi breeds were closely related, whereas the His was highly differentiated from all breeds except TGy and EAR breeds. The genetic differences among breeds were in accordance with their geographical and historical origuis.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yetiştirilen yerli ve kültür sığır ırklarının genetik yapılarının mikrosatelitler ile incelenmesi
An investigation on genetic structure of native and cultural cattle breeds in Turkey by using microsatellite markers
EMEL ÖZKAN
- The Design of a pedigree system for cattle
Sığırlar için bir soykütüğü veri tabanı tasarımı
ARİF HAKAN ŞINAR
- Ardışık kesirli reaktörler için maliyet analizi ve indeks geliştirilmesi
Cost analysis and ındex development for sequencıng batch reactors
GAMZE ERDİNÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CUMALİ KINACI
- Hayat mecmuası etrafında edebi faaliyetler (C-3)
Başlık çevirisi yok
SALİH BOYRAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Türk Dili ve EdebiyatıGazi ÜniversitesiTürk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELKIS GÜRSOY
- Demir çelik sektörü ve demir çelik sektöründe sermaye maliyeti
Iron and steel sector and cost of capital in iron and steel sector
ALİ DİKMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
İşletmeMarmara ÜniversitesiSermaye Piyasası ve Borsa Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MAHMUT HAYATİ ERİŞ
