Bilgisayar destekli rasyonel kemoterapötik etkili ilaç etken madde tasarım çalışmaları ve enzim saflaştırma
Computer aided drug desing studies on chemotherapeutically active compounds and enzyme purification
- Tez No: 149958
- Danışmanlar: PROF.DR. ESİN AKI ŞENER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Heterosiklik Bileşikler, KemoterapÖtik Etki, Kantitatif Yapı-Elki İlişkileri, Moleküler Modelleme, Enzim Saflaştırma 63, Heterocyclic Compounds, Chemo therapeutical Activity, Quantitative Structure Activity Relationships, Molecular Modeling, Enzyme Purification 64
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET Bilgisayar Destekli Rasyonel KemoterapÖtik Etkili İlaç Etken Madde Tasarım Çalışmaları ve Enzim Saflaştırma Ökaryotik topoizomeraz inhibitörleri olarak etki gösteren bir seri benzazol üzerinde PLS uyumlu Karşılaştırmalı Moleküler Alan Analizleri (CoMFA) ve Karşılaştırmalı Moleküler Benzerlik İndisleri Analizi (CoMSlA) teknikleri kullanılarak 3D-QSAR çalışmaları gerçekleştirilmiştir. 23 Bileşik kullanılarak yapılan bu çalışmada, QSAR modelleri 16 bileşiklik bir çalışma (training) serisi kullanılarak oluşturulmuştur. Oluşturulan QSAR modellerinin tahmin yeteneği 7 bileşiğin yer aldığı bir test serisinin yardımıyla değerlendirilmiştir, Bunlara ek olarak gerçekleştirilen farmakofor analizi çalışmasında Catalyst/HipHop (Accelrys Inc., 2004) programı İle 7 adet Topoizomeraz II inhibitörü bileşikten oluşan bir set üzerinden üç boyutlu farmakofor hipotezleri oluşturulmuştur. Yapılan çalışmalar sonucu; reseptörün yapısı yorumlanmış ve topoizomeraz II enzim inhibitörü yeni önder bileşiklerin tasarımlarında önerilecek moleküllerin yapılan belirlenmiştir. Ayrıca, bu çalışma kapsamında in vitro etki tayininde kullanılan topoizomeraz enziminin saflaştırma çalışmaları, sonikasyonu takiben DNaz muamelesi, Sephadex G50 kromatograflsi ve Heparin Sepharose kronıatografisi yöntemleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
SUMMARY Computer Aided Drug Design Studies on Chemotherapeutieally Active Compounds and Rnzyme Purification 3D-QSAR studies have been performed on a series of benzazolcs that act as eukaryotic topoisonierase II inhibitors, using Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) and Comparative Molecular Similarity Indices Analysis (CoMSIA) with partial least squares (PLS) fit. The studies were carried out using 23 compounds and the QSAR models were developed using a training set of 16 compounds. The predictive abilities of the QSAR models were assessed using a test set of 7 compounds. !n addition to these studies, three-dimensional pharmacophore hypotheses were built from a set of 7 topoisonierase II inhibitors using Catalyst/HipMop {Accelrys Inc., 2004) program. With the present study, the structure of the receptor has been characterized with molecular biological means, thus uncovering the essential molecular characteristics for new possible lead compounds with high activity. This work also includes the purification studies (with a method including homogenization followed by DNase treatment, Sephadex G50 and Heparins Sepharose column chromatography steps) of topoisonierase enzyme, which is being widely used for in vitro determination of inhibitory activity of new lead compounds.
Benzer Tezler
- Applications of computer methods to construction and site management
Bilgisayar metodlarının yapı işletmesi ve şantiye organizasyonuna uygulanması
ŞEFİK EMRE ULUKAN
- Matematik yazılım programlarının öğretimsel içeriğinin değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
SERKAN GÜR
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Eğitim ve ÖğretimMarmara ÜniversitesiTeknoloji Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERVET BAYRAM
- Bezier eğrileri, Bezier yüzeyleri ve Matlab ile sayısal algoritmalar
Bezier curves, Bezier surfaces and their numerical algorithms using Matlab
MUHSİN İNCESU
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
MatematikKaradeniz Teknik ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN GÜRSOY
- 3D synthetic human face modelling tool based on T-spline surfaces
T-spline yüzeyleri tabanlı 3 boyutlu sentetik insan yüzü modelleme aracı
ALİ AYDOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL LEBLEBİCİOĞLU
YRD. DOÇ. DR. İLKAY ULUSOY
- Bilgisayar destekli öğretim ortamlarında farklı bilişsel stillere sahip öğrencilerin öğrenme stratejilerini kullanma durumlarının akademik başarılarına etkisi
The effects of learning strategies´ use in computer assisted instruction (C.A.I.) environment, by students who have different cognitive styles on their academic achievement
BİLAL ATASOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Eğitim ve ÖğretimGazi ÜniversitesiBilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HALİL İBRAHİM YALIN