Differential display of wheat mRNA's for the detection of yellow rust disease resistance genes
Buğday mRNA'larının farklılık gösterimi ile sarı pas dirençlilik genlerinin saptanması
- Tez No: 119151
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MAHİNUR S. AKKAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: farklılık gösterim tekniği, buğday, san pas, hastalık dirençlilik genleri. vı, Bitki hastalıkları, Dirençlilik, RNA-haberci, Sarı pas hastalığı, Differential display (DD) technique, wheat, yellow rust, disease resistance genes IV, Plant diseases, Resistance, RNA-messenger, Yellow rust disease
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
öz BUĞDAY mRNALARININ FARKLILIK GÖSTERİMİ İLE SARI PAS DİRENÇLİLİK GENLERİNİN SAPTANMASI Bozkurt, Osman Yüksek Lisans, Biyoteknoloji Bölümü Tez yöneticisi: Doç.Dr.Mahinur S.Akkaya Ağustos 2002, 95 sayfa Buğday, dünya çapında yetiştirilen en önemli tahıllardan biridir. Fakat, modern bitki ıslahı çalışmalarının bir sonucu olarak genetik çeşitliliği azalmış ve hastalıklara karşı daha duyarlı bir hale gelmiştir. Puccinia striiformis'in sebep olduğu san pas, buğday için çok önemli bir hastalıktır. Türkiyede son 20 yıl boyunca buğday için en tahrip edici hastalık olmuştur. 100 den fazlasıtanımlanmış olan pas dirençlilik genlerinin hiç birisi bugüne kadar moleküler düzeyde karakterize edilememiştir. İki hücre tipinde farklı ifade olmuş genlerin tanımlanmasında kuvvetli bir araç olan mRNA“farklılık gösterim”teknolojisi, bu tezde kapsamlı bir şekilde kullanılmıştır. San pasa karşı bir majör ve iki minör gene sahip 'Pastor' varyetesi, iki minör gene sahip 'Avocet' varyetesi ve bunların eşleştirilmesinden olşmuş homozigot dirençli ve homozigot hassas bitkiler farklılık gösterim yöntemi analizlerinde san pas hastalığına karşı dirençlilik genlerini bulmak amacıyla kullanılmıştır. Farklı olarak ifade olduğu tanımlanan cDNA bantlarının nükleotid dizileri gen bankalarındaki sekanslarla karşılaştırılmıştır ve daha önceki klonlanmış olan dirençlilk genleriyle benzer protein motifleri bulunmuştur. Klonlarımızın amino asit sekanslarında dirençlilik genlerinde bulunan reseptör motifleri, protein kinaz motifleri, nükleotide bağlanma bölgesi motifleri ve gelişimsel sinyal protein motiflerine rastlanmıştır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT DIFFERENTIAL DISPLAY OF WHEAT mRNAs FOR THE DETECTION OF YELLOW RUST DISEASE RESISTANCE GENES Bozkurt, Osman M.S. Department of Biotechnology Supervisor: Assoc.Prof.Dr.Mahinur S.Akkaya August 2002, 94 pages Wheat is one of the most important crops grown globally. However, as a result of modem plant breeding practices, reduced genetic diversity in wheat, made it increasingly vulnerable to diseases. Yellow rust caused by Puccinia striiformis is a major disease of wheat. It has been the most devastating disease in Turkey during the past 20 years. Of the 100 rust resistance genes identified, none of them have been characterized at the molecular level yet. mRNA differential display technique, which is a powerful tool to identify those genes that are differentially expressed between the two cell types has been extensively used in this study. inThe variety 'Pastor', with one major and two minor, 'Avocet' with two minor resistance genes to yellow rust as well as homozygote resistant and susceptible F5 plants produced from the mating of Pastor and Avocet have been utilized for differential display analysis for the detection of yellow rust disease resistance genes. The differentially expressed cDNA bands were cloned and sequenced. Nucleotide sequences of differentially expressed cDNA bands were compared with the sequences in the Genebank. Some protein motifs similar to protein motifs of the previously cloned resistance gene sequences have been identified. Translated sequences of our clones contained receptor motifs, protein kinase motifs, nucleotide binding domains, and developmental signaling motifs, which are the signatures of plant disease resistance genes.
Benzer Tezler
- Abiyotik stresle ilişkili genlerin mRNA farklılık gösterim tekniği kullanılarak belirlenmesi ve karakterize edilmesi
Identification and characterization of abiotic stress-related genes by using mRNA differential display technique
DİĞDEM AKTOPRAKLIGİL
- Buğdayda (Triticum aestivum L.) absisik asitle ilişkili gen anlatımı
Abscisic acid related gene expression in wheat (Triticum aestivum L.)
BİRSEN CEVHER KESKİN
Doktora
Türkçe
2006
Biyomühendislikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDÜLREZZAK MEMON
PROF. DR. AYŞEGÜL TOPAL SARIKAYA
- Molecular identification of differentially expressed zinc related genes in cultivated bread wheat
Modern ekmeklik buğdayda, farklı ifade edilen çinko ile iliskili genlerin moleküler karakterizasyonu
ZEYNEP IŞIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiDOÇ. DR. HİKMET BUDAK
PROF. DR. İSMAİL ÇAKMAK
- Investigations of wheat genes involved in zinc efficiency mechanism using differential display technique
Çinko eksikliğine dayanıklılık mekanizmasında rol alan buğday genlerinin farklılık gösterimi yöntemi ile araştırılması
MİNE TÜRKTAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2003
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Detection and characterization of plant genes involved in various biotic and abiotic stress conditions using ddrt-pcr and isolation of interacting proteins
Çeşitli biyotik ve abiyotik stres koşullarında bitkilerde rol alan genlerin farklılık gösterim yöntemiyle bulunması, fonksiyonlarının belirlenmesi ve ilişkide bulunan proteinlerin belirlenilmesi
TURGAY ÜNVER
Doktora
İngilizce
2008
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN
PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA