Alpha-galactosidase gene cloning from aspergillus fumigatus
Aspergillus fumigatus'tan alfa-galaktosidaz geni klonlaması
- Tez No: 119105
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL, DOÇ. DR. UFUK BAKIR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: a-galaktosidaz, klonlama, Aspergillus fumigatus iv, Aspergillus fumigatus, a-galactosidase, cloning, Aspergillus fumigatus 111, Aspergillus fumigatus
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
oz ASPERGILLUS FUMTGATUSTAN ALFA-GALAKTOSIDAZ GENI KLONLANMASI Yalçındağ, Banu Yüksek Lisans, Gıda Mühendisliği Bölümü Tez Danışmanı: Doç. Dr. Zümrüt Begüm Ögel Yardımcı Tez Danışmam: Doç. Dr. Ufuk Bakır Ocak 2002, 88 sayfa Bu çalışmada Aspergillus fumigatus IMI 385708 a-galaktosidaz geni üzerinde moleküler klonlama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Enzimin amino asit dizilimi ve Aspergillus ve Penicillium suşları a-galaktosidazları arasında korunmuş dizilimler kullanılarak dejenere primerler tasarlanmıştır. Bu primerler polimeraz zincir tepkimesinde kullanılarak alfa-galaktosidaz gen fragmanları çoğaltılmıştır. Elde edilen 900 baz çiftlik bir PCR ürünü ilerki çalışmalarda kullanılmak üzere sonda olarak seçilmiştir. RNA nokta blot analizi, en yüksek a-galaktosidaz mRNA ifadesinin keçi boynuzu sakızı üzerindeki beşinci büyüme gününde gerçekleştiğini göstermiştir. Bu bilgi cDNA sentezinde kullanılmıştır. Birincil cDNA kütüphanesinin hazırlanması için, sentezlenen cDNA, Lambda ZAP Express® vektörüne bağlanmıştır. Birincil kütüphane çoğaltıldıktan sonra tarama çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Birincil ve ikincil tarama sonrasında, ilerki karakterizasyon çalışmalarında kullanılmak üzere olası pozitif plaklar elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT ALPHA-GALACTOSIDASE GENE CLONING FROM ASPERGILLUS FÜMTGA TUS Yalçındağ, Banu M.S., Department of Food Engineering Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Zümrüt Begüm Ögel Co-Supervisor: Assoc. Prof. Dr. Ufuk Baku- January 2002, 88 pages In this study, molecular cloning studies were performed on the o> galactosidase gene of Aspergillus fumigatus IMI 385708. Degenerate primers were designed based on amino acid sequence of the enzyme and conserved sequences among a-galactosidases of Aspergillus and Penicillium species. These primers were used in PCR to amplify alpha-galactosidase gene fragments. A 900 bp PCR product was selected as a probe for further studies. RNA dot blot analysis showed that the highest expression of a-galactosidase mRNA was on the fifth day of growth on locust bean gum. This information was employed in cDNA synthesis. The synthesized cDNA was ligated onto Lambda ZAP Express® vector to construct the primary cDNA library. After amplification of the primary library, screening studies were performed. At the end of primary and secondary screening, a number of putative positive plaques were obtained for further characterization studies.
Benzer Tezler
- Cloning and characterization of industrially important alpha-galactosidase genes from the human pathogen aspergillus fumigatus
Alfa-galatosidaz genlerinin insan patojeni aspergillus fumigatusdan klonlaması ve karakterizasyonu
BETÜL SÖYLER
Yüksek Lisans
İngilizce
2004
Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK BAKIR
- Hemodiyaliz programındaki kronik böbrek hastalarında fabry hastalığı prevelansının saptanması
Determi̇ni̇ng the prevalence of fabry di̇sease among chroni̇c ki̇dney pati̇ents i̇n hemodi̇alyses programs
ELİF NAZLI SERİN ATAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
NefrolojiAkdeniz Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RAMAZAN ÇETİNKAYA
- Heterologous expression, characterization, and optimization of production of alpha-galactosidase from aspergillus fumigatus in aspergillus sojae
Aspergillus fumigatus alfa-galaktosidazinin aspergillus sojaede heterolog üretimi, karakterizasyonu ve üretiminin optimizasyonu
SÜMEYRA GÜRKÖK
Doktora
İngilizce
2012
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL
PROF. DR. UFUK BÖLÜKBAŞI
- İdiyopatik proteinürisi olan çocuk hastalarda alfa-galaktosidaz a eksikliğinin (fabry hastalığının) taranması
Screening alpha-galactosidase A deficiency(fabry disease) in children who have idiopathicproteinuria
MELTEM AKGÜL ERDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLYAS OKUR
- Alfa-galaktozidaz a eksikliği tanı ve takibinde kullanılmak üzere lizo-globotriozilseramid (LYSO-GB3) düzeyi ölçümü için likit kromatografisi -ardışık kütle spektrometrisi (LC-MS/MS) metodu geliştirilmesi ve validasyonu
Development and validation of liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method for measurement of LYSO-globotriaosylceramide (LYSO-GB3) level for use in diagnosis and follow-up of ALPHA-galactosidase a deficiency
ELİF ERKAN KURDOĞLU