Kesimhanelerden genişletilmiş spektrumlu beta laktamaz üreten Escherichia coli izolasyonu izolatların antibiyotik direnç profilleri ve moleküler karakterizasyonu
Extended-spectrum beta lactamase producing Escherichia coli isolation from slaughterhouses, antibiotic resistance profiles and molecular characterization
- Tez No: 1008889
- Danışmanlar: PROF. DR. YELİZ UÇAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Besin Hijyeni ve Teknolojisi, Food Hygiene and Technology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, koyun (n=184) ve sığır (n=316) kesimhanelerine ait toplam 500 örnekte (dışkı, sekum, karkas, yüzey ve atık su) GSBL üreten Escherichia coli prevalansı, izolatların antibiyotik direnç profilleri ve moleküler özellikleri araştırılmıştır. İdentifikasyonda konvansiyonel ve moleküler yöntemler kullanılmıştır. GSBL üretimi kombine disk difüzyon yöntemiyle doğrulanmış; direnç genleri (blaTEM, blaCTX-M, blaOXA-48 ve blaSHV) PZR ile analiz edilmiştir. Çalışma sonucunda koyun örneklerinin %33,7'sinde (62/184) ve sığır örneklerinin %50'sinde (158/316) GSBL üreten E. coli tespit edilmiştir. Koyunlarda en yüksek pozitiflik keismhane padok dışkısı örneklerinde (%50; 6/12) saptanırken sığırlarda ise dışkı (%68,1; 49/72) ve karkas (%40,3; 29/72) örneklerinde belirlenmiştir. Çevresel örneklerde, koyun kesimhanelerinde %23,7 (18/76), sığır kesimhanelerinde ise %55,3 (42/76) oranında GSBL üreten E. coli saptanmıştır. Mevsimsel dağılım incelendiğinde, her iki hayvan türüne ait örneklerde GSBL üreten E. coli oranının yaz mevsiminde daha yüksek olduğu belirlenmiştir. Analiz edilen tüm izolatların ampisilin ve seftazidime (%100) dirençli olduğu belirlenmiştir. Sığır izolatlarında kloramfenikol (%60,8), nalidiksik asit (%57,6), gentamisin (%51,3) ve siprofloksasine (%50,6) karşı yüksek direnç oranları saptanmış, koyun izolatlarında ise kloramfenikol (%58,1) ve siprofloksasin (%40,3) direnci öne çıkmıştır. Çoklu ilaç direnç (MDR) oranı koyun izolatlarında %69,4, sığır izolatlarında ise %63,9 olarak belirlenmiştir. Koyun ve sığır izolatlarında blaTEM ve blaCTX-M genleri sırasıyla %100 ve %90,3 ile %96 ve %91,1 oranlarında tespit edilmiştir. En yaygın gen kombinasyonu her iki grupta da blaTEM + blaCTX-M olup koyun ve sığır izolatlarında sırasıyla %64,5 ve %48,7 oranlarında belirlenmiştir. Bunu blaTEM + blaCTX-M + blaOXA-48 kombinasyonu izlemekte olup oranlar koyun ve sığır izolatlarında sırasıyla %20,9 ve %38,6 olarak saptanmıştır. Kesimhane izolatlarında birden fazla β-laktamaz geni ve özellikle blaOXA-48 varlığı, direnç genlerinin kesim sürecinde yayılım potansiyelini ortaya koymaktadır. MDR ilişkili halk sağlığı risklerini ortadan kaldırmak için antibiyotik kullanımının denetim altına alınması, kesimhanelerde izleme ve denetim mekanizmalarının etkin bir şekilde uygulanması kritik önem arz etmektedir.
Özet (Çeviri)
This study investigated the prevalence of ESBL-producing Escherichia coli, as well as the antimicrobial resistance profiles and molecular characteristics of the isolates, in a total of 500 samples (feces, cecum, carcass, surface, and wastewater) collected from sheep (n=184) and cattle (n=316) slaughterhouses. Conventional and molecular methods were used for identification. ESBL production was confirmed by the combined disk diffusion method, and resistance genes (blaTEM, blaCTX-M, blaOXA-48 and blaSHV) were analyzed by PCR. As a result of the study, ESBL-producing E. coli were detected in 33.7% (62/184) of sheep samples and 50% (158/316) of cattle samples. In sheep, the highest positivity rate was detected in slaughterhouse paddock feces samples (50%; 6/12), whereas in cattle the highest rates were determined in fecal (68.1%; 49/72) and carcass (40.3%; 29/72) samples. In environmental samples, ESBL-producing E. coli were detected at rates of 23.7% (18/76) in sheep slaughterhouses and 55.3% (42/76) in cattle slaughterhouses. Evaluation of seasonal distribution showed that the prevalence of ESBL-producing E. coli was higher during the summer in samples obtained from both animal species. Antimicrobial susceptibility testing revealed that all isolates were resistant to ampicillin and ceftazidime (100%). In cattle isolates, high resistance rates were observed against chloramphenicol (60.8%), nalidixic acid (57.6%), gentamicin (51.3%), and ciprofloxacin (50.6%), whereas in sheep isolates high resistance was detected against chloramphenicol (58.1%) and ciprofloxacin (40.3%). The multidrug resistance (MDR) rate was determined as 69.4% in sheep isolates and 63.9% in cattle isolates. The blaTEM and blaCTX-M genes were detected in sheep and cattle isolates at rates of 100% and 90.3%, and 96% and 91.1%, respectively. When β-lactamase gene combinations were evaluated, the most common gene combination in both sheep (64.5%) and cattle (48.7%) isolates was blaTEM + blaCTX-M. This was followed by the blaTEM + blaCTX-M + blaOXA-48 gene combination, which was detected in 20.9% of sheep isolates and 38.6% of cattle isolates. The presence of multiple β-lactamase genes, particularly blaOXA-48, in slaughterhouse isolates indicates the potential dissemination of resistance genes during the slaughtering process. In order to mitigate MDR-associated public health risks, strict control of antimicrobial use and the effective implementation of monitoring and surveillance mechanisms in slaughterhouses are of critical importance.
Benzer Tezler
- Kesimhanelerden kaynaklanan atıklar ve değerlendirme metotları
Wastes of slaughterhouse and evaluation methods
GÖKSEN SEVDİM
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Çevre MühendisliğiSakarya ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİRALİ ALOSMAN
- Kesimhanelerden alınan piliç boyun derisi örneklerinde clostridium perfringens varlığı, moleküler karakterizasyonu ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi
Detection, molecular characterization and antibiotic resistance profiles of clostridium perfringens isolated from chicken neck samples at slaughterhouse level
GÜZİN İPLİKÇİOĞLU ÇİL
Doktora
Türkçe
2013
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiGıda Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. F. SEDA BİLİR ORMANCI
- Nevşehir ilindeki kesimhanelerden izole edilen staphylococcus aureus izolatlarının moleküler tiplendirilmesi ve vankomisin dirençliliğinin incelenmesi
Molecular typing and investigation of vancomycin resistant of staphylococcus aureus isolated from slaughterhouses in Nevsehi̇r province
ÖMER TOLGA YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Besin Hijyeni ve TeknolojisiErciyes ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HARUN HIZLISOY
- Tavuk dışkılarından izole edilen Salmonella serovarlarının antibiyotik direnç profillerinin araştırılması
Investigetion of antibiotic resistance profiles of Salmonella serovars isolated from chicken feces
NUR SELCEN AKKAYA
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEYYAL AK
DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL
- Tavuklarda Salmonella tanısında kültür ve Real-Time PCR'ın kullanımı
Use of culturel method and real-time PCR in diagnosis of Salmonella in poultry
ABDULLAH TEOMAN ÜNLÜ
Doktora
Türkçe
2011
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜJGAN İZGÜR