ISSR markörleri kullanılarak Eskişehir'de yetişen Peganum harmala örneklerinin genetik benzerliklerinin değerlendirilmesi
Evaluation of genetic similarity among Peganum harmala L. samples growing in Eskişehir using ISSR markers
- Tez No: 1000458
- Danışmanlar: DOÇ. DR. İLHAM ERÖZ POYRAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Botanik, Genetik, Botany, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Biyoteknoloji, Botanik, Eczacılık, Genetik çeşitlilik, Tıbbi bitkiler, Biotechnology, Botany, Pharmacy, Genetic diversity, Plants-medicinal
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Botanik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Farmasötik Botanik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Peganum harmala L. (Nitrariaceae) türü ülkemizde halk arasında yaygın olarak“üzerlik”adı ile bilinir. Tohum ve kökleri ülkemizde kurt düşürücü, adet söktürücü, uyuşturucu, terletici ve yatıştırıcı olarak kullanılır. Tohumları (Pegani semen) kavrularak dahilen basura karşı kullanılır. Bu tez çalışmasında tıbbi açıdan önemli olan Eskişehir'de doğal olarak yetişen P. harmala örneklerinin ISSR primerleri kullanılarak genetik benzerliğinin değerlendirilmiştir. P. harmala ve A. cepa (dış grup) yapraklarından ticari kit ile izole edilen DNA, PZR yöntemiyle sekiz ISSR primeri kullanılarak çoğaltılmıştır. Aplifikasyon ürünleri, agaroz jelde yürütülmüş ve fotoğraflanmıştır. Her bir örneğe ait karakteristik bantları gösteren fotoğraflar bant profillerini karşılatırmak için Phoretix1D Pro yazılımı kullanılarak analiz edilmiştir. Kullanılan ISSR primerleri ile elde edilen toplam bant sayısı 294, toplam polimorfik bant sayısı 275'tir. Primerlerin toplam polimorfizm oranları %94,3-100 arasında, PIC değerleri 0,360-0,570 arasında bulunmuştur. Bantlardan elde edilen ikili verilerden UPGMA yöntemi ile Jaccard benzerlik ve mesafe matrisleri oluşturulmuş ve dendrogram çizilmiştir. Dendrogramda, toplanan örnekler büyük ölçüde lokalitelere bağlı olarak monofiletik gruplar halinde kümelenmiştir. Ayrıca GenAlEx yazılımı kullanılarak temel koordinat (PCoA) ve bant desen (BAPT) analizleri yapılmıştır. PCoA grafiği, örneklerin yerleşimsel olarak doğu yönünde artan yükseklik ile paralel biçimde ayrıştığını göstermiştir. BAPT grafiğinde en yüksek bant sayısı ve heterozigotluk değeri lokalite 2'de, düşük heterozigotluk değeri ve yüksek özel bant sayısı lokalite 5'te elde edilmiştir.
Özet (Çeviri)
The species Peganum harmala L. (Nitrariaceae) is commonly known as“üzerlik”in Turkiye. Its seeds and roots are used in Turkiye as anthelmintic, emmenagogue, narcotic, diaphoretic, and sedative. The seeds (Pegani semen) are roasted and used internally against hemorrhoids. In this study, the genetic similarity of naturally occurring P. harmala samples in Eskişehir, which are of medicinal importance, was evaluated using ISSR primers. DNA isolated from P. harmala and A. cepa (outgroup) leaves, using a commercial kit, was amplified by PCR with eight ISSR primers. The amplification products were run on an agarose gel and photographed. Photographs showing the characteristic bands of each sample were analyzed using Phoretix1D Pro Software to compare band profiles. The total number of bands obtained with the ISSR primers used was 294, and the total number of polymorphic bands was 275. The total polymorphism rates of the primers ranged from 94.3% to 100%, and the PIC values ranged from 0.360 to 0.570. Using the band data, Jaccard similarity and distance matrices were generated via UPGMA, and a dendrogram was constructed. In the dendrogram, the collected samples were clustered into monophyletic groups largely dependent on locality. In addition, principal coordinate analysis (PCoA) and band pattern (BAPT) analyses were performed using GenAlEx Software. The PCoA graphic showed that the samples were spatially separated with increasing altitude toward the east. In the BAPT graphic, the highest number of bands and heterozygosity were found in locality 2, whereas locality 5 had the lowest heterozygosity and the highest number of specific bands.
Benzer Tezler
- Determination of genetic variations of chickpea, lentil and almond genotypes stored in the Jordanian gene bank using PCR-based molecular markers
PCR tabanlı moleküler markırlar kullanılarak Ürdün gen bankasında saklanan nohut, mercimek ve badem genotiplerinde genetik varyasyonun bel,rlenmesi
GHENA JABER RADI AL HMOUD
Doktora
İngilizce
2022
BiyolojiEskişehir Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL SÖZEN
- Bazı Tunus citrus varyetelerinde genetik çeşitliliğin moleküler markerler kullanılarak belirlenmesi
Determination of genetic diversity in some Tunisian citrus varieties using molecular markers
AMNA GABSI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyoteknolojiEskişehir Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL SÖZEN
- Prunus salicina'da markır destekli seleksiyona olanak sağlayabilecek meyve özellikleri ve çiçeklenme ile ilgili olası markırların araştırılması
Investigation of possible markers related to fruit characteristics and flowering that may allow marker- assisted selection in Prunus salicina
ELİF SEYİTOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiEskişehir Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL SÖZEN
- Ege bölgesinde yetişen kavun çeşitlerinin morfolojik ve ISSR DNA markörleri kullanılarak tanımlanması
Determination of genetic variation among melon genotypes grown in Aegean region, by morphologic and ISSR DNA markers
FİGEN ATALMIŞ
- Kendilenmiş at dişi mısır hatlarında genetik çeşitliliğin SSR ve ISSR markörleri ile belirlenmesi
Determination of genetic diversity with SSR and ISSR markers in dent corn inbred lines
MEHMET AKİF YAŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatSelçuk ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA YORGANCILAR