Bazı köpek ırklarında kan protein polimorfizmi ve ırklar arası genetik mesafelerin tahmin edilmesi
Investigation of blood protein polymorphism and estimation of genetic distances in some dog breeds
- Tez No: 99464
- Danışmanlar: PROF.DR. CEYHAN ÖZBEYAZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Biyokimyasal polimorfizm, F-istatistik, genetik uzaklık, köpek, kümeleme analizi, ortalama heterozigotluk, Average heterozigosity, biochemical polymorphism, cluster analysis, dog, F-statistic, genetic distance
- Yıl: 2000
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
89 ÖZET Bazı Köpek Irklarında Kan Protein Polimorfîzmi ve Irklar Arası Genetik Mesafelerin Tahmin Edilmesi Bu çalışmada ele alınan Akbaş, Kangal, Alman Kurt Köpeği, Doberman, Labrador, Setter ve Pointer köpek ırklarında Alb, Tf, Poa-1, Poa-3, ArE lokuslannda polimorfizm tespit edilirken ve Hb lokuslannda ise polimorfizm tespit edilmemiştir. Alb lokusunda 2 allel (AlbF ve Albs), Tf lokusunda 3 allel (Tf, Tf^ı ve Tf^), Poa-1 lokusunda 3 allel (Poa-1 A, Poa-1 B ve Poa-1 A), Poa-3 lokusunda 2 allel (Poa-3 A ve Poa-3B) ve ArE lokusunda 6 allel (ArEH, ArEK, ArEN, ArEQ, ArET ve ArEw) saptanmıştır. Lokuslardaki bu polimorfizmden yararlanarak ortalama heterozigotluk (hs) değerleri, F-istatistikleri, her generasyon göç eden birey sayısı (Nm), exact test olasılıkları ip) ve genetik uzaklık (dy) değerleri bakımından Akbaş, Kangal, Alman Kurt Köpeği, Doberman, Labrador, Setter ve Pointer köpek ırkları karşılaştınlmıştır. Ortalama heterozigorluk değeri 0,3185 (Doberman ırkında) ile 0,4055 (Kangal Çoban köpeğinde) arasında tahmin edilmiş ve köpek ırkları arasında heterozigotluk bakımından herhangi bir farklılık bulunamamıştır. Köpek ırklarında tüm lokuslar üzerinden sırasıyla 0,0826, 0,082 ve 0,1603 (P<0,01) olarak hesaplanan hesaplanan Fıs, Fit ve Fst değerlerinin istatistik WW w olarak önemli olduğu, populasyonlardaki çiftleşmelerin rastgele olmadığı ve ırklar arasındaki farklılıkların Alb, Tf, Poa-1, Poa-3 ve ArE lokuslanndan kaynaklandığı belirlenmiştir. Populasyonlar arasında her generasyon göç eden ortalama birey sayısı 0,03 olarak hesaplanmıştır. Exact test olasılıklarına göre Pointer- Akbaş, Pointer-Alman Kurt Köpeği ırkları arasında hesaplanan exact test değerinin önemli olmadığı, (p=0,5364 ve 0,1332)90 diğer ırkların ikili karşılaştırılmaları neticesinde elde edilen olasılıkların ise istatistiki düzeyde önemli olduğu (0,0000 <p < 0,0059) belirlenmiştir. Setter ırkı hariç diğer ırklar arasında genetik uzaklık değerleri bakımından büyük farklar bulunmamakla birlikte ırklar arası genetik uzaklık değeri 0,0132 ile 0,2442 arasında tespit edilmiştir Yapılan kümeleme analizi sonucu çizilen dendogramda, Pointer ve Akbaş ırkları bir küme oluşturmakta, daha sonra bu kümeye Alman Kurt Köpeği ve Labrador ırkının da dahil olmasıyla başka bir küme oluşmaktadır. Doberman ve Kangal ırkları ise başka bir küme oluşturmaktadır. Setter ırkı ise bu iki kümeye de girmemiştir. Sonuç olarak, köpek ırklarının genetik yapılarını belirlemede polimorfik biyokimyasal sistemler kullanılabileceği, köpek populasyonlannı karşılaştırmada ortalama heterozigotluk değerlerinden, F-istatistikliklerinden, her generasyon göç eden birey sayısından, exact test olasılıklarından, genetik uzaklık değerlerinden yararlanılabileceği ve kümeleme analizi metodunun ırkların sınıflandırılmasında kullanılabileceği kanısına varılmıştır. Ayrıca, Kangal ve Akbaş Çoban köpeklerinin farklı kümelerde yer almaları, her iki ırkın incelenen lokuslar bakımından farklı genetik yapıda olduklarını göstermekte, bu da bu iki ırkın yakın akraba oldukları düşüncesini zayıflatmaktadır. Bu nedenle, her iki köpek ırkının genetik yapılarını ve akrabalık derecelerini daha iyi belirlenmek için DNA düzeyinde çalışmaların yapılmasını gerektirmektedir.
Özet (Çeviri)
91 SUMMARY Investigation of Blood Protein Polymorphism and Estimation of Genetic Distances in Some Dog Breeds Blood proteins were taken from Akbash, Kangal, German Shepherd, Doberman pinscher, Labrador retriever, Setter and Pointer dog breeds for investigation in this study. Polymorphism was detected Alb, Tf, Poa-1, Poa-3 ve ArE loci while no polymorphism was observed on the Hb locus. The number of allele genes found on Alb (AlbF and Albs), Tf (Tf, Tf^ and Tf^), Poa-1 (Poa-1 A, Poa-1 B and Poa-1 A), Poa-3 (Poa-3A and Poa-3B) and ArE (ArEH, ArEK, ArEN, ArEQ, ArET and ArEw) were 2, 3, 3, 2 and 6, respectively. These polymorphisms were used to estimate the average heterozygosity value (hs), F-statistics, the number of gene flown in each generation (Nm), the probability of exact test (p) and genetic distances (dy) were compared among the dog breeds. Average heterozygosity values were found to be in the range of 0,3185 (Doberman pinscher) to 0,4055 (Kangal Shepherd), and statistically significant differences in heterozigosity were found among the dog breeds (P<0,05). Fıs, Fit ve Fst values were estimated to be 0.0826, 0.082 and 0.1603 WW w respectively for whole loci in dog breeds and these values were significant at P<0,01. From this results mating in the populations were not at random, and the genetic differences among the dog breeds resulted from Alb, Tf, Poa-1, Poa-3 ve ArE loci. The effective number of individuals exchanged between populations per generation (Nm = gene flow) was estimated to be 0,03. The estimated exact test probability of Pointer- Akbash shepherd (p = 0,5364) indicated that the difference between Pointer-German shepherd breeds was non significant (p = 0,1332). The differences of the probabilities among other breds (0,0000 <p< 0,0059) were found to be significant.92 The estimated genetic distance values in populations other than Setter bred were between 0,0132 and 0,2442. Cluster analysis (UPGMA) results showed that Pointer and Akbash breeds formed a cluster and than German shepherd joined to the cluster. Finally, Labrador clunched to the cluster. However, Doberman and Kangal shepherd breeds formed a different cluster. Setter breed did not join either and formed its own. In conclusion, formation of two distinct clusters in Kangal and Akbash Shepherds reveals that these breeds have different genetic structure interms of investigated loci and are not close relative to each other. The genetic differences between Akbash, Kangal, German Shepherd, Doberman pinscher, Labrador retriever, Setter and Pointer breeds can be successfully determined by using F-statistics, exact test probability, gene flow and genetic distance values. In addition, classification of population by cluster analysis was found to be useful.
Benzer Tezler
- Kangal köpeklrinin genetik yapılarının moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of genetic structure of Turkish Kangal dogs using molecular techniques
VAHDETTİN ALTUNOK
Doktora
Türkçe
1998
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiVeterinerlik Biyokimyası Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET NİZAMİIOĞLU
- Glukoz-6-fosfat dehidrogenaz enziminin köpek karaciğerinden saflaştırılması ve bazı özelliklerinin tanımlanması
Başlık çevirisi yok
CUMHUR BİLGİ
- Köpeklerde halotan ve enfluran inhalasyon enesteziklerinin bazı hematolojik, biyokimyasal ve klinik parametreler üzerine etkilerinin karşılaştırılması
Comparison of the effects of halothane and enflurane known as inhalation anesthetics on clinical, haematological, biochemical parameters in dogs
ABUZER TAŞ
Doktora
Türkçe
1998
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiVeterinerlik Cerrahisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NAZMİ ATASOY
- Köpeklerde deneysel nefrotoksikozisde eritropoietin ve bazı hematolojik parametreler üzerine araştırmalar
Investigation on erythropoietin level and some blood parameters in experimental nephrotoxicosis in dogs
EBUBEKİR CEYLAN
Doktora
Türkçe
1998
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZAHİD TEVFİK AĞAOĞLU
- Ege denizinde rastlanan bazı köpekbalığı ve vatoz türlerinin biyolojisi üzerine bir ön araştırma
Başlık çevirisi yok
AHMET SACİT ORAY
Yüksek Lisans
Türkçe
1989
Su ÜrünleriDokuz Eylül ÜniversitesiDeniz Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞÜKRAN CİRİK