Herediter spastik parapleji ön tanılı hastalarda etiyolojinin tüm ekzom dizi analizi verileriyle retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of etiology in patients with pre-diagnosed clinically hereditary spastic paraplegia via whole exome sequence analysis data
- Tez No: 987217
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ALİ ERGÜN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Spastik parapleji-herediter, Spastic paraplegia-hereditary
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Herediter spastik parapleji (HSP), kortikospinal yolları tutan, alt ekstremitelerde belirgin spastisite ve güçsüzlük ile kendini gösteren heterojen bir grup nörodejeneratif bozukluktur. Şimdiye kadar, HSP'ler için 80'den fazla gen/lokus tanımlanmasına rağmen HSP'nin genetik altyapısı tam olarak çözülebilmiş değildir. HSP'ler hem klinik hem de genetik heterojenite göstermektedir. Bu çalışmada tanı amaçlı WES analizi yapılmış HSP şüphesi bulunan hastalar ile ilgili kesitsel bir arşiv çalışması yapılarak genotipler ve ilgili fenotipler arasında ilişki kurmak amaçlanmaktadır. Dahil edilme kriterleri üst motor nöron bulgusu (hiperrefleksi ve ekstansör plantar yanıt) ya da progresif alt ekstremite spastisitesi ve güçsüzlüğü olarak belirlenmiştir. Bu kriterleri karşılayan 22 ailenin 12'sinde toplam 10 farklı gende 6'sı HSP geni olacak şekilde (FA2H, NIPA1, SPAST, SPG7, SPG11, ZFYVE26) patojen/olası patojen varyant tespit edilmiştir. En sık görülenler SPAST ve SPG11 genleri olmuştur. Dört hasta ise HSP-dışı diğer nörolojik hastalıklarla (Adrenolökodistrofi (ALD), Amiyotrofik lateral skleroz, Charcot-Marie-Tooth hastalığı ve Herediter duyusal ve otonomik nöropati) ilişkili tanı almıştır. Bu durum nörogenetik hastalıkların klinik prezentasyonlarının örtüşebileceğini ve bu örtüşmenin yanlış klinik tanı konmasına neden olabileceğini göstermektedir. Özellikle pür HSP olarak prezente olan bir hastada erkekten erkeğe geçiş olmadığında, ALD düşünülmeli ve ABCD1 geninin dizilenmesi veya çok 148 uzun zincirli yağ asidi plazma konsantrasyonunun ölçülmesi gerektiği sonucuna varılmıştır. WES analizinin tanısal verimi yaklaşık olarak %54 olarak saptanmıştır. Bu oran literatürdeki oranlarla uyumlu bulunmuştur. Bu çalışma HSP şüpheli hastaların küçük bir örneğini oluşturmaktadır. HSP'nin alt yapısının tamamen çözülebilmesi ve hedefe yönelik tedavilerin oluşturabilmesi için daha büyük hasta gruplarında daha fazla sayıda çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
Hereditary spastic paraplegias (HSPs) are a heterogeneous group of neurodegenerative disorders that involves the corticospinal tracts and attending with significant spasticity and weakness in the lower extremities. The genetic background of HSP has not been entirely enlightened, despite more than 80 genes/locus having been identified. HSPs demonstrate both clinical and genetic heterogeneity. This study aims to establish an association between genotypes and phenotypes through a retrospective cross-sectional archival study on patients with suspected HSP who performed the diagnostic WES analysis. Inclusion criteria were upper motor neuron finding or progressive lower extremity spasticity and weakness. Pathogenic/likely pathogenic variants were detected in 12 of 22 family, 6 of them HSP genes (FA2H, NIPA1, SPAST, SPG7, SPG11, ZFYVE26) in 10 different genes. SPAST and SPG11 were the most frequently detected causative genes. Four patients were diagnosed with other non-HSP neurological diseases (Adrenoleukodystrophy (ALD), Amyotrophic lateral sclerosis, Charcot-Marie-Tooth disease, Hereditary sensory and autonomic neuropathy). The results indicate that the clinical expressions of neurogenetic diseases may overlap and lead to misdiagnosis. Especially when there is no male-to-male transmission in a patient presenting as pure HSP, ALD should be considered, and it was concluded that the ABCD1 should be sequenced or very-long-chain fatty acid plasma concentration should be measured. The diagnostic yield of WES analysis was found to be approximately 54%. Although this yield is consistent with the literature, this study includes a small group of patients. Therefore, larger patient groups are required for further analysis to comprehend the genetic background of HSP better and develop targeted treatment options.
Benzer Tezler
- Otozomal resesif herediter spastik paraplejilerde klinik özellikler
Clinical features of autosomal ressesive hereditary spastic paraplegias
AKGÜN ÖLMEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK TOPALOĞLU
- Molecular and functional investigation of disease-associated cytoskeletal proteins protrudin and MYO1H
Hastalık ilişkili sitoskeletal proteinler protrudin ve MYO1H'nin moleküler ve fonksiyonel araştırılması
ECE SELÇUK ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2024
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Exclusion of autosomal recessive hereditary spastic paraplegia loci in Turkish families
Türk ailelerinde otozomal çekinik herediter spastik parapleji lokuslarının dışlanması
BURÇAK ÖZEŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2011
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Investigation of the effect of ATP13A2 (PARK9) frameshift mutation on the protein function
ATP13A2 (PARK9) çerçeve kayması mutasyonunun protein fonksiyonuna etkisinin incelenmesi
KORAY KIRIMTAY
Doktora
İngilizce
2021
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Screening of spastin, atlastin, NIPA1 and REEP1 genes in hereditary spastic paraplegia (HSP) patients
Herediter spastik parapleji hastalarında (HSP) spastin, atlastin, NIPA1 ve REEP1 genlerinin taranması
ÇİĞDEM ATAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
GenetikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. ESRA BATTALOGLU