Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 direnç geninin araştırılması
Investigation of the OXA-48 resistance gene in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains
- Tez No: 985113
- Danışmanlar: UZMAN SENİHA ŞENBAYRAK
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bakanlığı
- Enstitü: İstanbul Haydarpaşa Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hastane kaynaklı mikroorganizmalarda GSBL ile karbapenemaz aktivitesinin birlikteliği, çoklu ilaç direnç gelişimini kolaylaştırmaktadır. Bunun sonucu olarak; yüksek mortalite ile seyreden infeksiyonlara neden olmaktadır. Bu nedenle, özellikle yoğun bakım ünitelerinde ciddi infeksiyonlarda karbapenem duyarlılığını doğru ve mümkün olan en kısa sürede belirlemek, etken bakterinin izole edildiği hasta için yaşamsal önem taşımaktadır. Türkiye'de ise enterik GN bakterilerde sınıf D OXA karbapenemaz aracılı karbapenem direnci nadir değildir. Bölgesel çalışmalarda enterik GN bakterilerdeki karbapenemaz direncinden OXA-48 karbapenemaz aktivitesinin sorumlu olduğu gösterilmiştir. Bu çalışmada hastanemizde izole edilen karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae (KDKP) suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin belirlenmesi ve karbapenem direncine sebep olan OXA-48 gen varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya Temmuz 2013-Temmuz 2014 tarihleri arasında klinik örneklerden izole edilen toplam 45 KDKP suşu alınmıştır. Konvansiyonel yöntemler ve Vitek-2 (bioMérieux, Fransa) cihazı ile isimlendirilmiş ve antibiyotik duyarlılıkları belirlenmiştir. Karbapenemaz direnç geni olan OXA-48, real time PCR (Corbett Research, Avustralya) ile çalışılmıştır. Kırkbeş suşun 32'sinde (%71) OXA-48 geni pozitif bulunmuştur. Disk difüzyon ve Vitek-2'nin imipenem, meropenem ve ertapenem duyarlılıklarının istatistiksel analizlerine göre meropenem Vitek-2'nin OXA-48 pozitifliğini ayırıcılığı açısından daha belirleyici olduğu bulunmuştur. Vitek-2 sonuçlarına göre OXA-48 (+) KDKP suşlarında en duyarlı antibiyotik kolistin olup, bunu amikasin ve gentamisin takip etmiştir. OXA-48 pozitif olan suşlarda negatif olanlara göre amikasin ve gentamisin direnç oranı anlamlı düzeyde yüksek bulunmuştur. Türkiye'de karbapenem direnci yüksek olmamakla birlikte, OXA-48 direnç geni taşıyan suşlar karbapenem dışında diğer çoğu antibiyotiğe de dirençlidir. Bu nedenle K.pneumoniae'daki karbapenem direnci dikkatli izlem gerektirmektedir. Ayrıca karbapenem direncindeki mekanizmaların ortaya çıkarılması için daha çok çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
The association of ESBL and carbapenemaz activity at hospital infections, facilitates the development of multidrug resistance. As a result, it causes infections, associated with high mortality. Therefore; detecting carbapenem suspectibility, accurately and at the shortest time possibly, is vital for the patients from whom active bacteria isolated, especially with serious infection in intensive care units. In Turkey, it is not uncommon the resistance of carbapenemaz at enteric GN bacteries associated with class D OXA-48. Regional studies have shown that, OXA-48 carbapenemaz activity is responsible for the resistance of carbapenemaz at enteric GN bacteries. In this study, we aimed to determine phenotypic and genotypic features of carbapenemaz resistant Klebsiella pneumonia (CRKP) strains, isolated from our hospital and also to find OXA-48 gene, reason of carbapenem resistance, existence. Total 45 CRKP strains, isolated from clinical speciments from July 2013 to July 2014, has been taken for this study. They were identified by conventional methods and Vitek-2 (bioMérieux, France) device and antibiotic suspectibilities were determined. OXA-48, which is the gene of carbapenemaz resistance, was studied by real time PCR (Corbett Research, Australia). OXA-48 gene were positive in 32 of 45 strains (%71). According to statistical analysis of imipenem, meropenem and ertapenem suspectibility, using disk diffusion and Vitek-2, it has seen that meropenem Vitek-2 is more specific to find OXA-48 positivity. According to Vitek-2 results, the most sensitive antibiotic for OXA-48 (+) CRKP strains, is colistin, followed by amicasin and gentamisin. Amicasin and gentamicin resistance rate was significiantly higher at OXA-48 positives than OXA-48 negative strains. There is not high carbapenem resistance in Turkey but the strains with OXA-48 gene show resistance not only to carbapenem but also to many other antibiotics. Therefore the resistance of carbapenem at Klebsiella pneumoniae, requires a careful follow up. In addition, there is a need for more studies to discover the mechanism of carbapenem resistance.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli klebsıella pneumonıae ve escherıchıa colı suşlarında blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM direnç genlerinin araştırılması
Investigation of blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM resistance genes on carbapenem resistant klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains
AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ
Doktora
Türkçe
2017
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYSALLAR
- Karbapeneme fenotipik olarak dirençli saptanan Klebsiella spp. suşlarında Multipleks PCR ile karbapenem direnç genlerinin araştırılması
Investigation of carbapenem resistance genes by Multiplex PCR in phenotypically determined carbapenem-resistant Klebsiella spp. strains
HATİCE KÜBRA DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. YAŞAR NAKİPOĞLU
- Klinik örneklerden izole edilen karbapeneme dirençli Klebsıella pneumonıae suşlarında yeni antibiyotiklerin in vitro duyarlılıklarının araştırılması
Investigation of in vitro susceptibility of new antibiotics in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated from clinical samples
FATMA SENA TÜRKDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- Farklı klinik numunelerden izole edilen e. coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında karbapenem, kinolon, kolistin direncinin araştırılması ve karbapenem dirençli suşlarda multipleks pcr yöntemi ile kpc, ndm, vım, oxa-48, ımp-1 genlerin tespiti
An investigation of carbapenem, quinolone and colistin resistance in e. coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from different clinical samples and detection of kpc, ndm, vim, oxa-48, imp-1 genes by multiplex pcr in carbapenem-resistant strains.
ÖZGE ALKAN BİLİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
MikrobiyolojiHarran ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR
- Klebsiella pneumoniae klinik suşlarında betalaktam antibiyotik direnç genlerinin ve quorum sensing arasındaki ilişkinin araştırılması
Investigation of the relationship between betalactam antibiotic resistance genes and quorum sensing in clinical strains of klebsiella pneumoniae
MUHAMMET ŞÜKRÜ AĞRALI
Doktora
Türkçe
2025
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN DOĞAN