Silene aegyptiaca'nın Güneydoğu Anadolu Bölgesi popülasyonlarında tür delimitasyonu
Species delimitation within Silene aegyptiaca populations from Southeastern Anatolia
- Tez No: 985053
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP TOPRAK, DR. ERDAL ATEŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dicle Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sistematik çalışmalarda tür, temel birim olarak kabul edilir. Tür delimitasyonu biyolojik çeşitliliğin tür kategorisine atanmasını ifade eder ve bu çeşitliliğin doğru bir şekilde tanımlanması açısından büyük önem taşır. Son yıllarda, sağladıkları çeşitli avantajlar nedeniyle tür delimitasyon çalışmaları büyük ölçüde moleküler veriler ışığında yapılmaktadır. Silene aegyptiaca, Akdeniz çevresinde yayılış gösteren tek yıllık bir bitkidir. Mevcut moleküler çalışmalar, S. aegyptiaca'nın yüksek düzeyde genetik çeşitlilik barındıran bir tür kompleksi olduğunu ortaya koymuştur. Ancak bu çalışmalar, Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi'nde geniş bir yayılış alanına sahip olan S. aegyptiaca'yı yalnızca sınırlı sayıda örnekle temsil etmektedir ve bu nedenle bölgedeki olası genetik çeşitliliği yeterince yansıtmamaktadır. Bu çalışmanın amacı, S. aegyptiaca'nın Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi'ndeki olası farklı soylarında, Multi-Species Coalescent (MSC) modeline dayalı tür delimitasyonudur. Bu amaçla, türün ilgili coğrafik yayılışından toplanan örneklerden, filogenetik analizlerde yaygın olarak kullanılan lokuslara ait DNA dizileri elde edilmiş ve bu veriler Bayesian yaklaşımlı filogenetik yöntemlerle analiz edilmiştir. Çalışmada, MSC model esaslı bir Bayesian yöntem olan“STACEY”tür delimitasyon metodu kullanılmıştır. Elde edilen sonuçlar, önceki çalışmalarla paralellik göstermekte ve S. aegyptiaca'nın Güneydoğu Anadolu Bölgesi popülasyonlarında iki ila dört farklı genetik soyun varlığına işaret etmektedir. Gözlenen bu genetik çeşitlilik, türün mevcut taksonomik durumu ile uyumlu değildir. STACEY analizleri, incelenen popülasyonların birbirinden farklı ve bağımsız evrimsel soylar oluşturduğunu, ayrıca bu ayrışmaların yüksek posterior olasılık (PP) değerleriyle güçlü biçimde desteklendiğini ortaya koymuştur. Tür ağacı, popülasyonların genel olarak coğrafi dağılımdan bağımsız biçimde beş ayrı grup altında kümelendiğini göstermiştir. Tür delimitasyon analizleri ise en az dört genetik olarak farklılaşmış grubun varlığını açık biçimde ortaya koymuştur. Sonuç olarak, S. aegyptiaca'nın morfolojik olarak homojen görünmesine karşın, farklı evrimsel soylardan oluşan karmaşık bir genetik yapıya sahip olduğu görülmüştür. Bu bulgular, gözlenen yüksek genetik çeşitliliğin olası nedenlerinin anlaşılmasına ve türün mevcut taksonomik statüsünün bu veriler ışığında yeniden değerlendirilmesine ihtiyaç olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
In systematic studies, species are regarded as the fundamental units of biological classification, and accurate species delimitation is essential for the proper assessment of biodiversity. Silene aegyptiaca is an annual plant widely distributed throughout the eastern Mediterranean region. Recent molecular studies have revealed that S. aegyptiaca represents a species complex exhibiting considerable genetic diversity. However, these studies included only a limited number of samples from Turkey's Southeastern Anatolia Region and therefore did not fully capture the extent of genetic variation present in this area. The present study aims to identify the potentially divergent lineages of S. aegyptiaca occurring In Southeastern Anatolia within a multispecies coalescent (MSC) framework. To this end, DNA sequences were obtained from six unlinked loci commonly employed in previous phylogenetic analyses of the genus Silene, and the resulting dataset was analyzed using the STACEY method. The results are consistent with previous studies, indicating the presence of two to four distinct genetic lineages within the Southeastern Anatolian populations of S. aegyptiaca. The observed genetic diversity appears to be incongruent with the species' currently accepted taxonomic boundaries. STACEY analyses revealed that the examined populations represent discrete and independent evolutionary lineages, with these divergences being strongly supported by high posterior probability (PP) values. The inferred species tree showed that populations are clustered into five major groups, largely independent of their geographic distribution. Furthermore, species delimitation analyses identified at least four genetically differentiated lineages. In conclusion, although S. aegyptiaca appears morphologically homogeneous, it possesses a complex genetic structure comprising multiple evolutionary lineages. These findings underscore the importance of elucidating the underlying causes of the observed genetic diversity and suggest that the current taxonomic status of the species should be re-evaluated in light of these results.
Benzer Tezler
- Silene aegyptiaca farklı bitki kısımlarının toplam fenol içeriği, toplam indirgeme kuvveti tayini ve antioksidan özelliklerinin belirlenmesi
Determination of total phenolics, FRAP reducing power, and antioxidant capacity of different plant parts of Silene aegyptiaca
TÜLAY BÖYÜMEZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiKilis 7 Aralık ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAZIM ŞEKEROĞLU
- Species delimitation and phylogenetic relationships: A study of Silene sections Atocion and Cryptoneurae
Başlık çevirisi yok
ZEYNEP AYDIN
Doktora
İngilizce
2014
BiyolojiGoteborgs Unıversıtet (the Unıversıty Of Gothenburg)Biyolojik Bilimler Ana Bilim Dalı
DR. BENGT OXELMAN
DR. A. SELÇUK ERTEKİN
DR. BERNARD E. PFEIL
- Güneydoğu Anadolu bölgesinde yetişen bazı Silene L. (Caryophyllaceae) türleri ile morfolojik ve anatomik çalışmalar
The morphological and anatomical studies of some Silene L. (Caryophyllaceae) species grown in Southeastern Anatolia region
YASEMİN AKGÖZ
- Caryophyllaceae familyasına ait bazı türlerin antimikrobiyal aktivitelerinin incelenmesi
Investigation of the antimicrobial activity of some species belonging to Caryophyllaceae family
HAJER M. SEÇHAYER EL GHERIANI
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyolojiKastamonu ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERGİN MURAT ALTUNER
- Diyarbakır ili bağ üretim alanlarında sorun olan yabancı ot türlerinin araştırılması
Investigation of weed species vineyard production areas of Diyarbakir province
ESMANUR PEKCAN KAÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatDicle ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CUMALİ ÖZASLAN