Karaciğer sirozu ve karaciğer sirozuna sekonder gelişmiş hepatosellüler karsinom olgularında uzun kodlamayan RNA'lara ait ekspresyonların değerlendirilmesi
Evaluation of long non-coding RNA expression in liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma secondary to liver cirrhosis
- Tez No: 983063
- Danışmanlar: PROF. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Onkoloji, Tıbbi Biyoloji, Genetik, Oncology, Medical Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Hepatosellüler karsinom, Karaciğer sirozu, Long noncoding RNA, Serum biyobelirteci
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Kanser Biyolojisi ve İmmünolojisi Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Giriş ve Amaç: Hepatosellüler karsinom (HCC), en sık görülen primer karaciğer kanseri olup oldukça kötü bir prognoza sahiptir. Karaciğer sirozu gibi yüksek riskli popülasyonlarda HCC gelişimini erken tespit edebilmek, yeni tedavi hedefleri keşfedebilmek oldukça önemlidir. HCC'de epigenetik mekanizmaların daha iyi anlaşılması bu yolda ilerlemenin önünü açacaktır. Yaptığımız çalışmada belirlenmiş 84 lncRNA'nın HCC, siroz ve sağlıklı kontrollerdeki ekspresyon değişimleri analiz edilmiş; siroz ve siroz zemininde HCC gelişiminde lncRNA'ların rollerine dair keşifsel sonuçların elde edilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Araştırma; gözlemsel ve kesitsel bir olgu-kontrol çalışması olarak planlanmış ve 2023-2024 yıllarında Ege Üniversitesi Gastroenteroloji Kliniğine başvuran 20 HCC tanılı hasta, 18 siroz tanılı hasta ve 20 sağlıklı gönüllü çalışmaya dahil edilmiştir. Çalışmaya alınan her kişiden periferik kan örneği toplanmış ve önceden tanımlanmış belirli sayıda hedef lncRNA içeren bir ticari panel kullanılarak lncRNA ekspresyonları analiz edilmiştir. Bulgular: Çalışmadaki katılımcıların medyan yaşı 61'dir. HCC grubunda medyan yaş 67 iken siroz grubunda 62, sağlıklı kontrol grubunda ise 55'tir (p<0,001). Tüm katılımcıların 39'u (%67,2) erkek, 19'u (%32,8) ise kadındır. HCC grubunda erkek/kadın oranı 19/1 iken siroz grubunda bu oran 10/8 ve kontrol grubunda 10/10'dur (p: 0,004). Çalışmadaki hastaların 23'ü (%60,5) çalışma sürecinde hayatını kaybetmiştir. HCC grubundaki hastalarda ölüm sayısı 18 (%90) iken siroz grubunda ölen hasta sayısı 5'tir (%27,8) (p<0,001). Gruplar arasındaki lncRNA ekspresyon değişimleri analiz edildiğinde HCC ve siroz grubu arasında ekspresyonları istatistiksel olarak anlamlı şekilde değişen lncRNA'lar şunlardır: IGF2AS, NRON, p21, Alpha 250, KRASP1, UCA1, HOXA-AS3, antiPeg11, BC200, 7SK, H19 upstream, HAR1A, HOTTIP, HOXA11-AS, SRA, Nespas, DIO3OS, Kcnq1ot1, MEG3, NDM29, Alpha 280, Jpx, E2F4 antisense, SNHG1, H19 antisense, EMX2OS, ANRIL, Air, SNHG5, PSF inhibiting, Gomafu, MEG9, SNHG3. Bu lncRNA'ların tümü HCC hastalarında siroz hastalarına göre düşük ekspresyon göstermiştir. Yapılan ROC analizinde HCC ve siroz gruplarını ayırt etmede AUC'leri en yüksek olan lncRNA'lar ise IGF2AS (AUC:0,99), UCA1 (AUC: 0,89), Alpha 250 (AUC: 0,89), NRON (AUC: 0,88), KRASP1 (AUC: 0,87), p21 (AUC: 0,87), HOXA-AS3 (AUC: 0,86), antiPeg11(AUC: 0,86), BC200 (AUC: 0,86), 7SK (AUC: 0,84), HAR1A (AUC: 0,83), H19 upstream (AUC: 0,83), HOXA11-AS (AUC: 0,82), HOTTIP (AUC: 0,82), Kcnq1ot1 (AUC: 0,80), MEG3 (AUC: 0,80) olarak bulunmuştur. Sonuç: HCC hastalarının plazmalarında siroz hastalarına göre ekspresyonları belirgin şekilde azalan ve HCC-siroz ayrımında tanısal biyobelirteç olarak en yüksek potansiyele sahip lncRNA'lar IGF2AS, UCA1, Alpha 250, NRON, KRASP1, p21, HOXA-AS3, antiPeg11 ve BC200'dür.
Özet (Çeviri)
Introduction and Aim: Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common primary liver cancer and is associated with a poor prognosis. In high-risk populations such as those with liver cirrhosis, early detection of HCC and the discovery of novel therapeutic targets are of great importance. A better understanding of epigenetic mechanisms in HCC may facilitate such progress. In this study, the expression profiles of 84 predefined long non-coding RNAs (lncRNAs) were analyzed in patients with HCC, cirrhosis, and healthy controls to explore potential roles of lncRNAs in cirrhosis and in HCC arising on a cirrhotic background. Materials and Methods: This observational, cross-sectional case–control study included 20 patients with HCC, 18 with liver cirrhosis, and 20 healthy volunteers who presented to the Gastroenterology Department of Ege University between 2023 and 2024. Peripheral blood samples were collected from all participants, and lncRNA expression was analyzed using a commercial qPCR array panel containing a set of predefined lncRNA targets. Results: The median age of all participants was 61 years. Median ages were 67, 62, and 55 years in the HCC, cirrhosis, and control groups, respectively (p < 0.001). Of all participants, 39 (67.2%) were male and 19 (32.8%) were female. The male-to-female ratio was 19/1 in the HCC group, 10/8 in the cirrhosis group, and 10/10 in the control group (p = 0.004). During follow-up, 23 patients (60.5%) died 18 (90%) in the HCC group and 5 (27.8%) in the cirrhosis group (p < 0.001). Comparative analysis of lncRNA expression among groups revealed that the following lncRNAs showed statistically significant differences between HCC and cirrhosis: IGF2AS, NRON, p21, Alpha-250, KRASP1, UCA1, HOXA-AS3, antiPeg11, BC200, 7SK, H19-upstream, HAR1A, HOTTIP, HOXA11-AS, SRA, Nespas, DIO3OS, Kcnq1ot1, MEG3, NDM29, Alpha-280, Jpx, E2F4-antisense, SNHG1, H19-antisense, EMX2OS, ANRIL, Air, SNHG5, PSF-inhibiting, Gomafu, MEG9, and SNHG3. All of these lncRNAs were expressed at lower levels in the HCC group than in the cirrhosis group. Receiver operating characteristic (ROC) analysis identified lncRNAs with the highest diagnostic performance (AUC values) in differentiating HCC from cirrhosis as follows: IGF2AS (0.99), UCA1 (0.89), Alpha-250 (0.89), NRON (0.88), KRASP1 (0.87), p21 (0.87), HOXA-AS3 (0.86), antiPeg11 (0.86), BC200 (0.86), 7SK (0.84), HAR1A (0.83), H19-upstream (0.83), HOXA11-AS (0.82), HOTTIP (0.82), Kcnq1ot1 (0.80), and MEG3 (0.80). Conclusion: lncRNAs that exhibited markedly decreased plasma expression in HCC compared with cirrhosis—and demonstrated the highest diagnostic potential in distinguishing HCC from cirrhosis—were IGF2AS, UCA1, Alpha-250, NRON, KRASP1, p21, HOXA-AS3, antiPeg11, and BC200. These findings suggest that circulating lncRNAs may serve as promising non-invasive biomarkers for the early detection of HCC in patients with liver cirrhosis. Keywords; Hepatocellular carcinoma; Liver cirrhosis; Long noncoding RNA; Serum markers
Benzer Tezler
- Canlı vericili karaciğer nakillerinde hepatik arter mikroanastomozu sonuçlarımız 46 hastada retrospektif bir çalışma
Başlık çevirisi yok
ENSAR ZAFER BARIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiAtatürk ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖNDER TAN
- Kliniğimize başvuran karaciğer siroz tanılı hastaların etyolojik, demografik ve prognostik parametrelerinin değerlendirilmesi
Evaluation of the etiological, demographic and prognostic parameters of patients with liver cyrosis WHO refer to OUR clinic
ENES GÜNHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
İç HastalıklarıSüleyman Demirel Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMET CEM KOÇKAR
- Hepatosellüler karsinom tanılı sirotik hastalarda karaciğer sirozu etyolojisinin sürviye etkisi
Effect of liver cirrhosis etiology on survival in cirrhotic patients with HCC
ÇINAR YILDIRIM
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2015
OnkolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT KIYICI
- Erken evre karaciğer siroz'unda meydana gelen morfolojik değişikliklerin BT ve MRG ile araştırılması
Investigation of morphological changes in early stage liver cirrhosis with CT and MRI
BARIŞ CAN ARSLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Radyoloji ve Nükleer TıpZonguldak Bülent Ecevit ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. BANU ALICIOĞLU
- Alkolik sirozun ayırıcı tanısında değerli olabilecek biokimyasal yöntemlerin değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
DİLEK ÖZMEN