Akkaraman ve Morkaraman koyun ırkları ile Kazak Edilbay yerli koyun ırkı arasındaki genetik benzerliğin mtDNA D-Loop bölgesi DNA dizi analizi ile araştırılması
Investigation of the genetic similarity between Akkaraman and Morkaraman sheep breeds and Kazakh Edilbay native sheep breed by using DNA sequence analysis in the mtDNA D-Loop region
- Tez No: 975130
- Danışmanlar: PROF. DR. UĞUR ŞEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyoteknoloji, Genetics, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Akkaraman koyunları, Filogenetik, Mitokondriyal DNA, Morkaraman koyunları, Akkaraman sheep, Phylogenetic, Mitochondrial DNA, Morkaraman sheeps
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mitokondriyal DNA, kökenlerinin belirlenmesi, biyocoğrafik dağılımlarının belirlenmesi, alt türler içerisindeki haplotiplerin belirlenmesi, popülasyonlar içindeki/arasındaki genetik çeşitliliğin hesaplanması, popülasyonların genetik benzerliklerinden yararlanılarak filogenetik ilişkilerin tespit edilmesi gibi çalışmalarda moleküler belirteç (özellikle D-loop ve Sitokrom b gen bölgeleri) olarak kullanılmaktadır. Bir türe veya farklı türlere ait ırkların genetik orijinlerinin belirlenmesinde mitokondrial DNA (mtDNA) ile ilgili birçok çalışma bulunmaktadır. Dolayısıyla bu çalışmanın amacı, Türkiye'de yetiştirilen Akkaraman ve Morkaraman yağlı kuyruklu koyun ırkları ile Kazakistan'da yetiştirilen yağlı kuyruklu Edilbay yerli koyun ırkı arasındaki genetik benzerliğin mtDNA D-Loop bölgesi DNA dizi analizi ile belirlenmesidir. Çalışmada Akkaraman, Morkaraman ve Kazak Edilbay ırkı koyun ve koçlardan alınan kan örnekleri deneme materyali olarak kullanımıştır. Alınan örneklerden“tuz çöktürme”DNA izolasyonu prosedürü uygulanarak mitokondrial D-loop bölgesinin amplifikasyonu yapılmış ve sonrasında DNA dizisi ilgili bir takım moleküler veri analizler gerçekleştirilmiştir. Farklılık veya benzerlikleri daha iyi ayırt etmek adına DNA veri analizine pozitif kontrol olarak İvesi ırkı koyunların DNA'ları dahil edilmiştir. Analizler sonucunda çalışılan koyun popülasyonlarında toplam 40 polimorfik bölge ve 77 farklı haplotip tespit edilmiştir. Tüm popülasyonlar birlikte ele alındığında haplotip çeşitliliği ve nükleotid çeşitliliği 0,992±0,008 ve 0,01895 olarak hesaplanmıştır. Çalışılan popülasyonlardan birbirine en uzak popülasyonların İvesi ve Akkaraman popülasyonları olduğu tespit edilmiştir ve bu iki popülasyon arasındaki genetik mesafe 0,026 olarak hesaplanmıştır. Morkaraman ve Edilbay popülasyonları en yakın popülasyon olduğu ortaya konulmuştur. Aralarındaki genetik mesafenin 0,015 olarak tahmin edilmiştir. Çalışılan popülasyonlar içinde İvesi ırk koyunları hariç tüm koyunlarda tüm haplogruplar temsil edilmiş olup, B haplogrubu (% 42) olarak hesaplanmıştır.
Özet (Çeviri)
Mitochondrial DNA is used as a marker (especially D-loop and Cytochrome b gene segments) for determining origins, biogeographic distribution, haplotype identification within subspecies, and phylogenetic determination of genetic distribution within and between segments using genetic segments of segments. Numerous studies have used mitochondrial DNA (mtDNA) to determine the genetic origins of breeds belonging to the same species or different species. Therefore, the aim of this study is to determine the genetic similarity between the Akkaraman and Morkaraman fat-tailed sheep breeds raised in Turkey and the Edilbay fat-tailed indigenous sheep breed raised in Kazakhstan by DNA sequence analysis of the mtDNA D-Loop region. In the study, blood samples taken from Akkaraman, Morkaraman and Kazakh Edilbay breed sheep and rams were used as experimental material. A salt precipitation DNA extraction procedure was used to amplify the mitochondrial D-loop region from the collected samples, and then a series of molecular data analyses were performed on the DNA sequence. In order to better distinguish differences or similarities, DNAs of Awassi sheep were included as positive controls in the DNA data analysis. The results were evaluated to determine the genetic similarity and degree of relatedness between the breeds. As a result of the analyses, a total of 40 polymorphic regions and 77 different haplotypes were identified in the studied sheep populations. When all populations were considered together, haplotype diversity and nucleotide diversity were calculated as 0,992±0,008 and 0,01895. The Awassi and Akkaraman populations were found to be the most distant from each other, and the genetic distance between these two populations was calculated as 0,026. The Morkaraman and Edilbay populations were found to be the closest, with a genetic distance estimated as 0,015. Within the studied populations, all haplogroups were represented in all sheep except the Awassi sheep breeds, and haplogroup B (42%) was calculated.
Benzer Tezler
- Türkiye ve Pakistan Koyun Irkları arasındaki mtDNA D-loop ilişkisinin araştırılması
Investigation of relationship between mtDNA D-loop among Turkish and Pakistani Sheep Breeds
MUHAMMAD SHAHZAD HUSSAIN
Doktora
Türkçe
2022
GenetikAfyon Kocatepe ÜniversitesiMedikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN ERDOĞAN
- Reassessment of genetic diversity in native turkish sheep breeds with large numbers of microsatellite markers and mitochondrial DNA (MTDNA)
Yerli türk koyun ırklarının genetik çeşitliliklerinin yüksek sayıda mikrosatelit belirteçleri ve mitokondriyal DNA (MTDNA) ile yeniden araştırılması
ŞÜKRÜ ANIL DOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ TOGAN
- Farklı ırklardaki koyun ve keçilerde serum b12 vitamini ve kobalt düzeylerinin araştırılması
Investigation of serum vitamin B12 and cobalt levels in different sheep and goats races
AHMET ANIL ERTÜRKÜNER
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiFırat Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA İSSİ
- Bazı koyun ırklarında kafeinin farmakokinetiği ve metabolizmasının karşılaştırılması
Comparisons of caffeine pharmacokinetics and metabolisms in some sheep breeds
KAMİL ÜNEY
Doktora
Türkçe
2007
Eczacılık ve FarmakolojiSelçuk ÜniversitesiVeterinerlik Farmakoloji ve Toksikolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. BÜNYAMİN TRAŞ
- Türkiye'de yetiştirilen bazı koyun ırklarında MHC (Major histocompatibility complex) gen bölgesinde genetik varyasyonun belirlenmesi
The identification of genetic variation in MHC (Major histocompatibility complex) gene region in some Turkish sheep breeds
FATMA İLHAN