Kistik fibrozisin erken tanısına yönelik tanı kiti geliştirilmesi
Development of diagnostic kit for early diagnosis of cystic fibrosis
- Tez No: 974997
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MELAHAT BAĞIROVA, DOÇ. DR. FATIMA YÜCEL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: ELISA, Immun reaktif tripsinojen, Kistik fibroz, Immune reactive trypsinogen, Cystic fibrosis
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kistik fibrozis (KF), otozomal resesif (çekinik) geçiş gösteren, beyaz ırkta en sık rastlanan genetik-metabolik bir hastalıktır ve Türkiye'de her 2.500 – 3.000 bebekten birinde görülmektedir. Akciğer, pankreas, bağırsak, ter bezleri ve dış salgı bezleri gibi vücudun birden çok sistem ve organını aynı anda etkileyebilen hastalıktır. Hastalığın erken tespit edilmesi, hastaların yaşam kalitesini artırmak ve etkili bir tedavi stratejisi başlatmak için çok önemlidir. Bu nedenle son yıllarda KF, ABD, Yeni Zelanda, çoğu Avrupa ülkesi ve Türkiye gibi birçok ülkede yeni doğan tarama programlarına dâhil edilmiştir. KF'li yenidoğanlarda kan IRT düzeyleri genel olarak yüksektir fakat yenidoğan bebeklerde yüksek oranda yalancı pozitif test sonuçlarının varlığı nedeniyle, pozitif sonuçlar doğrulayıcı testlerle (IRT, PAP, DNA testi) izlenmelidir. Böylece kontrollü ve hızlı tarama test sonucuna ulaşılması mümkün olabilmektedir. Bu çalışmada KF hastalığının erken tanısında kullanmak üzere IRT ELISA kitlerinin geliştirilmesi çalışmaları yer almaktadır. ELISA kitlerinde kullanmak üzere IRT'ye karşı monoklonal antikorlar geliştirildi, saflaştırıldı ve karakterize edildi. IRT proteinlerini kantitatif ölçmek için iki adımlı sandviç ELISA yöntemi kullanıldı. Ticari IRT antijeni kullanılarak standartlar ve model kan spotları hazırlandı. Geliştirilen monoklonal antikorların yakalama ve bağlama özellikleri araştırıldı, sandviç ELISA kit tasarımları ve optimizasyon çalışmaları yapıldı. MAM-IRT1, MAM-IRT2 ve MAM-IRTmix ELISA prototiplerinin Ankara Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü'nün (HSGM) Yenidoğan tarama testleri laboratuvarında saha çalışmaları gerçekleştirildi. Geliştirilen kitlerle gerçek bebek kan spotlarından elde edilen sonuçlarla ROC ve Bayes yöntemleri kullanılarak tanı kiti performans analizi yapıldı. ROC performans analizine göre; MAM-IRTmix kitinin sonuçları, HSGM tarafından uygulanan rutin IRT test sonuçlarıyla %100 uyumlu olduğu görülmüştür. MAM-IRT1 ve MAM-IRT2 kitlerinin sonuçları ise sırasıyla %98,6 ve %97,6 uyumlu olduğu görüldü. Bayes ile yapılan analizde ise, MAM-IRT2 kitinin rutin uygulanan IRT testine göre %2 daha seçici olabileceği görüldü.
Özet (Çeviri)
Cystic fibrosis (CF), autosomal recessive inherited, is the most common genetic-metabolic disease in the Caucasian race and is seen in one out of every 2,500 – 3,000 newborns in Turkey. It is a disease that can affect multiple systems and organs of the body at the same time, such as the lungs, pancreas, intestines, sweat glands and exocrine glands. Early detection of the disease is very important to improve the quality of life of patients and to initiate an effective treatment strategy. Therefore, in recent years, CF has been included in newborn screening programs in many countries such as the USA, New Zealand, most European countries and Turkey. Blood IRT levels are generally high in newborns with cystic fibrosis, but positive results should be followed up with confirmatory tests (IRT, PAP, DNA testing) because of the high rate of false positive test results in newborn babies. Thus, it is possible to reach a controlled and rapid screening test result. This study includes the development of IRT ELISA kits to be used in the early diagnosis of CF disease. Monoclonal antibodies against IRT were developed, purified and characterized for use in ELISA kits. Two-step sandwich ELISA method was used to quantitatively measure IRT proteins. Standards and model blood spots were prepared using commercial IRT antigen. The capture and binding properties of the developed monoclonal antibodies were investigated, sandwich ELISA kit designs and optimization studies were carried out. Field studies of IRT1, IRT2 and IRT Mix ELISA prototypes were carried out in Turkish Public Health Institution, Ankara. Diagnostic kit performance analysis of the developed kits was performed via ROC and Bayes methods with the results obtained from real baby blood spots. According to ROC performance analysis, the results of the MAM-IRTmix kit were found to be 100% consistent with the routine IRT test results performed by Turkish Public Health Institution. The results of MAM-IRT1 and MAM-IRT2 kits were found to be 98,6% and 97,6% compatible, respectively. In the analysis performed with Bayes, it was seen that the MAM-IRT2 kit could be 2% more specific than the routinely applied IRT test.
Benzer Tezler
- Kistik fibrozisin erken tanısına yönelik IRT2'ye karşı monoklonal antikor geliştirilmesi
Monoclonal antibody production against IRT2 for cystic fibrosis early diagnosis
TUĞÇE NUR ERALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANU MANSUROĞLU
DOÇ. DR. FATIMA YÜCEL
- Kistik fibrozis-dışı bronşektazi tanılı çocuklarda ekshale nitrik oksit düzeyinin etiyolojideki yeri
Başlık çevirisi yok
TANER ADIGÜZEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. BÜLENT TANER KARADAĞ
- Kistik fibrozis tanılı çocuk hastalarda kistik fibrozis karaciğer hastalığının biyokimyasal ve radyolojik olarak değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
NURGÜL TOPBAŞOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENGİN TUTAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ BİLGE ŞAHİN AKKELLE
- Farklı solunum yolu hastalarında gastroözofageal reflü hastalığı sıklığı ve yaşam kalitesi üzerine etkisi
Frequency of gastroesophageal reflux disease in patients with different respiratory tract diseases and its impact on quality of life
ÖZGE YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıCelal Bayar ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ERHUN KASIRGA
- Tekrarlayan alt solunum yolu enfeksiyonu ve kronik akciğer hastalığı olan çocuklarda yeni nesil dizilemenin uygulanması
Application of next-generation sequencing in children with recurrent lower respiratory tract infections and chronic lung disease
MUSTAFA GÜNEŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Genetikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF YILMAZ GÜLEÇ