İshalli atlardan ve sığırlardan Clostridium difficile izolasyonu ve genotiplendirilmesi
Isolation and genotyping of Clostridium difficile from horses and cattle with diarrhe
- Tez No: 974929
- Danışmanlar: PROF. DR. UÇKUN SAİT UÇAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Clostridioides difficile, Gram-pozitif, sporlu ve zorunlu anaerob bir bakteridir. Spor formu sayesinde çevresel koşullara uzun süre dayanabilir ve dışkı yoluyla yayılabilir. Başlangıçta insan gastrointestinal sistem mikrobiyotasının bir üyesi olarak değerlendirilmiş, 1978 yılında toksin üreten bir patojen olduğu anlaşılmış ve antibiyotik ilişkili ishal ile psödomembranöz enterokolit vakalarıyla ilişkilendirilmiştir. İzleyen yıllarda özellikle hastane kaynaklı ishal olgularında öne çıkmış ve önemli bir gastrointestinal enfeksiyon etkeni olarak kabul edilmiştir. Antibiyotik kullanımı, yaş, kemoterapötik ajanlar ve yanlış beslenme gibi etkenlerle mikrobiyotanın bozulduğu durumlarda, toksijenik suşlar toksin üretimi yoluyla hastalık oluşturabilmektedir. Etkenin yalnızca insanlardan değil; çiftlik hayvanları, yaban hayatı, çevresel kaynaklar ve çeşitli gıda ürünlerinden de izole edilebilmesi, ayrıca insan ve hayvan kaynaklı suşlar arasında bildirilen genotip benzerlikleri, zoonotik potansiyeline işaret etmektedir. Bu durum, C. difficile'nin Tek Sağlık yaklaşımı çerçevesinde değerlendirilmesini gerekli kılmaktadır. Enfeksiyonun neden olduğu tedavi maliyetleri, iş gücü kaybı, üretim düşüşü ve hastane yatış sürelerindeki artış, hem sağlık sistemleri hem de hayvancılık ekonomisi üzerinde önemli bir yük oluşturmaktadır. Bu tez çalışmasında, Konya bölgesinde ishal görülen at ve sığırlarda C.difficile varlığı araştırılmıştır. Toplam 171 at dışkı örneği bakteriyolojik kültür yöntemiyle incelenmiş, pozitif bulguya rastlanmamıştır. Toksin A/B ELISA ile bu 171 örnekden 23 tanesi test edilmiş 2 adet numune Toksin A/B ELISA pozitif bulunmuştur. Sığırlardan alınan 116 örnek; bakteriyolojik kültür, 88 örnek RT-PCR, 71 örnek de Toksin A/B ELISA yöntemiyle analiz edilmiştir. PCR incelemesi sonucunda 9 örnek toksin pozitif bulunmuş ve bu örneklerin tamamında toksin A (tcdA) genine rastlanmıştır. Bu örneklerden birinde toksin B (tcdB) ve ikili toksin (cdtA/cdtB) genleri de tespit edilmiştir. Toksin A/B ELISA analizinde ise 16 örnek pozitif sonuç vermiştir. Kültür sonuçlarında izolasyon olmamıştır. Bölgesel düzeyde gerçekleştirilen bu çalışma, buzağı örneklerinde toksijenik C.difficile varlığını moleküler olarak belirlemiş; elde edilen bulgular, bu etkenin ishal vakalarında tanıda dikkate alınması gerektiğini göstermektedir. Ayrıca elde edilen veriler, C. difficile ile ilgili ileride yapılacak çalışmalara katkı sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Clostridioides difficile is a Gram-positive, spore-forming, and obligate anaerobic bacterium. Due to its spore form, it can survive under harsh environmental conditions for extended periods and may spread via fecal transmission. Initially considered a component of the human gastrointestinal microbiota, it was identified in 1978 as a toxin-producing pathogen and linked to antibiotic-associated diarrhea and pseudomembranous enterocolitis. In the following years, it became especially prominent in healthcare-associated diarrhea cases and was recognized as a significant gastrointestinal infectious agent. When the gut microbiota is disrupted by factors such as antibiotic use, advanced age, chemotherapeutic agents, or malnutrition, toxigenic strains can proliferate and cause disease through toxin production. The isolation of the bacterium not only from humans but also from farm animals, wildlife, environmental sources, and various food products, along with reported genotypic similarities between human- and animal-derived strains, highlights its zoonotic potential. This necessitates the evaluation of C. difficile within the One Health framework. The infection causes considerable burden on healthcare systems and livestock economies due to increased treatment costs, productivity losses, extended hospitalization, and workforce depletion. This study aimed to investigate the presence of Clostridioides difficile in horses and cattle with diarrhea in the Konya region. A total of 171 horse fecal samples were examined using the bacteriological culture method, and no positive findings were detected. Among these, 23 samples were tested by Toxin A/B ELISA, and two samples were found to be positive for Toxin A/B. From cattle, 116 samples were analyzed by bacteriological culture, 88 by RT-PCR, and 71 by Toxin A/B ELISA. PCR analysis revealed nine toxin-positive samples, all of which carried the toxin A (tcdA) gene. In one of these samples, the toxin B (tcdB) and binary toxin (cdtA/cdtB) genes were also detected. Toxin A/B ELISA analysis yielded 16 positive results, while no isolates were obtained by bacteriological culture. This regionally conducted study molecularly confirmed the presence of toxigenic C. difficile in calf samples. The findings suggest that this pathogen should be considered in the differential diagnosis of diarrheal cases. Moreover, the data obtained may contribute to future studies on C. difficile.
Benzer Tezler
- Rotavirus gastroenteritine bağlı akut ishal nedeniyle hastanede yatan çocuklarda klinik özellikler
The clinical featuires in hospitalized children with rotavirus acute gastroenteritis
GÜLAY IŞILDAK PAMUK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıFatih ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADİ TÜRKAY
- İshalli buzağı ve çocuklardan izole edilen campylobacterlerin identifikasyonu ile antibiyotikleri duyarlılıkları üzerinde çalışmalar
Studies on sensitivity to antibiotics and identifications of the campylobacter strains isolated from diarrhoeic childs and calves
ABDULLAH YANARATEŞ
- İshalli ve asemptomatik kişilerin dışkılarında C. difficile ve toksinleri ile diğer enterik patojenlerin insidansı
The Incidence of C. difficile, C. difficile toxins and the other enteric pathogenic microorganisms in stool of patients with diarrhea and asemptomatic persons
PERVİN KARAER
- İshalli buzağılar ve septisemili tavuklardan izole edilen E. Coli'lerin adhezinleri (K99, K88, F41, 987P ve tip 1 fimbria) ve enterotoksinleri (ST a ve VT) üzerinde çalışmalar
Studies on adhesins (K99, K88, F41, 987P and type-1 fimbriae) and enterotoxins (STa and VT) of E. coli strains isolated from calves with diarrhoea and hens with septisemiae
MUHAMMET AKSIN