Glioblastoma tedavisine yönelik CRISPR/Cas9 aracılı gen düzenleme için lipit bazlı nano taşıyıcı sistemlerin geliştirilmesi
Development of CRISPR/Cas9 mediated lipid based nanocarrier systems for gene editing in glioblastoma treatment
- Tez No: 972790
- Danışmanlar: PROF. DR. NESLİHAN ÜSTÜNDAĞ OKUR, DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRE ŞEFİK ÇAĞLAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Nöroloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Neurology, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
- Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Farmasötik Teknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Glioblastoma Multiform, merkezi sinir sistemindeki en yaygın birincil beyin tümörü türüdür ve oldukça agresif bir yapısı bulunmaktadır. En ölümcül kanserlerden biri olmakla beraber, mevcut tedavi yöntemlerinin etkisiz kalması nedeniyle sağkalım oranları oldukça düşüktür. Bu tez çalışması ile CRISPR/Cas9 aracılı genom düzenlemesinde kullanılabilecek, yüksek transfeksiyon etkinliğine sahip lipit bazlı nano taşıyıcı sistemler geliştirilmiştir. Gereç ve Yöntem: Bu çalışma kapsamında, Cas9 ve rehber RNA sekanslarını içeren plazmid DNA çoğaltılmış ve nanoyapılı lipit taşıyıcılarla kompleks (NLC-DOTMA-pDNA) oluşturulmuştur. Kompleksin oluşumu agaroz jel elektroforezi kullanılarak doğrulanmıştır. U87-MG hücreleri kompleks, PEI ve Lipofectamine2000'in transfeksiyon etkinliğinin incelenmesi için kullanılmıştır. 48. saatin sonunda hücresel sağkalım, transfeksiyon etkinliği ve hücre morfolojisi konfokal mikroskop görüntülemesiyle değerlendirilmiştir. Bulgular: CRISPR sistemini taşıyan NLC-DOTMA-pDNA formülasyonu, U87 hücre hattında yüksek oranda transfeksiyon etkinliği göstermiştir. Kontrol grupları ile kıyaslandığında, geliştirilen formülasyonun transfeksiyon etkinliğinin sıkça kullanılan transfeksiyon ajanlarına kıyasla daha yüksek olduğu, hücre ölümünün ise daha az olduğu gözlenmiştir. Hazırlanan nanoyapılı lipit taşıyıcı sistem hücre yapısını koruyarak apoptoz oranlarını düşük düzeyde tutmuştur. Sonuç: Elde edilen bulgular, geliştirilen nanoyapılı lipit taşıyıcı sistemin CRISPR/Cas9 temelli gen düzenleme için etkili ve aynı zamanda güvenli bir yöntem olabileceğini ortaya koymaktadır. Yüksek transfeksiyon verimi ve düşük toksisite profili, glioblastoma tedavisine alternatif yaklaşım sunmaktadır.
Özet (Çeviri)
Aim: Glioblastoma Multiform is the most common primary brain tumor in the central nervous system and is highly aggressive. It is one of the most lethal cancers, and survival rates are quite low due to the ineffectiveness of current treatment methods. This thesis aims to develop lipid-based nanocarrier systems with high transfection efficiency that can be used in CRISPR/Cas9-mediated genome editing. Materials and Methods: In this study, plasmid DNA containing Cas9 and guide RNA sequences was amplified, and a complex (NLC-DOTMA-pDNA) was formed with nanostructured lipid carriers. The formation of the complex was confirmed using agarose gel electrophoresis. U87-MG cells were used to examine the transfection efficiency of the complex, PEI, and Lipofectamine2000. Cellular survival, transfection efficiency, and cell morphology were assessed by confocal microscopy at 48 hours. Results: The NLC-DOTMA-pDNA formulation carrying the CRISPR system demonstrated high transfection efficiency in the U87 cell line. Compared to control groups, the developed formulation demonstrated higher transfection efficiency than commonly used transfection agents, while resulting in less cell death. The prepared nanostructured lipid carrier system preserved cell structure with no apoptosis. Conclusion: The findings suggest that the developed nanostructured lipid carrier system may be an effective and safe method for CRISPR/Cas9-based gene editing. Its high transfection efficiency and low toxicity profile make this approach an attractive alternative for future studies in glioblastoma treatment.
Benzer Tezler
- Interrogating the role of arginine methyltransferases in radiation response in glioma
Arginin metiltransferazların gliomda radyasyon yanıtındaki rolününün incelenmesi
BEYZA NUR KÖSEOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Moleküler TıpKoç ÜniversitesiTıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUĞBA BAĞCI ÖNDER
- Drug repurposıng and ınvestıgatıon of novel combınatıons for glıoblastoma therapeutıcs usıng ın vıtro and zebrafısh ın vıvo models
İlacin yeniden konumlandırılması ve glioblastoma tedavisine yönelik yeni kombinasyonların in vitro ve zebrafish in vivo modeller kullanılarak araştırılması
GÜNEŞ TOK
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Genetikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEN KONU KARAKAYALI
- A new generation of molecular probes with red-shifted emission towards effective fluorescence imaging and treatment of cancer cells
Kanser hücrelerinin etkin floresans görüntülemeleri ve tedavisine yönelik kızıla kayan emisyona sahip yeni nesil moleküler problar
GİZEM ATAKAN ALKAN
Doktora
İngilizce
2023
KimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRULLAH GÖRKEM GÜNBAŞ
DOÇ. DR. SAFACAN KÖLEMEN
- Glioblastoma hücrelerinde sinir büyüme faktörünün PAK4 regülasyonu üzerindeki etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of nerve growth factor on PAK4 regulation in glioblastoma cells
SULTAN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SURAY PEHLİVANOĞLU
- Nöroblastoma ve glioblastoma kaynaklı eksozomların dejenere edilen nöral hücreler üzerindeki olası koruyucu etkisinin in vitro olarak incelenmesi
In vitro investigation of the potential protective effect of neuroblastoma and glioblastoma-derived exosomes on degenerating neuronal cells
EMRE VURAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEGÜL YILDIZ