Geri Dön

İnsan irisin proteininin domates - Solanum lycopersicum L. - meyve dokusunda ekspresyonu

Expression of human irisin protein in tomato - Solanum lycopersicum L. - fruit tissue

  1. Tez No: 971016
  2. Yazar: ÜMAY ASLAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT, PROF. DR. SEMİHA ERİŞEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İrisin, ilk kez 2012 yılında keşfedilen ve FNDC5'in proteolitik bir ürünü olan miyokin benzeri bir peptit hormonudur. Farklı doku ve organlarda hücre yüzey reseptörlerine bağlanıp sinyal yolaklarına katılarak çeşitli fizyolojik fonksiyonlar sergilemektedir. En önemli fonksiyonları arasında beyaz adipositleri esmerleştirme, glikoz metabolizmasını düzenleme, osteoblast proliferasyonunu artırma ve kanser hücrelerinin metastazını azaltma bulunmaktadır. Yapılan çalışmalar, irisinin özellikle obezitenin tedavisinde potansiyel bir farmasötik protein olarak işlev gördüğünü göstermiştir. Günümüzde bu sağlık sorununa bağlı olarak gelişen kardiyovasküler hastalıkların sıklığında artış görülmektedir. Bu bağlamda, irisinin adipoz dokulardaki UCP1 geninin ekspresyonundaki artışı sağlayarak termogenez ve kilo kaybını takiben enerji metabolizmasının düzenlenmesinde anahtar bir rol oynadığı kanıtlanmıştır. Bu bilgiler ışığında,“Gateway Klonlama Sistemi”kullanılarak irisin dizisinin pdonor207 ve pK7WGF2 vektörlerine yüksek verimlilikte klonlanması sağlanmıştır. E.coli DH5α transformasyonu ve koloni PCR ile doğrulama çalışmalarının ardından Sanger dizileme ile insert oryantasyonunun analizi gerçekleştirilmiştir. Geçici bitki transformasyonu için, A.tumefaciens GV3101 transformasyonunu takiben ticari satıcıdan temin edilen küçük ve orta boy domates meyvelerine şırınga enjeksiyonu gerçekleştirilmiştir. Agroinfiltrasyon çalışması, protein ekspresyon verimliliğinin artırılması amacıyla optimizasyon sonuçları baz alınarak tasarlanmıştır. Protein ekspresyonunun ardından, standart PCR reaksiyonu ile irisin sekansının domates meyvesine aktarımının kalitatif doğrulaması yapılmıştır. Bununla birlikte, Real-Time PCR çalışması ile domates meyvelerinin mRNA ekspresyon seviyeleri karşılaştırılmış ve bulgular istatistiksel olarak desteklenmiştir. Sonuçlar, küçük boy domates meyvelerindeki irisin ekspresyon seviyesinin daha yüksek olduğunu göstermiştir. Transkripsiyon düzeyinde doğrulamanın ardından, Western Blot analizi gerçekleştirilmiştir. Sonuçlar, irisinin beklenen moleküler ağırlıkta eksprese edildiğini ve glikozile formunun üretildiğini kanıtlamıştır. Bu bağlamda, yenilebilir bir bitki dokusu kullanılarak; sürdürülen farmasötik araştırmalar için alternatif bir yaklaşım sunulmuştur.

Özet (Çeviri)

Irisin is a myokine-like peptide hormone that was first discovered in 2012 and is a proteolytic product of FNDC5. It exhibits various physiological functions by binding to cell surface receptors and participating in signaling pathways in different tissues and organs. Its most important functions are browning white adipocytes, regulating glucose metabolism, increasing osteoblast proliferation and reducing metastasis of cancer cells. Studies demonstrated that irisin functions as a potential pharmaceutical protein, particularly in the context of obesity treatment. Nowadays, there is an increase in frequency of the cardiovascular diseases associated with this health issue. In this context, it has been proven that irisin plays a key role in the regulation of energy metabolism following thermogenesis and weight loss by increasing expression of UCP1 gene in adipose tissue. In the light of this information, high efficiency cloning of irisin sequence into pdonor207 and pK7WGF2 vectors was achieved using“Gateway Cloning System”. After E. coli DH5α transformation and colony PCR validation studies, insert orientation analysis was performed by Sanger sequencing. For transient plant transformation, syringe injection was performed into small and medium-sized tomato fruits obtained from commercial supplier following A.tumefaciens GV3101 transformation. Agroinfiltration study was designed based on optimization results to increase protein expression efficiency. Following protein expression, qualitative validation of transferring irisin sequence to tomato fruit was performed by standard PCR reaction. In addition, mRNA expression levels of tomato fruits were compared using Real-Time PCR and findings were statistically supported. The results demonstrated that irisin expression level was higher in small-sized tomato fruits. After validation at transcription level, Western Blot analysis was performed. The results proved that irisin was expressed at the expected molecular weight and its glycosylated form was produced. In this context, an alternative approach was presented for ongoing pharmaceutical research using an edible plant tissue.

Benzer Tezler

  1. İnsan ve doğal kaynaklı afetlerde kimliklendirmede dental görüntüleme tekniklerinden panoramik röntgen kullanımı

    The use of panoramic X-ray from dental imaging techniques for identification in human-related and natural disasters

    HAKAN BİŞİRİCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Adli TıpHitit Üniversitesi

    Adli Bilimler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞEGÜL ŞARBAK

  2. İnsan yüzü imgelerinde dairesel hough dönüşümü kullanılarak göz durumu tespiti

    Eye state detection in human faces by using circular hough transform

    ÖMER FARUK SÖYLEMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolFırat Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BURHAN ERGEN

  3. Senil kataraktlı insan lens ve ön kamera sıvısında meydana gelen değişimlerin moleküler biyolojisi

    Molecular biology of changes formed in senile human cataractous lens and aqueous humor

    İRFAN EMRE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    BiyolojiFırat Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NİHAT DİLSİZ

  4. Anaerobik eşikteki iş gücünde yapılan egzersizin irisin, nesfatin-1 ve oksidatif stres üzerine olan etkilerinin belirlenmesi

    Anaerobik eşikteki iş gücünde yapilan egzersizin irisin, nesfatin-1 ve oksidatif stres üzerine olan etkilerinin belirlenmesi determination of the effects of exercise corresponded to work rate at the anaerobic threshold on irisin, nesfatin-1 and oxidative stress

    MUSTAFA DENİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    FizyolojiFırat Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OĞUZ ÖZÇELİK

  5. Polikistik over sendromu'nda insülin direncinde irisin, bakır ve çinkonun rolü

    The role of irisin, copper and zinc levels on insulin resistance in polycystic ovary syndrome

    MUSTAFA BAYRAKTAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyokimyaSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BAHADIR ÖZTÜRK