İdrar örneklerinden izole edilen Candida türlerinin antifungal duyarlılığı, virulans faktörleri ve biyofilm genlerinin analizi
Analysis of antifungal susceptibility, virulence factors, and biofilm genes of Candida species isolated from urine samples
- Tez No: 969980
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA BEHÇET
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu çalışmada, idrar örneklerinden izole edilen Candida türlerinin sıklığı, virülans faktörleri, biyofilm oluşumu ve antifungal duyarlılık profillerinin incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: İdrar örneklerinden izole edilen 100 Candida türünün antifungal duyarlılıkları için VITEK 2 cihazı, tanımlamaları için ise geleneksel yöntemler ve VITEK 2 cihazı kullanılmıştır. Virülans faktörlerini değerlendirmede hemoliz aktivitesi için %5 koyun kanlı SDA, fosfolipaz aktivitesi için yumurta sarılı agar, proteinaz aktivitesi için %1 sığır serum albumin agar, esteraz aktivitesi için tween 80 agar kullanılmıştır. Fenotipik biyofilm oluşumu modifiye tüp aderans yöntemiyle; ALS1, ALS3 ve HWP1 gen ekspresyon düzeyleri real time PCR yöntemi ile genotipik olarak saptanmıştır. Bulgular: Candida izolatlarının %53'ü yoğun bakımlar, %24'ü poliklinikler ve %23'ü yataklı servislerden gönderilen idrar örneklerinden izole edilmiştir. İzolatların %61'i kadın, %39'u erkek hastalardan elde edilmiştir. En sık tür olarak Candida albicans (C. albicans) (%57) saptanırken bunu Candida tropicalis (%17), Candida glabrata (%12) ve diğer non-albicans Candida (NAC) (%14) türleri izlemiştir. C. albicans izolatlarında hemoliz (%100), esteraz (%98,2), fosfolipaz (%92,9) ve proteinaz (%73,6) aktiviteleri yüksek oranlarda görülmüştür. NAC türlerinde hemoliz C. albicans ile aynı (%100) proteinaz ile benzer (%69,7) oranda saptanırken fosfolipaz (%67,4) ve esteraz (%62,7) aktiviteleri daha düşük oranlarda bulunmuştur (p=0,001). Fenotipik biyofilm değerlendirmesinde, NAC izolatlarında güçlü aderans (%44,1) C. albicans izolatlarına göre yüksek bulunmuştur (p<0,001). C. albicans izolatlarında NAC izolatlarına göre HWP1 (%94,7) ve ALS3 (%96,4) gen ekspresyonları yüksek bulunurken (p<0,001) ALS1 gen ekspresyonu açısından fark görülmemiştir. Biyofilm oluşumu ile gen ekspresyonu arasında C. albicans izolatlarında anlamlı ilişki saptanmazken, NAC izolatlarında HWP1 ve ALS3 gen ekspresyonları biyofilm oluşumu ile ilişkili bulunmuştur (p=0,048). Antifungal duyarlılık testlerinde, C. albicans izolatlarında flukonazol ve mikafungine karşı %2, Candida tropicalis izolatlarında mikafungine %6; Candida parapsilosis izolatlarında flukonazol ve vorikonazole %50, amfoterisin B'ye %40, mikafungine %20; Candida krusei izolatlarında ise amfoterisin B'ye %33 direnç saptanmıştır. Sonuç: Candida enfeksiyonlarında tür düzeyinde doğru tanılama, virülans faktörlerinin hem fenotipik hem de genotipik olarak değerlendirilmesi ve antifungal duyarlılık testlerinin rutin uygulamaya dahil edilmesi etkin klinik yönetime katkı sağlayacaktır. Ayrıca daha fazla çalışmaya ihtiyaç duyulmakla birlikte HWP1 ve ALS3 genleri idrar yolu enfeksiyonlarında C. albicans için moleküler tanıda potansiyel biyobelirteç olarak değerlendirilebilir.
Özet (Çeviri)
Objective: This study aimed to investigate the frequency, virulence factors, biofilm formation, and antifungal susceptibility profiles of Candida species isolated from urine samples. Materials and Methods: VITEK 2 device was used for antifungal susceptibilities of 100 Candida species isolated from urine samples, and conventional methods and VITEK 2 device were used for their identification. For the assessment of virulence factors, 5% sheep blood SDA was used for hemolytic activity, egg yolk agar for phospholipase activity, 1% bovine serum albumin agar for proteinase activity, and Tween 80 agar for esterase activity. Phenotypic biofilm formation was determined by the modified tube adherence method, while the expression levels of the ALS1, ALS3, and HWP1 genes were genotypically assessed using real-time PCR. Results: Among the isolates, Candida isolates, 53% were isolated from intensive care units, 24% from outpatient clinics, and 23% from inpatient services. The isolates were obtained from 61% female and 39% male patients. Candida albicans (C. albicans) was the most frequently isolated species (57%), followed by Candida tropicalis (17%), Candida glabrata (12%), and other non-albicans Candida (NAC) species (14%). Among C. albicans isolates, hemolytic (100%), esterase (98.2%), phospholipase (92.9%), and proteinase (73.6%) activities were observed at high rates. In NAC species, hemolytic activity was equal to C. albicans (100%), proteinase activity was similar (69.7%), whereas phospholipase (67.4%) and esterase (62.7%) activities were significantly lower (p=0.001). In phenotypic biofilm assessment, strong adherence was significantly higher in NAC isolates (44.1%) compared to C. albicans isolates (p<0.001). While HWP1 (94.7%) and ALS3 (96.4%) gene expressions were found higher in C. albicans isolates compared to NAC isolates (p<0.001), no difference was observed in terms of ALS1 gene expression. No significant association was observed between biofilm formation and gene expression in C. albicans isolates, whereas HWP1 and ALS3 gene expressions were associated with biofilm formation in NAC isolates (p=0.048). Antifungal susceptibility tests revealed resistance rates of 2% against fluconazole and micafungin in C. albicans isolates. Candida tropicalis isolates resistance rates were 6% against micafungin. Candida parapsilosis isolates resistance rates were 50% against fluconazole and voriconazole, 40% against amphotericin B, and 20% against micafungin. Candida krusei isolates, resistance to amphotericin B was found at 33%. Conclusion: Accurate species-level identification, phenotypic and genotypic evaluation of virulence factors, and routine implementation of antifungal susceptibility tests in Candida infections will contribute to effective clinical management. Additionally, although further studies are needed, HWP1 and ALS3 genes may be considered potential molecular biomarkers for the diagnosis of urinary tract infections caused by C. albicans.
Benzer Tezler
- Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesi Farabi Hastanesi'ndegörülen fungal infeksiyonlar ve antifungal duyarlılıkları
Appearance of fungal infections and antifungal susceptibilitiesat medical faculty, Farabi Hospital, Karadeniz Technical University
UĞUR KOSTAKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. KEMALETTİN AYDIN
- Yoğun bakım hastalarının idrar kültürlerinden izole edilen candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi
Distribution of candida species isolated from urine cultures of icu patients and determination of antifungal susceptibility
BAN ALI HASSAN HASSAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FAHRİYE EKŞİ
- Değişik klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin belirlenmesi ve antifungal maddelere karşı duyarlılıklarının araştırılması
Typing of Candida isolated from different clinical samples and investigation of their sensitivity against systemic antifungals
BERRİN UZMAN SERİNGEN
- Klinik örneklerden izole edilen candida'ların karakterizasyonu ve antifungal duyarlılıkları
Characterization and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples
MİNE AYDIN KURÇ