Geri Dön

Serum hücreden arınmış DNA miktarının glial tümörlerde operasyon öncesi ve sonrası değişimi ve analizi

Analysis of the changes in serum cell-free DNA levels before and after surgery in glial tumors

PDF İndir

  1. Tez No: 939739
  2. Yazar: OĞUZ AKÇAKÜLÜ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA İBRAHİM ZİYAL
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Nöroşirürji, Genetik, Neurosurgery, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Beyin neoplazmları, Biyobelirteçler-tümör, DNA hasarı, Glioma, Brain neoplasms, Biomarkers-tumor, DNA damage, Glioma
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Bu çalışma, glioma tanılı hastalarda dolaşımdaki hücresiz DNA (cfDNA) düzeylerinin preoperatif ve postoperatif 1. ve 3. ayda nasıl değiştiğini kantitatif olarak değerlendirmek, benzer yaştaki sağlıklı kontrol grubuyla karşılaştırmasını ve klinik sonuçlar ile nüks gelişimi korelasyonu incelemeyi amaçlamaktadır. Ayrıca beyin MRG görüntülemesinde tümör hacmiyle cfDNA arasındaki ilişki değerlendirilmiştir. cfDNA'nın preoperatif dönemde tanısal anlamda, postoperatif dönemde ise takip ve tedavide potansiyel biyobelirteç olarak rolünü değerlendirmektedir. Yöntem: Çalışmaya cerrahi rezeksiyon sonrası tanısı histopatolojik olarak doğrulanmış 15 glioma hastası yaş ve cinsiyet olarak benzer özelliklere sahip 11 sağlıklı birey çalışmaya dahil edilmiştir. Hastalardan preoperatif dönemde, postoperatif 1.ay ve 3.ayda 8-10cc periferik venöz kan alınmıştır. cfDNA'nın stabilitesini sağlamak amacıyla özel stabilizasyon tüpleri (Streck cfDNA BCT) kullanıldı ve örnekler buz kalıplı taşıma kaplarında laboratuvara soğuk zincirle ulaştırıldı. Kan örnekleri alındıktan sonra oda sıcaklığında 6 saate kadar bekletildi, santrifüj edildi ve süpernatanlar -80 °C'de saklanmıştır. cfDNA izolasyonu, QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen, Almanya) ile üretici protokolüne uygun şekilde yapılmıştır ve izole edilen örnekler -80 °C'de korunmuştur. cfDNA konsantrasyonları Qubit® 2.0 fluorometresi (Invitrogen, Life Technologies) kullanılarak ng/ml cinsinden ölçülmüştür. Ayrıca hastların preoperatif tümör hacimleri hesaplanmıştır. Zaman içindeki cfDNA değişimleri ve nüks arasındaki ilişki istatistiksel analiz için IBM SPSS Statistics 22 yazılımında değerlendirilmiştir. Bulgular: Glial tümörlü hastaların preoperatif cfDNA düzeyleri, sağlıklı kontrol grubuna göre anlamlı şekilde yüksek bulunmuştur. Preoperatif dönemde cfDNA düzeyleri ortalama 3068ng/mL(+-727SD) olarak ölçülmüştür. Kontrol grubunda ise cfDNA düzeyleri ortalama 402ng/mL(+-120SD) ölçülmüştür. Anlamlı farklılık bulunmuştur (p<0,001). Nüks gelişmeyen kemoradyoterapisine devam eden hastalarımızda cfDNA seviyelerinde preoperatif döneme göre postoperatif dönemlerde anlamlı bir şekilde düşüş izlenmiştir. İzlem sırasında nüks gelişen hastalarda ise cfDNA düzeylerinde belirgin artış eğilimi izlenmiştir. Postoperarif 3.ayda cfDNA düzeyleri nüks gelişen hastalarda ortalama 2532ng/ml iken nüks gelişmeyenlerde bu değer ortalama 1547,85ng/ml olarak ölçülmüştür. Bulgularımızda post op 3.aydaki cfDNA yükselişinin nüks ile yakından ilişkisi olduğunu düşündürmüştür (p=0,0015). MRG'de ölçtüğümüz preoperatif tümör volümü ile preoperatif cfDNA arasında pozifif korelasyon saptanmıştır (p=0.48). Sonuç: Elde edilen bu veriler ışığında, cfDNA'nın glial tümörlü hastalarda preoperatif dönemde hastalık yükü ve nüks izleminde kullanılabilecek potansiyel bir biyobelirteç olduğunu göstermektedir. Bu araştırmayla, glial tümörlü hastalarda cfDNA zaman içerisinde klinik seyirle olan ilişkisi ve izlemdeki potansiyel rolü araştırılmıştır. Preoperatif dönemde sağlıklı bireylere göre yüksek olması, nüks gelişmeyen kemoradyoterapisine devam eden hastalarda 3.ayda düzeylerde belirgin düşüş olması, nüks eden hastalarda ise anlamlı postoperatif cfDNA yükselmeleri bu biyobelirteçin takip ve tedavi sürecinde kullanılabileceğini bize göstermektedir. Ayrıca konservatif görüntüleme yöntemlerinin yüksek faaliyeti, ulaşılabilirliğinin kısıtlı olması, mikroskobik rezidüel tümör progresyonunu iyi yansıtamaması; cfDNA'nın konservatif yöntemlere kombine ya da tek başına hasta yönetiminde önemli yer tutabileceğini göstermektedir. Özetle çalışmamız cfDNA'nın klinik kullanım potansiyelini desteklemekte ve daha geniş hasta gruplarıyla yapılacak ileri araştırmalara zemin oluşturmaktadır.

Özet (Çeviri)

Objective: This study aimed to quantitatively assess changes in circulating cell-free DNA (cfDNA) levels in patients with glioma, measured preoperatively and at the 1st and 3rd postoperative months, and compare these levels with those in an age-matched healthy control group. It also sought to explore the correlation between cfDNA levels, clinical outcomes, and tumor recurrence, as well as to evaluate the association between cfDNA and tumor volume measured on brain MRI scans. Furthermore, the study examined the role of cfDNA as a potential biomarker for preoperative diagnosis and postoperative monitoring. Method: The study included 15 patients with histopathologically confirmed gliomas following surgical resection, along with 11 healthy control individuals matched for age and gender. Peripheral venous blood samples (8–10 cc) were collected from patients preoperatively and at the 1st and 3rd postoperative months. To ensure cfDNA stability, blood samples were collected in Streck cfDNA BCT tubes and transported under a cold chain to the laboratory. After collection, samples were kept at room temperature for up to 6 hours, centrifuged, and the supernatants were stored at -80 °C. cfDNA was extracted using the QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (Qiagen, Germany) according to the manufacturer's instructions, and the extracted cfDNA was stored at -80 °C. Concentrations of cfDNA were quantified in ng/mL using the Qubit® 2.0 fluorometer (Invitrogen, Life Technologies). Preoperative tumor volumes were also calculated for each patient. Statistical analyses, including the evaluation of the relationship between cfDNA trends and recurrence, were performed using IBM SPSS Statistics 22. Findings: Preoperative cfDNA levels in glioma patients were significantly higher than those in the healthy control group, with average preoperative cfDNA levels of 3068 ng/mL (±727 SD) compared to 402 ng/mL (±120 SD) in controls (p<0.001). Among patients who did not experience recurrence and continued chemoradiotherapy, there was a significant decrease in cfDNA levels during the postoperative period compared to preoperative levels. In contrast, patients who experienced recurrence showed a significant increase in cfDNA levels, with a mean cfDNA level of 2532 ng/mL at the 3rd postoperative month compared to 1547.85 ng/mL in patients without recurrence (p=0.0015). Additionally, a positive correlation was identified between preoperative cfDNA levels and tumor volume measured on MRI (p=0.48). Conclusion: These findings highlight the potential of cfDNA as a biomarker for preoperative disease burden and for monitoring recurrence in glioma patients. The observed trends—higher preoperative cfDNA in patients than in healthy controls, significant decreases in cfDNA levels in patients without recurrence, and significant postoperative increases in cfDNA in patients with recurrence—underscore the promise of cfDNA as a tool for postoperative follow-up and treatment evaluation. Moreover, given the limitations of conventional imaging in detecting microscopic residual disease, cfDNA analysis may offer a valuable adjunct or alternative in patient management. In summary, our study supports the clinical potential of cfDNA and lays the groundwork for future research with larger patient cohorts.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    192841

    Prostat adenokarsinomlarında psa değerlerinin gleason skor ve klinik evre ile ilişkisi

    The relation between psa and gleason score and clinical phase in prostate adenocarsinoma

    HACI HASAN ESEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    PatolojiSelçuk Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA CİHAT AVUNDUK

  2. Tez No

    86892

    Diabetik sıçanlarda pnömoperitoneumun peritoneal defans mekanizmalarına etkisi

    Effect of pneumoperitomeum on peritoneal defense mechanism in diabetic rats

    GÖKHAN GÖZİŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Genel Cerrahiİstanbul Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYRETTİN CEBECİ

  3. Tez No

    785118

    Köpeklerde gastroenteritise neden olan bazı enfeksiyöz ve non-enfeksiyöz hastalıklarda serum ve fekal zonulin seviyelerinin tespiti

    Determination of serum and fecal zonulin levels in gastroenteritis of dogs caused by some infectious and NON-infectious diseases

    DENİZ ŞARDAĞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GastroenterolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Veterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEREM URAL

  4. Tez No

    926460

    Vitex agnus-castus L. (Hayıt) bitkisinin çiçek, yaprak ve meyvelerinden standardize ekstrelerin hazırlanması ve biyolojik etkilerinin araştırılması

    Preparation of standardized extracts from flowers, leaves and fruits of Vitex agnus-castus L. (Chasteberry) and investigation of biological effects

    EBRAR İNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Eczacılık ve FarmakolojiBezm-İ Alem Vakıf Üniversitesi

    Farmakognozi ve Doğal Ürünler Kimyası Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT KARTAL

  5. Tez No

    431589

    İnsan eritrolösemi hücrelerinde tümör nekrozis faktör alfa (TNF α)'nın muskarinik reseptör m3 ekspresyonu, interlökin-8 (CXCl8) ve asetilkolin (ACH) salınımındaki rolü üzerine çalışmalar

    Studies on the role of tumor necrosis factor alpha (TNF α) on the expression of M3 muscarinic receptor, release of i̇nterleukin-8 (CXCL8) and acethylcholine (ACH) in human erythroleukemia cells

    ZEHRA KANLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyofizikMarmara Üniversitesi

    Biyofizik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜLYA CABADAK

Geri Dön