İnsan adipoz mezenkimal kök hücre kaynaklı eksozomların kolon kanseri hücresi üzerindeki transkriptomik ve hücresel etkilerinin belirlenmesi
Determination of transcriptomic and cellular effects of human adipose mesenchymal stem cell-derived exosomes on colon cancer cells
- Tez No: 915917
- Danışmanlar: PROF. DR. HATİCE YILDIRIM, PROF. DR. FERAY KÖÇKAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Onkoloji, Biyoloji, Genetics, Oncology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hücre dışı veziküllerden biri olan ekzosomlar çeşitli proteinler, lipitler, mRNA, metabolik enzimler ve miRNA gibi çok sayıda esansiyel molekülü içererek hücreler arasındaki moleküler bilgiyi ve hücreler arası iletişimi sağlamaktadır. Eksozomlar kanserde hücreler arası iletişimin önemli aracıları olarak ortaya çıkmış olup yerel ve sistemik çevreyi değiştirerek kanserin büyümesi ve yayılmasını programlayabilmektedir. Eksozomların kanser progresyonundaki çok yönlü etkileri literatürde yapılan çalışmalada sınırlı olduğu ve eksozomların kanser hücreleri üzerinde etkileri göz önüne alınarak çalışmamızda eksozomların izolasyonu yapılarak TEM, Western blot ve immünofloresan analizi ile karakterize edilmiştir. Ardından SW-480 hücrelerinde proliferasyon/sitotoksisite, koloni formasyon ve hücre migrasyonu çalışmaları gereçekleştirilmiştir. Bu analizlere ek olarak eksozomların SW-480 kolon kanseri hücrelerindeki etkisinin belirlenmesi için transkriptomik analizler yapılmıştır. Gerçekleştirilen biyoinformatik analizlerle tüm RNA transkpti araştırılmıştır. Elde edilen sonuçlarda istatistiksel olarak anlamlı değişikliğe uğrayan genler belirlenerek RT-PZR çalışmaları yapılarak doğrulanmıştır. Bu genlerden up regüle olan ATOH 8'in sh RNA çalışmaları için lentiviral tabanlı pLKO.1-TRC vektörüne başarıyla klonlanması gerçekleştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
Exosomes, one of the extracellular vesicles, provide molecular information and intercellular communication between cells by containing many essential molecules such as various proteins, lipids, mRNA, metabolic enzymes and miRNA. Exosomes have emerged as important mediators of intercellular communication in cancer and can program the growth and spread of cancer by changing the local and systemic environment. Considering the limited number of studies in the literature on the multifaceted effects of exosomes on cancer progression and the effects of exosomes on cancer cells, in our study, exosomes were isolated and characterized by TEM, Western blot and immunofluorescence analysis. Then, proliferation/cytotoxicity, colony formation and cell migration studies were performed in SW-480 cells. In addition to these analyses, transcriptomic analyses were performed to determine the effect of exosomes on SW-480 colon cancer cells. All RNA transcripts were investigated with the bioinformatic analyses performed. Statistically significant genes were determined in the obtained results and confirmed by RT-PCR studies. Among these genes, up-regulated ATOH 8 was successfully cloned into the lentiviral-based pLKO.1-TRC vector for sh RNA studies.
Benzer Tezler
- Uyarılmış adipoz doku kaynaklı mezenkimal kök hücrelerden elde edilen eksozomların Alzheimer modeli oluşturulmuş SH-SY5Y insan nöroblastoma hücre hattı ve Aβ degradasyonu üzerindeki etkilerinin incelenmesi
Investigation of the effects of exosomes from stimulated adipose tissue-derived mesenchymal stem cells on Alzheimer's modeled SH-SY5Y human neuroblastoma cell line and Aβ degradation
MERZET AYDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiKocaeli ÜniversitesiKök Hücre ve Doku Yenilenmesi Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLÇİN GACAR
- İnsan kaynaklı adipoz kök hücreden elde edilen eksozomların yara iyileşmesindeki en etkin dozu
The most effective dosage of exosomes from human deri̇ved adiposis stem cell on wound healing
ECE NUR DURSUN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiErciyes ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEMAL ALPER KEMALOĞLU
- Farklı mezenkimal kök hücre eksozomlarının diyabetik ratlarda yara iyileşmesi üzerine etkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of the effect of different mesenchymal stem cell exosomes on wound healing in diabetic rats
ÖMER TAŞKIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiErciyes ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEMAL ALPER KEMALOĞLU
- Mezenkimal kök hücrelerin ve eksozomların oosit matürasyonuna etkisinin incelenmesi: Deneysel çalışma
Investigation of the effect of mesenchymal stem cells and their exosomes on oocyte maturation: An experimental study
DAMLA AKOĞULLARI ÇELİK
Doktora
Türkçe
2023
Histoloji ve EmbriyolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAFİZE SEDA VATANSEVER
- Yağ dokusu kaynaklı Mezenkimal kök hücre Eksozomları ve Alfa Lipoik Asitin in-vitro koşullarda meme kanseri kök hücreleri üzerine etkilerinin incelenmesi
Analysing in-vitro effects of adipose-derived Mesenchymal stem cells Exosomes and alpha Lipoic Acid on breast cancer stem cells
GİZEM USLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiKocaeli ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEHRA SEDA HALBUTOĞULLARI