Geri Dön

Polimeraz zincir reaksiyonu-restriksiyon enzim analizi yöntemi ile mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanması

Identification of mycobacteria to the species level by polymerase chain reaction and restriction enzyme analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 88888
  2. Yazar: M. ALPER ERGİN
  3. Danışmanlar: DOÇ.DR. A. DÜRDAL US
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Mikobakteriler, PRA, hsp65. iv T.fi. YÜK-:, ü ?.'..? :?-.'.?' r -?=>? öOKtiiiVsKNTASV'öiıl icMİEIİ, Mycobacterium, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Restriksiyon haritası, Mycobacteria, PRA, hsp65, Mycobacterium, Polymerase chain reaction, Restriction mapping
  7. Yıl: 1999
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET Mikobakterileri enfeksiyonlarının laboratuvar tanısında kullanılan kültür yöntemleri ve biyokimyasal testler uzun sürede sonuç vermekte ve özellikle tüberküloz dışı türlerin kesin olarak tanımlanması çoğu zaman mümkün olamamaktadır. Mikobakterilerin tür düzeyinde hızlı ve doğru olarak tanımlanması, gerek epidemiyolojik verilerin toplanması gerekse uygun tedavi protokollerinin oluşturulması açısından önem taşımaktadır. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi Klinik Patoloji Laboratuvar ı nda klinik örneklerden izole edilen 102 mikobakteri susu, ortak bir antijen olan 65 kDa'luk ısı şok proteinini (hsp65) kodlayan genin restriksiyon enzimleri ile kesilmesi prensibine dayanan polimeraz zincir reaksiyonu - restriksiyon enzim analizi (PRA) yöntemi ile tiplendirilmiştir. Suşların 80'i (%78.4) Mycobacterium tuberculosis, 22'si (%21.5) ise tüberküloz dışı mikobakteri olarak tanımlanmıştır. Tüberküloz dışı mikobakterilerin 4'ü (%18.2) M.gordonae I, 3'ü (%13.6) M.chelonae, 2'şer adedi (%9.1) M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.pereghnum ve 1'er adedi (%4.5) M.fortuitum, M.fiavescens, M.malmoense, M.mucogenicum olarak tiplendirilmiştir. Ayrıca literatürde bildirilen tür saptama cetvellerinde yer almayan, farklı restriksiyon paterni gösteren 3 farklı tür belirlenmiştir. Tüberküloz dışı mikobakterilerin izole edildiği hastalardan çoğunun altta yatan başka bir hastalığı mevcuttur. Sonuç olarak, PRA yöntemi klinik örneklerden izole edilen mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanmasında hızlı, pratik ve güvenilir bir yöntem olarak görünmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Classical laboratory methods based on culture and biochemical tests for the diagnosis of mycobacterial infections, take a long time and frequently fail to produce a precise identification especially for non- tuberculous mycobacteria. Mycobacterial identification to the species level is important for both collecting epidemiologic data and selecting a proper treatment regimen. In this study, a total of 102 mycobacterial strains isolated from clinical specimens in Hacettepe University Hospital Clinical Pathology Laboratories, were evaluated by polymerase chain reaction - restriction fragment length polymorphism analysis (PRA) method, which detects common mycobacterial heat shock protein (hsp65). Eighty of 1 02 strains (78.4% ) were identified as Mycobacterium tuberculosis, and 22 (21.5% ) were identified as non-tuberculous mycobacteria (NTM). Most of the NTM strains have been isolated from patients who have underlying disorders and 4 (18.2%) of them were M.gordonae 1, 3 (13.6%) were M.chelonae, 2 of each (9.1%) were M.gordonae III, M.gordonae IV, M.avium, M.peregrinum and one of each (4.5%) were M.fortuitum, M.flavescens, M.malmoense, M.mucogenicum. Three strains of NTM that show different restriction patterns from earlier algorithms described in literature, could not be identified. As a result, PRA seems to be a rapid, practical and safe method for the species level identification of mycobacteria isolated from clinical specimens.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    38132

    Genital papilloma virüslerinin polimeraz zincirleme reaksiyonu ile belirlenmesi ve tiplendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    HAMİYET DÖNMEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Tıbbi BiyolojiGazi Üniversitesi

    PROF.DR. SEVDA MENEVŞE

  2. Tez No

    47499

    Cystic fibrosis in Turkey : Screening of mutations in the second nucleotide binding domain of the CFTR gene

    Türkiye'de kistik fibroz : CFTR geninin ikinci nükleotid-bağlanma bölgesini kodlayan mutasyonların taranması

    ÖZLEM TOPALOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1995

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    PROF.DR. BETÜL KIRDAR

  3. Tez No

    35324

    Studies on the screening of cystic fibrosis mutations in Turkish of families

    Başlık çevirisi yok

    TUNCER ONAY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1994

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BETÜL KIRDAR

  4. Tez No

    82605

    A preliminary study on genetic differentation among Turkish brown trout (Salmo trutta L.) populations as revecaled by RFLP analysis of PCR amplified mitochondrial DNA segments

    Başlık çevirisi yok

    FÜSUN GEZGİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İNCİ TOGAN

  5. Tez No

    9915

    Human factor VIII HindIII RELP: Genotypic distrubution and use for carrier detection of hemophilia a in the Turkish population

    Başlık çevirisi yok

    YEŞİM GÖKMEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1990

    Tıbbi BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NEJAT EĞİLMEZ

Geri Dön