Boy kısalığı patofizyolojisinde rol oynayan shox gen mutasyonlarının klasik ve güncel tekniklerin kullanımı ile araştırılması
Investigation of shox gene mutations playing a role in the pathophysiology of short stature with the use of classical and current techniques
- Tez No: 882863
- Danışmanlar: PROF. DR. BİRSEN KARAMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Boy kısalığı, genel popülasyonun %2-3'ünde görülen, hem çevresel hem de genetik faktörlerin etkili olduğu kompleks bir fenotiptir. Boy kısalığı ile ilişkilendirilmiş The short-stature homeobox gene (SHOX) geni, X ve Y kromozomlarının psödootozomal bölgesinde (PAR1) bulunan, erken embriyonik gelişim döneminde birçok organın oluşumunu ve üst-alt ekstremitelerdeki kemiklerin büyüme ve gelişmesinde önemli rol oynayan bir gendir. Geniş varyant spekturumu bulunan SHOX geni defektleri, normalden ağır klinik bulgulara sahip mezomelik boy kısalığına kadar değişken bir fenotip göstermektedir. Bu çalışmada, idiyopatik boy kısalığı tanılı 125 olguda sitogenetik, moleküler sitogenetik ve moleküler teknikler kullanılarak SHOX geninin etiyolojisi araştırıldı. Sitogenetik yöntemlerle yapılan incelemelerde olguların %4,8 (n=6) ve FISH incelemesinde %6,6'sında (n=8) SHOX geni delesyonu ile sonuçlanan anomaliler saptandı. Yirmi iki olguda yapılan a-CGH çalışmasında ise olguların %18,18'inde (n=4) bir anomali saptandı. On olguya yapılan boy kısalığı gen paneli testinde bir olguda (%10) SHOX geninde c.412G>T heterozigot novel varyant saptandı. Klinik öneme sahip olduğu belirlenen novel varyant Sanger dizileme ile doğrulandı ve aile segregasyon analizi yapılarak varyantın de novo oluştuğu saptandı. Boy kısalığı olgularında SHOX geni patofizyolojisini araştırmak amacıyla yapılan çalışmamızın, SHOX geninin fenotip-genotip ilişkisini açıklanmasına ve özgün genetik danışma için aydınlatıcı olarak literatüre katkı sağlaması beklenmektedir. Ancak, SHOX geni defektlerinin geniş bir fenotipik spektruma sahip olması nedeniyle tüm genom dizileme teknikleriyle, indeks ve ailesinin birlikte bulunduğu olgu havuzunda araştırma yapılmasının çalışmayı ilerletmek açısından doğru bir yaklaşım olacağı sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Short stature (SS) is a complex phenotype that occurs in 2-3% of the general population. The short-stature homeobox gene (SHOX) gene is located in the pseudootosomal region (PAR1) of the sex chromosomes and plays an important role in the formation of many organs during early embryonic development and in the growth of bones in the upper and lower extremities. Defects in the SHOX gene, which has a wide variant proband, show a variable phenotype ranging from normal to mesomelic short stature with severe clinical findings. In this study, we investigated the etiology of the SHOX gene in 125 patients with idiopathic SS using cytogenetic, molecular cytogenetic and molecular techniques. Anomalies in SHOX gene deletion were found in 4.8% (n=6) by cytogenetic methods and 6.6% (n=8) by FISH. In a-CGH study performed in 22 cases and 18.18% (n=4) with anomaly. In the gene-panel sequencing of SS performed in ten patients, a c.412G>T heterozygous novel variant in the SHOX gene was detected in one case (10%). The novel variant was confirmed by Sanger sequencing and with family segregation analysis that the variant occurred de novo. Our study, which was conducted to investigate the pathophysiology of the SHOX gene in cases of SS, is expected to contribute to the literature by explaining the phenotype-genotype relationship of the SHOX gene. However, since SHOX gene defects have a wide phenotypic spectrum, it was concluded that it would be the right approach to advance the study by using whole-genome sequencing techniques.
Benzer Tezler
- Boy kısalığı gösteren 13-17 yaş arası çocuklarda benlik kavramı
Başlık çevirisi yok
AYSIN TURPOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1988
Psikolojiİstanbul ÜniversitesiAile Sağlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURÇİN SAKA
- Boy kısalığı olan prepubertal çocuklarda çinko suplemantasyonunun büyüme hormonu salınımı, IGF-I, IGFBP-3, somatomedin jenerasyon testi ve kemik formasyon belirteçleri üzerine etkisi
The Effect of zinc supplementation on GH, IGF-I, IGFBP-3 and bone formation markers on prepubertal short children
SEBAHAT İMAMOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2001
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ABDULLAH BEREKET
- Düzce il merkezindeki ilköğretim okullarında boy kısalığı prevalansının ve etyolojinin araştırılması
Investigation of prevalence of short stature and etiologic causes in pupics in primary schools in the center of Düzce province
MELEK ÖZKUL TANDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıDüzce ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLKNUR ARSLANOĞLU
- Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı genel polikliniklerine boy kısalığı ile başvuran hastaların değerlendirilmesi
Evaluation of the patients with short stature presenting to general outpatient clinics of Department of Pediatrics at Uludağ University Medical School Hospital
DEMET EKİN AYHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Aile HekimliğiUludağ ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL SAĞLAM
- Boy kısalığı olan hastalarda özellikler ve etiyolojik dağılım
Etiologic distribution and characteristics of patients with short stature
SİBEL ÖZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERAP TURAN