Denizel ekosistemlerde DNA temelli biyoizleme uygulamalarının zooplankton türleri için sınanması
Assessing DNA-based biomonitoring applications in marine ecosystems on zooplankton species
- Tez No: 873176
- Danışmanlar: PROF. DR. MELEK İŞİNİBİLİR OKYAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Çevre Mühendisliği, Biyoteknoloji, Biology, Environmental Engineering, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Deniz biyolojisi, Deniz suyu, Denizanası, Denizel canlılar, Denizler, Marine biology, Sea water, Jelly fish, Marine organisms, Seas
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Deniz ve İçsu Kaynakları Yönetimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Deniz Biyolojisi Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sekanslama teknolojilerinin sürekli gelişimiyle DNA tabanlı yaklaşımlar denizel ekosistemleri hedef alan biyoçeşitlilik çalışmalarında sıklıkla kullanılır olmuştur. Bu tez çalışmasında Marmara Denizi'nde 2021 sonbaharı - 2022 yazı boyunca gözlenen müsilaj olayı sırasında altı farklı lokasyondan topladığımız müsilaj örneklerine ve beş farklı lokasyondan topladığımız deniz suyu örneklerine çevresel DNA metabarkodlama yaklaşımını uyguladık. Bulgularımız, hem müsilajlı agregatlardan çok çeşitli organizmalardan oluşan müsilajın topluluk bileşimini tahmin etmede hem de deniz suyunda eDNA metabarkodlama tekniğinin etkinliğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Recently, the utilization of sequencing technologies has led to the frequent use of DNA-based techniques in research on marine ecosystems. This study applied the environmental DNA metabarcoding method to mucilage samples collected from six locations and seawater samples collected from five different locations during a mucilage event observed in the Marmara Sea from autumn 2021 to summer 2022. Our results demonstrate the efficacy of the eDNA metabarcoding approach in predicting the community composition of mucilage, which is composed of a diverse array of organisms from mucilaginous aggregates and seawater.
Benzer Tezler
- Denizel ortamlarda plastiklerin parçalanma süreçlerini hızlandıracak bir kütinolitik esteraz enziminin fonksiyonel metagenomik yöntemlerle keşfi
Discovery of a cutinolytic esterase enzyme, which accelerate biodegradation of plastics, by functional metagenomic methods
FATMA ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ OSMAN ADIGÜZEL
- Manila kum midyesi (Ruditapes philippinarum) kullanılarak civa (Hg) alımında mikroplastiklerin rolünün araştırılması
Investigation of role of microplastics on mercury uptake using by manila clam (Ruditapes philippinarum)
ERCAN SIKDOKUR
- Ay denizanasında peyzaj genetiği çalışmalarında kullanılabilecek olası bir biyobelirteç: MtDNAcn
A potential biomarker for seascape genetics studies in moon jellyfish: MtDNAcn
SÜMEYRA ZEYNEP ÇALICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Deniz Bilimleriİstanbul ÜniversitesiDeniz ve İçsu Kaynakları Yönetimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELEK İŞİNİBİLİR OKYAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERVE NUR AYDEMİR
- Mercanların okyanus asitlenmesine ve ısınmasına karşı fenotipik esnekliğinde epigenetik kontrolün rolü
The role of epigenetic control in the phenotypic resilience of corals to ocean acidification and warming
SELCAN DEMİRALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT BELİVERMİŞ
DOÇ. DR. HASAN BARIŞ ÖZALP
- Belgrad ormanında yağışların, akarsuların kalite parametreleri üzerindeki etkileri
Effects of precipitation on the water quality parameters of stream water in Belgrad forest
YUSUF SERENGİL
Doktora
Türkçe
2002
Ormancılık ve Orman Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SÜLEYMAN ÖZHAN