Geri Dön

Phenotypic and molecular detection of bio-ecological cutaneosis leishmanisis vector (diptera: psychodidae), with diagnosis cutaneous leishmaniasis in patients in Erbil province, Iraq

Irak'ın Erbil ilindeki hastalarda kutanöz leishmaniasis tanısı ilebiyoekolojik kutanoz leishmanisis vektörünün (Diptera: Psychodidae)fenotipik ve moleküler tespiti

  1. Tez No: 868901
  2. Yazar: SARDAR HUSSEIN RASOOL RASOOL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞAHİN TOPRAQ, PROF. DR. ABDULKARİM YASİN KARİM
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Harran Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Flebotomin kum sinekleri, leishmaniasis'in bulaşmasından sorumlu olan tıbbi açıdan önemli bir böcek grubudur. Irak'ın Ocak-Aralık ayları arasında ilk kez Irak'ın Erbil vilayetinde kutanöz leishmaniasis vektörü olarak kum sineği (Al-Harms) türlerinin fenotipik ve genotipik incelemesi ile Hastalarda biyo-Ekolojik Kutanöz Leishmaniasis'in mikroskobik incelemesi yapıldı. Toplanan 2054 örneğin 1137'si (%55,4) erkek, 917'si (%44,6) kadındır. istatistiksel olarak cinsiyet ile kum sineği türleri arasında korelasyon yoktur (P<0.20). Phlepotomus cinsine ait üç tür tanımlanmıştır: P. papatasi, P. sergenti ve P. Alexandria. P. papatasi 1163 (%15.6) ile en sık görülen tür olurken, bunu P. sergenti 598 (%29.1) ve P. alexandri 293 (%14.1) izledi. Kum sineklerinin mevsimsel bolluğunun iki zirvesi vardı, mevsimsel olarak bol olan kutanöz leishmaniasis vektörlerinin ilk zirvesi Mayıs ayında meydana gelirken, ikinci zirve Eylül ayında meydana geldi, istatistiksel olarak dönemler ile kum sineği türleri arasında bir korelasyon var (p<0.00). Bu çalışmada, Irak'ın Erbil vilayetindeki kum sineği türlerinin morfolojik tanımlamasının sonuçlarını doğrulamak için mt DNA COI gen bölgesinin dizileme analizi kullanılmıştır. Mevcut çalışma, P. papatasi, P. sergenti ve P. alexandria'yı bulmak ve tanımlamak için PCR-doğrudan dizileme kullandı. Erbil ili endemik CL kökenlidir. Phlebotomus tür standardı NCBI BLAST programı kullanılarak yapılan filogenetik ağaç analizine göre, Erbil ilinin çeşitli yerlerinden yerel Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti ve Phlebotomus alexandri izolatları DNA dizilimine tabi tutuldu. Yerel alandan Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti ve Phlebotomus alexandri izolatları, bir çoklu hizalama analiz aracı olan M'EGA 6.0 kullanılarak mt DNA COI gen dizisini analiz etmek için kullanıldı. Şehrin sağlık sistemi, kutanöz leishmaniasis hastalığının taşıyıcıları olan kum sineği türlerini kontrol etmek için gerekli önlemleri almalıdır. Kum sineklerini kontrol etmek, (CL) hastalığı kontrol etmenin anahtarı olacaktır. Mikroskobik inceleme, insan hastaların vakalarından elde edilen 135 kişiden 82'si (65.6) CL ile smear örneklerinin boyanmasını takiben yağa daldırma ışık mikroskobu (100X) kullanılarak gerçekleştirildi. Cinsiyetler arasında anlamlı fark vardı (P>0.05) ve bu oran erkeklerde kadınlardan daha yüksekti (84 (%62.2) ve 51 (%37.8). KL önemli bir sıklığa sahipti ve Mahmur bölgesinde en sık görülen endemik hastalıktı. Bu çalışmada 82 hastada (%65.6) laboratuvar ortamında KL enfeksiyonu saptandı. KL enfeksiyonunun genç yaş gruplarını etkileme olasılığı daha yüksektir. Araştırma, bir yaşından küçük çocuklarda iki ciddi ve çok sayıda CL lezyonu vakası keşfetti. 63 vakada (%46.6) KL en sık 1-25 yaş aralığında görüldü.Klinik sonuçlar açısından KL'den en sık etkilenen bölgeler 62/135 hastada (%45.9) üst ekstremiteler, 39/135 hastada (%28.9) alt ekstremiteler ve 28/135 hastada (%20.7) yüz (kulaklar ve burun dahil) idi. Ek olarak, 6/135 hastanın (%4.4) vücudunda KL lezyonlarının bulunduğu birkaç organ vardı. P<0.05 bu sonuçların istatistiksel olarak anlamlı olduğunu göstermektedi. Bulgulara göre, enfeksiyon oranı Şubat, Ocak ve Mart aylarında orta ortalama sıcaklıklarda (Cº) daha yüksekti. Buna karşılık, oran Nisan, Mayıs, Haziran, Temmuz, Ağustos ve Eylül aylarının daha sıcak aylarında azaldı (enfeksiyon oranları sırasıyla% 4.4, % 6.7,% 3.7,% 3.7,% 3.7,% 3.7 ve% 3.7), ancak Ekim ayında sıfırdı. Bu verilerde KL oranında anlamlı farklılıklar görüldü (P<0.05). Ocak, Şubat ve Aralık aylarının kış ayları en yüksek yüzdeye sahipken, yaz ve sonbahar en düşük yüzdeye sahipti. Bu çalışmada kum sinekleri spp. ortaya çıkması ile kutanöz leishmaniasis olguları arasındaki ilişki araştırılmaya çalışılmıştır. Çalışma bulguları ışığında, çalışmada ortaya çıkan kum sinekleri spp. ile kutanöz leishmaniasis hastalığı arasında güçlü bir ilişki olduğu fark edilmiştir. İstatistiksel analiz sonuçları, aylar arasında (P<0.05) önemli farklılıklar olduğunu göstermektedir. Yıl boyunca mevcut CL'nin iki zirvesi vardı, ilk zirve Şubat'ta, ikinci zirve ise Aralık'taydı. Leishmania parazit inkübasyon süresi ile Kum Sinekleri ve kutanöz leishmaniasis olgularının ortaya çıkışı karşılaştırıldığında, istatistiksel analiz (P<0.05) noktasında anlamlı farklılıklar ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Phlebotomine sandflies are an important group of insects from a medical perspective that are responsible for the transmission of leishmaniasis. The phenotypic and genotypic investigation of species of sand flies (Al-Harms) as the vector of CL, with the microscopic investigation of bio-Ecological CL in Patients was conducted in the Erbil province-Iraq for the first time between January and December 2022. Out of 2054 collected samples 1137 (55.4%) were male and 917 (44.6%) were female. statistically, there is no correlation between gender and sandfly species at (P=0.20). Three species were identified as belonging to the genus Phlepotomus: P. papatasi, P. sergenti, and P. alexandria. P. papatasi was the most common species, with 1163 (15.6%), followed by P. sergenti 598 (29.1%), and P. alexandri 293(14.1%). There were two peaks of seasonal abundance of sand flies, the first peak of the seasonally abundant CL vectors occurred in May, while the second peak occurred in September, statistically, there is a correlation between the periods and sand fly species at (p<0.05). This study used sequencing analysis of the mtDNA COI gene region to verify the results of morphological identification of sandfly species in Erbil province, Iraq. The current work used PCR-direct sequencing to find and identify P. papatasi, P. sergenti, and P. alexandria. originated from Erbil province endemic CL. According to a phylogenetic tree analysis using the Phlebotomus species standard NCBI BLAST program, local Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti, and Phlebotomus alexandri isolates from various places in the Erbil province were subjected to DNA sequencing. Phlebotomus papatasi, Phlebotomus sergenti, and Phlebotomus alexandri isolates from the local area were used to analyze the mtDNA COI gene sequence using M'EGA 6.0, a multiple alignment analysis tool. The city's health system must take the necessary precautions to control sand fly species as the vectors of CL disease. Controlling the sandflies will be a key to controlling (CL) disease. The microscopic investigation was carried out using oil immersion light microscopy (100X) subsequent to the staining of smear samples, due to of getting treatment or contamination the human CL cases: only 82(65.6%) cases were positive CL, out of 135 obtained from human patients' cases. There was significant difference between the genders at (P>0.05) in the CL rate, which was higher in males than females 84(62.2%) versus 51 (37.8%). CL had a significant frequency and was the most frequent endemic disease in the Makhmur district. In this investigation, 82patients (65.6%) were shown to have CL infection in a lab setting. A CL infection is more likely to affect younger age groups. The investigation discovered two cases of severe and numerous CL lesions in children younger than a year old. At 63 cases (46.6%), CL was most common in the 1 to 25-year-old age range. In terms of clinical outcomes, the most frequently affected areas by CL were the upper limbs in 62/135 patients (45.9%), the lower limbs in 39/135 patients (28.9%), and the face (including the ears and nose) in 28/135 patients (20.7%). Additionally, 6/135 patients (4.4%) had several organs in their bodies where CL lesions were found. P<0.05 indicates that these results are statistically significant. According to the findings, february 2022, January 2022, March 2022, December 2022 and November 2022 all had higher infection rates (31.9%, 20%, 9.6%, 6.7% and 5.9% respectively). Following that, there was a significant decline in the rates. According to the findings, the rate of infection was highest in the months of February, January, and March at moderate mean temperatures (Cº). In contrast, the rate decreased in the hotter months of April, May, June, July, August, and September (infection rates: 4.4%, 6.7%, 3.7%, 3.7%, 3.7%, and 3.7%, respectively), but it was zero in October. Significant variations in the rate of CL were seen in these data at (P<0.05). The winter months of January, February, and December had the highest percentage, while the summer and fall had the lowest. The study tries to find out the correlation between emerging of sand flies spp. and CL cases. In the lighting of study findings, the study noticed a strong relationship between emerging sand flies spp. and CL disease. In comparing the Leishmania parasite incubation period to the emergence of Sandflies and CL cases, statistical analysis reveals significant differences at (P<0.05). There were two peaks of existing CL. along the year, first peak was in February and the second peak was in December.

Benzer Tezler

  1. Bor içeren yeni bir antibiyotik epetraborole (AN3365)'e karşı duyarlı olan escherichia coli mutantlarının Keıo koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi

    Determination of escherichia coli mutants sensitive to a novel boron containing antibiotic epetraborole (AN3365) by screening Keio collection

    ANARA BABAYEVA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL

  2. Esbl pozitif ve karbapenemaz üreten klebsiella pneumoniae suşlarındakarbapenem direncinin fenotipik ve moleküler yöntemlerle saptanması

    Detection of carbapenem resistance in ESBL-positive and carbapenemase-producingklebsiella pneumonia strains using phenotypic and molecular methods

    BÜŞRA KAYIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YAVUZ UYAR

  3. Ürolitiyazisli hastalardan izole edilen bakteri suşlarının biyofilm oluşturma yeteneğinin fenotipik ve moleküler olarak değerlendirilmesi

    Phenotypic and molecular evaluation of biofilm-forming ability of bacterial strains isolated from patients with urolithiasis

    MOHAMMED MUNADI MOHAMMED MOHAMMED

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERHAT SİREKBASAN

    DOÇ. DR. ASAL AZİZ TAWFEEQ

  4. Çiğ inek sütü kaynaklı enterobacterıaceae izolatlarında AmpC beta-laktamazların varlığının fenotipik ve moleküler incelenmesi

    Phenotypic and molecular analyses of AmpC beta-lactamases in enterobacteriaceae isolates originated from raw cow milk

    BEDRİ APAYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL