Investigation of the effect of v-set transmembrane domains containing-5 (VSTM5) protein on the growth rate of consensus molecular subtype -1 (CMS1) group colon adenocarcinoma cell line cells
V-set transmembran domain içeren-5 (VSTM5) proteininin konsensüs moleküler alt tıp-1 (CMS1) grubu kolon adenokarsinoma hücre hattı hücrelerinin büyüme hızına etkisinin incelenmesi
- Tez No: 856287
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BARIŞ EMRE DAYANÇ, DOÇ. DR. OSMAN DOLUCA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Adherent hücreler, Biyobelirteçler-tümör, Adherent cells, Biomarkers-tumor
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Ekonomi Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolon kanseri hastalarının konsensüs moleküler alt tiplere (CMS) sınıflandırılması yeni bir yaklaşım olup, henüz bu hastalığın klinik pratik rehberlerine girmemiştir. Bu sınıflandırmanın, hastalığın prognozunun öngörülmesine yardımcı olarak tedavi yaklaşımlarının belirlenmesine katkı vermesi beklentisi, translasyonel araştırmalar için konuya ilgiyi arttırmaktadır. Günümüzde kullanılan klinik karar destek sistemlerinde hastalık prognozunu öngörmek önem kazanmakta ve bu amaçla moleküler belirteçlere ihtiyaç duyulmaktadır. Çalışma ekibimizin yaptığı in silico çalışmalarda, CMS1 grubu kolon kanseri hastalarında sağkalım süresi ile pozitif korelasyon gösteren VSTM5 geninin, nöral gelişim üzerinde etkisi olduğu, sitotoksik T lenfositleri üzerinde immünosupresif etkisi olduğu ve T hücre proliferasyonunu inhibe ettiği bildirilmiştir. VSTM5 geninin sağkalıma etkisinin farklı mekanizmalar ile olabileceği değerlendirip, bunlardan en temeli olan kolon kanseri hücrelerinin bölünme hızına etkisinin bu tez kapsamında incelenmesi amaçlanmıştır. For this purpose, we determined the basal expression levels of VSTM5 in CMS1 group of colon cancer cell lines and cloned the coding sequence of VSTM5 to the mammalian expression vector pcDNA3-EGFP. Elde edilen sonuçların, literatürde kısıtlı çalışmaya sahip olan VSTM5 geninin, CMS1 grubu kolon kanseri hücre hatlarının büyümesine etkisi hakkında literatüre katkı sağlaması ve sağkalıma etkisini açıklayabilecek diğer çalışmalara öncü olması beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
The classification of colon cancer patients into consensus molecular subtypes (CMS) is a recent protocol that has yet to be integrated into clinical practice guidelines. The anticipation of this classification contributing to the determination of treatment approaches by aiding in the prediction of the disease's prognosis augments the interest in this subject for translational research. At present, prognosticating disease outcome is becoming increasingly significant in clinical decision-making systems, compelling the use of molecular markers. Our team's in-silico investigations have revealed that the VSTM5 gene, which is positively associated with survival in CMS1 group colon cancer patients, has an impact on neural development, immunosuppressive effects on cytotoxic T lymphocytes, and restrains T cell proliferation. This thesis explores the potential dual mechanisms underlying the influence of the VSTM5 gene on survival. Specifically, the investigation focuses on the impact of the VSTM5 gene on the growth rate of colon cancer cells. For this purpose, we determined the basal expression levels of VSTM5 in CMS1 group of colon cancer cell lines and cloned the coding sequence of VSTM5 to the mammalian expression vector pcDNA3-EGFP. The results of this research endeavor are expected to make a valuable contribution to the existing literature on the limitedly studied effects of the VSTM5 gene on the growth of CMS1 group colon cancer cell lines and its consequent impact on survival.
Benzer Tezler
- Investigation of the effect of V-set transmembrane domains containing-5 (VSTM5) protein on the growth rate of consensus molecular subtype -1 (CMS1) group colon adenocarcinoma cell line cells
V-set transmembran domain içren-5 (VSTM5) proteininin konsensüs moleküler alt tip-1 (CMS1) grubu kolon adenokarsinoma hücre hattı hücrelerinin büyüme hızına etkisinin incelenmesi
ADİLE BUSE ANDAÇ AKTAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyolojiİzmir Ekonomi ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BARIŞ EMRE DAYANÇ
DOÇ. DR. OSMAN DOLUCA
- An investigation of the effect of operating variables on separation performance of teetered bed separator
Kabaran yataklı ayırıcıda işlem değişkenlerinin ayırım performansına etkisinin incelenmesi
ATAALLAH BAHRAMI
Doktora
İngilizce
2014
Maden Mühendisliği ve MadencilikHacettepe ÜniversitesiCevher Hazırlama Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEVKET LEVENT ERGÜN
- Kaplama basıncının amorf InGaZnO ince filmler ve Schottky diyotlar üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of deposition pressure on amorphous InGaZnO thin film and Schottky diodes
GÜRKAN KURTULUŞ
Doktora
Türkçe
2024
Fizik ve Fizik MühendisliğiGazi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN ÖZÇELİK
- 11-12 yaş kadın yüzücülerin antropometrik ölçümlerinin esneklik parametresi üzerine etkisinin incelenmesi
Female age 11-12 investigation of the effect of flexibility parameters of anthropometric measurements of the swimmers
SERDAR ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
SporYüzüncü Yıl ÜniversitesiBeden Eğitimi ve Spor Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABUZER TAŞ
- Mg-4Sn-2Al alaşımına ilave edilen alaşım elementlerinin mekanik ve korozyon özelliklerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of alloy elements added to Mg-4Sn-2Al alloy on mechanical and corrosion properties
PENBE KURT
Doktora
Türkçe
2023
Metalurji MühendisliğiSakarya ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN CAN KURNAZ