Peptit temelli nanomateryallerin hazırlanması ve hücresel etkileşimlerinin incelenmesi
Preparation of peptide-based nanomaterials and investigation of their cellular interactions
- Tez No: 855182
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ODABAŞI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aksaray Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kanser hastalıklarına karşı alışılagelmiş tedavi yöntemlerinde rastlanan tümör invazyonu, farklı dokulara tümörün yayılması ve çoklu ilaç direnci gibi dezavantajlardan ötürü, yeni yöntemler geliştirmek büyük öneme sahiptir. Gen terapisi alanında terapötik geni hedef dokuya taşıyan, kendiliğinden düzenlenme, biyo-uyumluluk ve biyo-bozunurluk gibi avantajlara sahip nano-materyallerin üretiminde öne çıkan peptit temelli yapılara, moleküler tanıma fonksiyonları nedeniyle her geçen gün ilgi artmaktadır. Tez kapsamında, gen susturucu olarak kullanılan siRNA'ları kanser hücrelerine taşımak üzere kendiliğinden düzenlenebilen boyutu ve dengelenmiş yüzey yükü bakımından yeni olan difenilalanin amid (FFA) temelli nano-materyaller (NM) sentezlendi. FFA-NM'ler sentezlendikten sonra Ca2+ iyonları ile dekore edildi. Karakterizasyon çalışmaları kapsamında SEM (taramalı elektron mikroskobu), TEM (transmisyon elektron mikroskobu), MS (kütle spektrometresi), DLS (dinamik ışık saçılma), Zeta-potansiyel ölçümü, Image J boyut değerlendirmesi ve FTIR (Fourier dönüşümü kızılötesi) spektroskopisi ile analiz edildi. Biyolojik moleküllerle korona oluşturma potansiyellerini değerlendirmek için sentezlenen FFA ve Ca2+-FFA-NM'ler HSA, IgG ve DNA molekülleri ile etkileştirildi. NM'lerin yüzeyinde oluşan korona tabakası DLS ve spektrofotometrik olarak değerlendirildi. Gerçekleştirilen hücre toksisite ve internalizasyon testlerinden sonra elde edilen bazı bulgular şöyle özetlenebilir: Ortalama boy dağılımı 87,93 nm olan FFA-NM'lerin yüzey yükleri -20,1 mV iken Ca2+ dekorasyonundan sonra +9,3 mV olmuştur. Yüzey yük dağılımı, Ca2+-FFA-NM'lerin HSA, IgG ve DNA molekülleri ile oluşturduğu korona yapılarına göre de sırasıyla -7,6, -3,7 ve -9,7 mV olarak belirlenmiştir. Ca2+-FFA-NM'lerin HeLa ve HT29 hücre hatlarıyla 24 saatlik etkileşimleri sonrasında toksisite görülmemiştir. Farklı siRNA türlerinin (Mcl-1 ve Bcl-xL) Ca2+-FFA-NM'ler ile oluşturduğu komplekslerinin HeLa ve HT29 hücre hatlarına internalize olduğu ve canlılıklarında yaklaşık %36 oranında bir azalmaya neden olduğu görülmüştür. Bu çalışmada kullanılan FFA tabanlı NM'ler biyo-uyumlu olup, susturucu siRNA'ların kanser hücrelerine internalizasyon derecesini artırmak için yapılacak olan daha ileri çalışmalarda umut vadedeceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Traditional treatment methods for cancer diseases encounter disadvantages such as tumor invasion, the spread of tumors to different tissues, and multiple drug resistance. Therefore, developing new methods is of great importance. In the field of gene therapy, there is a growing interest in peptide-based structures that stand out in the production of nanomaterials with advantages such as self-regulation, biocompatibility, and biodegradability, thanks to their molecular recognition functions. In the scope of this thesis, novel nanomaterials (NM) based on diphenylalanine amide (FFA), which are self-regulating in terms of size and balanced surface charge and are novel for carrying small interfering RNA (siRNA) as a gene silencer to cancer cells, were synthesized. After the synthesis of FFA-NMs, they were decorated with Ca2+ ions. Characterization studies included analysis using scanning electron microscopy (SEM), transmission electron microscopy (TEM), mass spectrometry (MS), dynamic light scattering (DLS), Zeta potential measurement, Image J size assessment, and Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy. To evaluate their potential in forming coronas with biological molecules, the synthesized FFA and Ca2+- FFA-NMs were interacted with HSA, IgG, and DNA molecules. The corona layer formed on the surface of NMs was assessed both by DLS and spectrophotometrically. Some findings obtained after conducting cell toxicity and internalization tests can be summarized as follows: The average size distribution of FFA-NMs, which was 87.93 nm, had a surface charge of -20.1 mV, while after Ca2+ decoration, it became +9.3 mV. Surface charge distribution of Ca2+-FFA-NMs occurred as -7.6, -3.7, and -9.7 mV, respectively, depending on the corona structures they formed with HSA, IgG, and DNA molecules. No toxicity was observed after the 24-hour interaction of Ca2+-FFA-NMs with HeLa and HT29 cell lines. Complexes formed by different siRNA types (Mcl-1 and Bcl-xL) with Ca2+-FFA-NMs were internalized into HeLa and HT29 cell lines, leading to an approximately 36% decrease in their viabilities. The FFA-based NMs used in this study are considered as biocompatible and are believed to hold promise for future advanced studies aimed at increasing the internalization degree of silencing siRNAs into cancer cells.
Benzer Tezler
- Hücresel etkileşimlerinin incelenmesi için dipeptit temelli nanopartiküllerin hazırlanması ve karakterizasyonu
Preparation and characterization of dipeptide-based nanoparticles for the study of their cellular interactions
BURCU ÖNAL ACET
- Peptit protein yapılı etkin madde içeren lipit temelli ilaç taşıyıcı sistemlerin geliştirilmesi
Development of lipid-based drug delivery systems containing biologically active peptide protein
SEVAL OLĞAÇ
Doktora
Türkçe
2025
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP ŞAFAK TEKSİN
- Antimikrobiyal peptit olan GFP-myxinidin ile zenginleştirilmiş bakteriyel selüloz temelli hidrojel yara örtüsü geliştirilmesi
Development of a bacterial cellulose-based hydrogel wound dressing enriched with the antimicrobial peptite GFP-myxinidin
DERYA İLKE GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT
DOÇ. DR. AHMET KATI
- Buhar fazı biriktirme yaklaşımı ile peptit temelli 3-boyutlu yapıların üretimi
Production of peptide-based 3-D structure with physical vapor deposition method
VAFA SAHIBBAYLI
- İlaç taşıyıcı sistemlerde kullanılmak üzere PEtOx-ko-PEI esaslı nanojel ve Sars-CoV-2 tedavisine yönelik peptit temelli ilaç adaylarının sentez ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of PEtOx-co-PEI-based nanogel for use in drug carrier systems and peptide-based medicine candidates for SARS-CoV-2 therapy
MELİKE ERTEM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Polimer Bilim ve TeknolojisiMarmara ÜniversitesiPolimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLHAN KAYAMAN APOHAN
DR. ÖZGÜR YILMAZ