Antigenic peptide discovery and multi epitope vaccine design of Trichomonas vaginalis pathogen using in silico bioinformatics
Siliko biyoinformatikte kullanılan Trıchomonas vagınalıs patojeninin antijenik peptit keşfi ve çoklu epıtop aşısı tasarımı
- Tez No: 837273
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET EFE KÖSEOĞLU, PROF. DR. ELİF SİBEL ASLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Biruni Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Trichomoniasis, dünya çapında en yaygın viral olmayan cinsel yolla bulaşan enfeksiyon (STI), trikomonas vaginalis protozoanın neden olduğu, bu hastalıklar için onaylanmış ve etkili ilaca karşı farklı bir direnç mekanizması geliştirdi. Bu nedenle, insanı bu patojene karşı önleyebilecek ve aşılayabilecek potansiyel bir aşı geliştirmek için saat gerekir. Biyoinformatik ve immünoinformatik yaklaşımları kullanarak, aşı tasarımını oluşturmak için farklı B hücresi ve T hücresi epitoplarının tahmin edildiği, en antijenik, alerjik olmayan ve toksik olmayan epitopları seçmek için epitopların tüm fiziko-kimyasal parametreleri analiz edildi, Epitoplara ek olarak, bağışıklığı arttırmak için adjuvan ve aşı adayını oluşturmak için EAAAK, AAY ve GPGPG gibi bağlayıcılar birleştirildi Silico'da umut verici sonuçlar gösteren gelişmiş aşı yapısı ve in vitro ve in vivo test edilecekse iyi sonuçlar gösterecektir.
Özet (Çeviri)
Trichomoniasis is the most common non-viral sexually transmitted infection (STI) worldwide, caused by trichomonas vaginalis protozoan, this latter, developed a different resistance mechanisms against the only approved and effective drug for this diseases. Therefore, it is need of the hour to develop a potential vaccine that can prevent and immunize the human being against this pathogen. Using bioinformatics and immunoinformatics approaches, different B cell and T cell epitopes were predicted to construct the vaccine design, all the physico-chemical parameters of the epitopes were analysed in order to select the most antigenic, non allergenic and non toxic epitopes, In addition to the epitopes, adjuvant in order to increase the immunity and linkers such as EAAAK, AAY and GPGPG were combined to construct the vaccine candidate The developed vaccine construct showing promising results in-silico and it will also show good results if it would be tested in-vitro and in-vivo.
Benzer Tezler
- Koyunlarda viral hastalık maedi-visna'ya karşı aşı geliştirilmesinde antijenik epitopların keşfi
Discovery of antigenic epitopes in vaccine development against viral disease maedi-visna in sheep
ECEM SU KOÇKAYA
- Structural and thermodynamic analyses of peptide-based nanomaterials via molecular dynamics simulations
Peptit bazlı nanomalzemelerin moleküler dinamik simulasyonlar aracılığı ile yapısal ve termodinamik özelliklerinin analizi
ÖZGE ŞENSOY
Doktora
İngilizce
2011
BiyofizikKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET SAYAR
- Expression, purification, and characterization of recombinant human IL-2
Rekombinant insan IL-2'nin ekspresyonu, saflaştırılması ve karakterizasyonu
BUSE AKGÜN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Nörotoksin analizi için immünassay geliştirilmesi
Development of immunoassay for neurotoxin analysis
MERYEM IŞIK
Doktora
Türkçe
2021
MikrobiyolojiKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NACİ ÇİNE
DOÇ. DR. SELMA ÖZTÜRK
- Türkiye'deki Vipera anatolica anatolica ve Vipera anatolica senliki alttürlerine ait yılanların zehirlerinin sitotoksik, anti-anjiyojenik ve apoptotik etkilerinin araştırılması
Investigation of cytotoxic, anti-angiogenic and apoptotic effects of venom of snakes belonging to Vipera anatolica anatolica and Vipera anatolica senliki species in Turkey
BURAK KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARİKA ATMACA İLHAN