Geri Dön

The effect of idh2 gene variation and tert gene variation in prostate cancer

IDH2 ve tert gen varyasyonlarının etkisinin prostat kanserinde araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 835587
  2. Yazar: FERDA ÖZKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TURGAY İSBİR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Yeni Nesil Dizileme, Prostate Kanseri, IDH2, TERT, Dizi analizi, Genetik varyasyon, Genler, Prostat hastalıkları, Prostat neoplazmları, Next Generation Sequencing, Prostate Cancer, IDH2, TERT, Sequence analysis, Genetic variation, Genes, Prostatic diseases, Prostatic neoplasms
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Prostat kanseri dünya genelinde en yaygın görülen kansere bağlı ölümlerin başında gelmektedir. Patolojik sınıflandırmanın ve çok sayıda tedavi seçeneğinin varlığına rağmen, moleküler alt yapısı tam olarak aydınlatılamamış olması nedeniyle, hala yüksek metastatik yapıya sahip, kemoterapi direnç bir hastalıktır. Prostat kanserinde yeni nesil dizileme yöntemini ile IDH2 ve TERT hedef genlerinde varyasyonların varlığını saptamak bu çalışmanın ana hedefidir. Yeditepe Üniversitesi Hastanesi'nde prostat kanseri tanısı alan yirmi yedi hastanın kan örnekleri analizler için kullanılmıştır. Çalışma populasyonun yaş ortalaması 68 olup, %88.89'u 60 yaş ve üzeri iken %11.11'i 60 yaşın altı bireylerdir. Hasta grubunun klinik verileri incelendiğinde, ortalama prostat hacmi 43.59 cc, PSA seviyesi 31.28 ng / mL, Gleason skoru yedi ve üzerinde olan on üç hasta ve yediden küçük on dört hasta olduğu belirlenmiştir. Yeni nesil dizileme ile IDH2 ve TERT genleri incelenmiş ve beş varyasyon tespit edilmiştir. Bu varyasyonların 1'i IDH2 geninde, 4'ü ise TERT geninde saptanmıştır. IDH2'de tespit edilen 1 varyant heterozigot 2 hastada görülmüştür. TERT geninde ise ekzonik bölgede yer alan dört varyant tespit edilmiştir. Bunlardan c.3039C>T varyantı heterozigot 6 hastada, c.1392C>T varyantı heterozigot 1 hastada, c.915G>A varyantı 4'ü homozigot ve 14'ü heterozigot olmak üzere toplam 18 hastada, c.261G>T varyantı ise heterozigot bir hastada belirlenmiştir. Bu beş varyant arasında klinik önemi belirsiz olarak belirlenen varyant muhtemel zararlı olarak tanımlanmıştır. Muhtemel zararlı olduğu belirlenen bu varyantı taşıyan hastanın TERT c.261G>T heterozigot mutant olduğu Sanger sekanslaması ile teyit edilmiştir. Çalışmamızda tespit edittiğimiz 5 varyant prostat kanseri için yeni biyobelirteç niteliği taşımakta olup, mutasyonların büyük çoğunluğu bu kanser türünde gösterilmemiştir. Verilerimizin daha geniş örneklem ile gerçekleştirilecek araştırmalar ile doğrulanması sonucunda, prostat kanserinin moleküler düzeyde aydınlatılamamış noktalarının açıklığa kavuşmasını sağlayarak patolojik sınıflandırmanın yeniden düzenlenmesine katkı sunacaktır.

Özet (Çeviri)

Worldwide, prostate cancer is the leading cause of death from cancer in males. It is still a chemotherapy-resistant disease with a highly metastatic potential, despite its pathological classification and the availability of numerous treatments because its molecular foundation has not yet been completely understood. The primary objective of this research was to use next-generation sequencing technology to identify variations in the IDH2 and TERT target genes in prostate cancer. For the study, blood samples from 27 patients at Yeditepe University Hospital who had been identified with prostate cancer were used. The mean age of the study population was 68 years of age; 88.89% of them were 60 years and older, and 11.11% were individuals under 60 years of age. The mean prostate volume and PSA level for the patient with prostate cancer were 43.59 cc and 31.28 ng/mL, respectively, according to clinical data. It was determined that there were fourteen patients with a Gleason score of less than seven and thirteen patients with a Gleason score of seven or higher. The IDH2 and TERT genes were examined using next-generation sequencing and five mutations were identified. One of these mutations was discovered in the IDH2 gene and four others within the TERT gene. One variant detected in IDH2 was seen in 2 heterozygous patients. Four variants located in the exonic region of the TERT gene have been identified. Of these, c.3039C>T mutation was heterozygous in 6 patients, c.1392 C>T heterozygous in 1 patient, c.915G>A in 18 patients, 4 of which were homozygous and 14 heterozygous, and c.261G> T was heterozygous in one prostate cancer patient. Among these five variants, TERT c.261G>T was identified as potentially harmful. It was confirmed by Sanger sequencing that the patient carrying the potentially harmful variant was heterozygous mutant. The five variations we found in our study hold a potential to serve as new prostate cancer biomarkers, and great majority of the mutations have not been associated with this cancer type. It will help to rearrange pathological categorization by explaining the molecularly inexplicable characteristics of prostate cancer in accordance with further validation of our findings with studies to be conducted with a larger sample size.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    886232

    Yeni nesil dizileme yöntemiyle solid tümör örneklerinde kanserle ilişkili genlere ait patojenik varyantların belirlenmesi ve hastalıkla olan ilişkisinin araştırılması

    Identification of pathogenic variants in cancer-associated genes and investigation of their relationship with the disease in solid tumor samples using Next-Generation Sequencing(NGS) method

    CANSU ÖĞE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    GenetikKocaeli Üniversitesi

    Tıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NACİ ÇİNE

  2. Tez No

    701805

    Determination of IDH 1, IDH2, MGMT, TERT, ATRX and H3F3A gene mutations in glial tumors

    Glial tümörlerde IDH 1, IDH2, NGMT, tert, ATRX ve H3F3A gen mutasyonlarının belirlenmesı

    CUMHUR KAAN YALTIRIK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    NöroşirürjiYeditepe Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGAY İSBİR

  3. Tez No

    680523

    Investigation of isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1) mutation induced molecular and cellular changes in glioma

    Glioma'da ızositrat dehidrogenaz 1 (IDH1) mutasyonunun sebep olduğu moleküler ve hücresel değişikliklerin incelenmesi

    TANSU BİLGE KÖSE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    GenetikBahçeşehir Üniversitesi

    Sinir Bilimi Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TİMUÇİN AVŞAR

  4. Tez No

    753235

    Investigation of the effects of 2-hydroxyglutarate oncometabolite on colon cancer metabolism on cell models generated by CRISPR/Cas9-based gene therapy and in vivo models

    2-Hidroksiglutarat Onkometabolitinin Kolon Kanseri Metabolizması Üzerindeki Etkisinin CRISPR/Cas9-Tabanlı Gen Terapisi ile Oluşturulan Hücre Modelleri ve In Vivo Modeller Üzerinde İncelenmesi

    ESRA BULUT ATALAY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    GenetikDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜLYA AYAR KAYALI

    DOÇ. DR. ŞERİF ŞENTÜRK

  5. Tez No

    352641

    Anaplastik oligodendrogliomda kromozom 1P ve 19q'daki kombine delesyonun, IDH-1 gen mutasyonu ve p53 protein ekspresyonu ile korelasyonu ve klinikopatolojik parametrelerle ilişkisi

    The correlation between chromosome 1P/19q combined deletion, IHD1 gene mutation P53 protein overexpression and clinicopathologic parameters in anaplastic oligodendroglioma

    UĞURAY PAYAM AHMEDMAULID

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİLGE BİLGİÇ

Geri Dön