Kanser hücrelerinde epitel mezenkimal plastisitenin moleküler kökenlerinin araştırılması
Investigation of the molecular background of epithelial mesenchymal plasticity in cancer cells
- Tez No: 831131
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI SADE MEMİŞOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanser (KRK), anormal hücre büyümesi ve istilası ile karakterize karmaşık bir hastalıktır. Epitelyal-mezenkimal geçiş (EMT) ve hücresel plastisite, KRK progresyonu, metastaz ve tedavi direncinde önemli rol oynamaktadır. Ek olarak, histon modifikasyonları, özellikle H3K4me3 ve H3K27me3'ün bivalansı, kanser biyolojisinde önemli düzenleyiciler olarak ortaya çıkmıştır. EMT, epitelyal hücrelerin mezenkimal bir fenotipe dönüşümünü içerir, tümör agresifliğini ve tedaviye direnci artırır. Hücresel plastisite, kanser hücrelerinin farklı durumlar arasında geçiş yapmasına izin vererek tümör heterojenitesini ve tedavi direncini teşvik eder. Hem aktive edici hem de baskılayıcı işaretlere sahip olan H3K4me3 ve H3K27me3'ün bivalansı, gen ifadesini ve transkripsiyonel plastisiteyi etkiler. KRK'de EMT, plastisite ve histon bivalansı arasındaki etkileşimin anlaşılması, terapötik hedefler hakkında bilgi sağlayabilir ve hasta sonuçlarını iyileştirebilir. Bu mekanizmaların daha fazla araştırılması, KRK'ye karşı etkili tedavilerin geliştirilmesi için umut vaat etmektedir. Bu çalışmada, kolon kanserinde EMT'ye özgü farklı genlerin promotorlarında H3K4me3 ve H3K27me3 bivalansı incelenmiş ve ilgili genlerin ifadedeleri ile karşılaştırılarak yorumlanmıştır. Sonuçlar, hücreler MET-EMT'den geçerken, incelenen üç genin de promotorlarındaki bivalansın ortadan kalktığını göstermektedir. Kök hücre belirteçleri CD133 ve CD44'ün mRNA seviyeleri, hücreler epitel fenotipe geçerken önemli ölçüde azalmış ve mezenkimal durumda tekrar artmıştır. Aksine, epitel kolon kanseri grubunda CDX2'nin mRNA seviyesinde bir artış ve mezenkimal durumda bir azalma gözlemlenmiştir. Bu gözlemler, gen ifadesi ile ilgili promotorlardaki H3K4me3 ve H3K27me3 histon modifikasyonlarının bivalansı arasındaki ilişki hakkında değerli bilgiler sağlamaktadır. Hücreler daha tanımlı durumlara geçtikçe ve gen ifadesi durumu buna göre değiştikçe bivalans durumu kayboluyor gibi görünmektedir.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancer (CRC) is a complex disease characterized by abnormal cell growth and invasion. Epithelial-mesenchymal transition (EMT) and cellular plasticity play crucial roles in CRC progression, metastasis, and therapy resistance. Additionally, histone modifications, particularly the bivalency of H3K4me3 and H3K27me3, have emerged as important regulators in cancer biology. EMT involves the transformation of epithelial cells into a mesenchymal phenotype, enhancing tumor aggressiveness and resistance to treatment. Cellular plasticity allows cancer cells to transition between different states, promoting tumor heterogeneity and therapy resistance. The bivalency of H3K4me3 and H3K27me3, which possess both activating and repressive marks, influences gene expression and transcriptional plasticity. Understanding the interplay between EMT, plasticity, and histone bivalency in CRC can provide insights into therapeutic targets and improve patient outcomes. Further investigation into these mechanisms holds promise for developing effective treatments against CRC. In this study, we aim to inquire about promoter bivalency in genes related to EMT and MET in colon cancer. Our research findings indicate that as cells undergo MET-EMT, bivalency in the promoters of all three genes under studey has disappeared. The mRNA levels of stem cell markers CD133 and CD44 decreased significantly as the cells transition to an epithelial phenotype and increased in the mesenchymal state. On the contrary, we observed an increase in mRNA expression of CDX2 in the epithelial colon cancer group and a decrease in the mesenchymal state. These observations provide valuable insights into the relationship between gene expression and the bivalency of H3K4me3 and H3K27me3 histone modifications in these cells. The bivalency state seems to be lost as the cells transition into more defined states and the gene expression status changes accordingly.
Benzer Tezler
- Investigation of the role of OR2A7, expression level on epithelial-mesenchymal plasticity (EMP) in colorectal cancer cell lines
OR2A7, ekspresyon düzeyinin kolorektal kanser hücre hatlarında epitelyal mezenkimal plastisite (EMP) gelişimindeki rolünün araştırılması
TUTKU GÜLER
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiGenom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞERİF ŞENTÜRK
PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
- Prediction of prognosis and chemosensitivity in breast cancer
Meme kanserinde prognoz ve kimyasal duyarlılık tahmini
MUHAMMAD WAQAS AKBAR
Doktora
İngilizce
2020
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ OSMAY GÜRE
- Regulation of proline oxidase in colon carcinoma cells upon 5 fluorouracil treatment: Role of PRODH in cell death and epithelial-mesenchymal transition
Prolin oksidazın kolon karsinoma hücrelerinde 5-fluorourasıl uygulanmasına bağlı regülasyonu: PRODH'nın hücre ölümü ve epitel-mezenkimal geçiş üzerindeki rolü
TUĞÇE AYÇA ÇAĞLAR TEKİNER
Doktora
İngilizce
2017
BiyolojiSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELMA HÜVEYDA BAŞAĞA
- Time dependent expression and localization of connexin 32: implication in epithelial to mesenchymal transition of mammary epithelial MCF10A and triple negative breast cancer MDA MB 231 cells
Connexin 32'nin zamana bağlı ifadelenmesi ve lokalizasyonu: memeli epitel MCF10A ve üçlü negatif meme kanseri MDA MB 231 hücrelerinde epitelyal mezenkimal geçişlerindeki anlamı
YAĞMUR CEREN ÜNAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLİSTAN MEŞE ÖZÇİVİCİ
- Karayosunu özütlerinin kolon kanseri hücrelerin epitel-mezenkimal dönüşüme etkisi
Effect of moss extracts on the epithelial-mesenchymal transition in colon cancer cells
EZGİ SELÇUK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI SADE MEMİŞOĞLU