Design of temoporfin molecules functionalized with two-photon absorbing antennas and their potential use in photodynamic therapy
İki foton absorbe eden gruplarla işlevlendirilmiştemoporfin moleküllerinin tasarımı ve fotodinamik terapideolası kullanımları
- Tez No: 830688
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞARON ÇATAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Temoporfin molekülü, Avrupa Tıp Ajansı (EAM) tarafından 2003 yılında onaylanmasından bu yana bir fotodinamik terapi ilacı olarak kullanılmakta. Ancak, Temoporfin'in bu tedavi yöntemi kapsamında sudaki düşük çözünürlüğü ve yüksek agregasyon ihtimali gibi ciddi sınırlamaları mevcuttur. Bu sınırlamalar, bu moleklün etkinliğini arttırmak için bir fırsat sunmaktadır. Bu tezde, fotodinamik terapi için, Temoporfin molekülünün iki-foton emici boya molekülleri ile modifiye edilmesi sonucu oluşturulmuş, üç yeni ilaç molekülü önerilmiştir. Onerilen üç molekülün fotodinamik tedaviye uygunluğunu araştırmak için hesapsal bir çalışma yapılmıştır. Kuantum mekanik hesaplar çeşitli seviyelerde Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi ve Zamana Bağlı Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi kullanılarak tamamlanmıştır. Önerilen moleküllerin fotokimyasal özellikleri, yapılan hesaplamaların sonuçlarıyla aydınlatılmıştır. Moleküllerin biyolojik ortamdaki davranışlarını incelemek içinse Moleküler Dinamik metodundan faydalanılmıştır.
Özet (Çeviri)
Since its approval in 2003 by the European Agency of Medicine (EAM), temoporfin has been clinically used as a photosensitizer for photodynamic therapy. However, Temoporfin's significant limitations such as low solubility in water and high aggregation probability in biological environments have created a window of opportunity for increasing its efficacy through modifications. In this thesis, three new drug molecules are proposed and obtained by modifying the temoporfin molecule with the addition of three different two-photon absorbing (TPA) dye molecules. To explore the newly proposed molecules' suitability to photodynamic therapy, various theoretical chemistry tools are utilized such as Density Functional Theory (DFT), and Time-Dependent Density Functional (TD-DFT) on various levels of theory for quantum mechanical (QM) calculations. The results shed light on the electronic spectra of candidate drug molecules. Later, molecular dynamic techniques are exploited for further analysis of the novel drug molecules' behavior in settings similar to biological environments.
Benzer Tezler
- Temporin (1RNA VE 1RNB) ve türevlerinin bakteri hücre zarları üzerindeki etkilerinin hesaplamalı yapısal biyoloji yaklaşımıyla incelenmesi
Study of the effects of temporin (1RNA VE 1RNB) and its derivatives on bacterial cell membranes with computational structural biology approach
SUDE BÜYÜKKURT
- Design of canalet irrigation systems by discrete differential dynamic programming
Başlık çevirisi yok
UFUK ESİN
- Design of sampling plans used in quality control systems by the aid of personal computers
Başlık çevirisi yok
AHMET ERÇELEBİ
Yüksek Lisans
İngilizce
1988
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiYRD. DOÇ. DR. MACİT KARABAY
- Design of a convergence recorder and improvement of a load monitoring system for measurements in underground mines
Başlık çevirisi yok
TALAT DEVRİM VURAL
Yüksek Lisans
İngilizce
1988
Maden Mühendisliği ve MadencilikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiDOÇ. DR. ERDAL ÜNAL
- Design of a prolog precessor
Başlık çevirisi yok
ŞERİF SELÇUK
Yüksek Lisans
İngilizce
1989
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolOrta Doğu Teknik ÜniversitesiDOÇ. DR. ASUMAN DOĞAÇ
