Otizm spektrum bozukluğunda miR-135a-5p'nin ifade değişikliğinin incelenmesi
Investigation of expression change of miR-135a-5p in autism spectrum disorder
- Tez No: 819565
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜVEM GÜMÜŞ AKAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Fizyoloji, Psikiyatri, Genetics, Physiology, Psychiatry
- Anahtar Kelimeler: otizm spektrum bozukluğu, epigenetik, mikroRNA, miR-135a5p, Mikro RNA, Otistik bozukluklar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, autism spectrum disorder, epigenetics, microRNA, mir-135a-5p, Epigenetic, Micro RNA, Autistic disorder, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Otizm spektrum bozukluğu (OSB) erken çocukluk döneminde (2-6 yaş) belirtileri ortaya çıkan bir nörogelişimsel bozukluktur. Dünya üzerinde nüfusun %1- 2'sini etkileyen önemli bir sağlık problemidir. Prevalansı, 30 yıl öncesinde 4.4/10000 olarak bildirilirken günümüzde görülme sıklığındaki hızlı artış, OSB'nin nedenlerini anlamaya yönelik çalışmaların artmasını gerekli kılmıştır. Etiyolojisinde genetik ve çevresel faktörler rol oynamakla beraber, genetik çalışmalarda gözlemlenen kalıtılabilirlik boşluğu epigenetik mekanizmaların önemine işaret etmektedir. Epigenetik mekanizmalar arasında yer alan mikroRNA'lar (miRNA), mRNA'lar üzerinde post-transkripsiyonel olarak gen ifadelenmesini düzenleyerek hücredeki bölünme, çoğalma, farklılaşma gibi fizyolojik işlevleri etki etmektedir. Bu tez çalışmasında daha önceden gerçekleştirdiğimiz biyoenformatik analizler ile aday olarak belirlediğimiz miR-135a-5p'nin OSB'deki olası rolünün araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya 16 OSB'li ve 17 normal gelişim gösteren sağlıklı kontrol olmak üzere toplam 33 çocuk dahil edilmiştir. Plazma örneklerinde miR-135a-5p seviyesi qRT-PCR yöntemi ile belirlenmiştir. Sonuçlarımız istatistiksel olarak anlamlılık seviyesine ulaşmamış olmakla birlikte miR-135a-5p ifadesinin kontrol grubuna kıyasla OSB grubunda azalmış olduğunu göstermiştir. OSB şiddeti bakımından hafif+orta ve ağır OSB gruplarının miR-135a-5p seviyesinin benzer olduğu bulunmuştur. OSB grubunda klinik özellikler ile miR-135a-5p ifade düzeyi arasındaki arasındaki ilişki analiz edildiğinde, miR135a-5p ifade düzeyleri ile ODKL toplam puanı, TEDÖ-R-TV toplam puanı ve ÇODÖ toplam puanı arasında korelasyon bulunmamakla beraber, ODKL ölçeği alt başlıklarından Sosyal Beceri ve Öz Bakım ile miR-135a-5p ifade düzeyi arasında anlamlı pozitif korelasyon tespit edilmiştir. miR-135a-5p'nin özellikle kanser ve serotonerjik sistem ile ilişkisini destekleyen literatür ve biyoenformatik analiz bulguları bu tez çalışmasında elde edilen sonuçlarımızla birlikte değerlendirildiğinde, miR-135a-5p'nin OSB etyolojisinde aday molekül olarak daha ileri çalışmalara değer bir molekül olduğunu düşündürmektedir. Elde edilen sonuçlarımızın denek sayısının artırılarak doğrulanması ve ilave olarak hangi yolak/yolakların bu süreçte rol oynadığını anlayabilmek miR-135a-5p'nin hedefi transkriptler üzerinden işlevsel çalışmaların yapılması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Autism spectrum disorder (ASD) is a neurodevelopmental disorder that appears in early childhood (2-6 years). It is an important health problem affecting 1- 2% of the population in the world. While its prevalence was reported as 4.4/10000 30 years ago, the rapid increase in its incidence today necessitated more studies to understand the causes of ASD. Although genetic and environmental factors play a role in its etiology, the heritability gap observed in genetic studies points to the importance of epigenetic mechanisms. MicroRNAs (miRNAs), which are among the epigenetic mechanisms, affect physiological functions such as division, proliferation and differentiation in the cell by regulating post-transcriptional gene expression on mRNAs. In this thesis, it was aimed to investigate the possible role of miR-135a-5p in ASD, which we determined as a candidate with the bioinformatics analyzes we performed before. A total of 33 children, 16 with ASD and 17 with normal development, were included in the study. The level of miR-135a-5p in plasma samples was determined by qRT-PCR method. Our results showed that miR-135a-5p expression was decreased in the ASD group compared to the control group, although it did not reach the level of statistical significance. In terms of ASD severity, miR-135a-5p levels were found to be similar in mild+moderate and severe ASD groups. When the relationship between clinical features and miR-135a-5p expression level in the ASD group was analyzed, there was no correlation between miR-135a-5p expression levels and ABC total score, RBS-RTV total score, and CARS total score. A significant positive correlation was found between ABC Social Skills and Self-Care section and miR-135a-5p expression level. When the literature and bioinformatics analysis findings supporting the relationship of miR-135a-5p especially with cancer and the serotonergic system are evaluated together with our results obtained in this thesis study, it makes us think that miR-135a-5p is a molecule worthy of further studies as a candidate molecule in the etiology of ASD. It is necessary to carry out functional studies on the target transcripts of miR-135a-5p to confirm our results by increasing the number of subjects and to understand which pathway(s) play a role in this process.
Benzer Tezler
- Otizmde kalıtsal miRNA'ların hedef gen profillerinin ve ilişkili yolaklarının araştırılması
Investigation of the target gene profiles and their related pathways of inherited miRNAs in autism
NESLİHAN BAŞGÖZ
- Otızm spektrum bozukluğunda nöronal nitrik oksit sentaz 276 (NNOS276), nöronal nitrik oksit sentaz84 (NNOS84), superoksit dismutaz (sod) genlerinin incelenmesi
Association analysis of neuronal nitric oxide synthase276 (NNOOS276), neuronal nitric oxide synthase84 (NNOS84) and superoxide dismutase genes in autism spectrum disorders
SEVGKİ CHODZAOGLOU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. S. SALİH ZOROĞLU
- Otizm spektrum bozukluğunda COX-2-765G--C ve COX-2-1195A--G genlerinin incelenmesi
Association analysis of COX-2-765G--C and COX-2-1195A--G genes in autism spectrum disorder
İLYAS KAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Psikiyatriİstanbul ÜniversitesiÇocuk ve Ergen Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN SALİH ZOROĞLU
- Otizm spektrum bozukluğunda uyku alışkanlıklarının ve farklı parametrelerle olan ilişkisinin değerlendirilmesi
Assessment of sleep habits and related clinical parameters of sleep problems in children with autism spectrum disorders
TUBA MUTLUER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN ABALI
- Otizm spektrum bozukluğunda (2-5 yaş) immün sistemin değerlendirilmesi
.
AYFER ORHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Psikiyatriİstanbul ÜniversitesiÇocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN ABALI