Iraklı hastaların klinikte izole edilen çoklu ilaca dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi
Identification of antibiotic resistance genes in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates of Iraqi patients
- Tez No: 818799
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZGÜR KUZUKIRAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ JALEEL SAMANJE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: IBM NEBIOS, IBM NEBIOS
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Acinetobacter baumannii, ticari olarak mevcut birçok antibiyotiğe karşı çoklu ilaç direnci eğiliminin yüksek olması nedeniyle yoğun bakım ünitelerindeki (YBÜ) hastalar için ciddi bir sağlık sorunu olarak kabul edilmektedir. Araştırma için Ekim-Aralık 2022 tarihleri arasında Erbil şehrinde bulunan iki ayrı hastaneden toplam 150 örnek toplandı. Bakteriyel izolasyon ve tanımlama esas olarak geleneksel yöntemler kullanılarak gerçekleştirildi. Otuz iki izolat A. baumannii olarak tanımlandı ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tekniği kullanılarak teyit edildi. A. baumannii izolatlarının yanık örneklerinde 16 (%51,6), yara sürüntülerinde 9 (%29) ve balgam örneklerinde 6 (%19,3) yaygınlık gösterdiği tespit edildi. Bu izolatlar, rifampisin (%100), piperasilin, seftazidim (%93,7), tetrasiklin (%90,3), tigesiklin, amikasin, levofloksasin, gentamisin ve klaritromisin (%87,1), piperasilin/tazobaktam (%83,9), ampisilin/sülbaktam ve trimetoprim/ sülfametoksazol (%77,4), meropenem ve imipenem (%74,2) gibi çeşitli antibiyotiklere karşı yüksek direnç oranları sergiledi. Bununla birlikte, A. baumannii izolatları polimiksin B'ye hiç direnç göstermedi. İzolatların %6,25'inde çoklu ilaç direnci tespit edilirken, %84,37'sinde yaygın ilaç direnci gözlemlendi. Tetrasikline dirençli olan A. baumannii izolatlarının %55'inde tet(A) geni, izolatların %85'inde karbapenem direnci geni (blaOXA-51) bulundu. Ayrıca, izolatların %65'inde qnr geni bulundu. Polimiksin B, A. baumannii enfeksiyonlarının tedavisi için umut verici bir alternatif olarak belirlendi.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii is recognized as a significant healthcare challenge for patients in intensive care units (ICUs) due to its high propensity for multidrug resistance against a wide range of commercially available antibiotics. A total of 150 samples were collected from two distinct hospitals in Erbil city between October and December 2022. Bacterial isolation and identification were primarily carried out using conventional methodologies. Thirty-two isolates were identified as A. baumannii, and their confirmation was achieved using the polymerase chain reaction (PCR) technique. The prevalence of A. baumannii isolates was as follows: 16 (51.6%) in burn samples, 9 (29%) in wound swabs, and 6 (19.3%) in sputum samples. These isolates exhibited high resistance rates against various antibiotics, including rifampin (100%), piperacillin, ceftazidime (93.7%), tetracycline (90.3%), tigecycline, amikacin, levofloxacin, gentamycin, and clarithromycin (87.1%), piperacillin/tazobactam (83.9%), ampicillin/sulbactam, and trimethoprim/ sulfamethoxazole (77.4%), meropenem, and imipenem (74.2%). However, A. baumannii isolates did not exhibit resistance to polymyxin B. Multidrug resistance was detected in 6.25% of the isolates, while extensive drug resistance was observed in 84.37%. Among the A. baumannii isolates resistant to tetracycline, 55% carried the tet(A) gene, while 85% of the isolates harbored the carbapenem resistance gene (blaOXA-51). Furthermore, the qnr gene was found in 65% of the isolates. Polymyxin B was identified as a promising alternative for the treatment of A. baumannii infections.
Benzer Tezler
- Isolation and identification of pathogenic microorganism causing urinary tract infections and its relationship with interleukin-6 level and antibiotic resistance in Kirkuk province
Kerkük ilinde idrar yolu enfeksiyonlarına neden olan patojenik mikroorganizmaların izolasyonu, tanımlanması ve bunun interlökın-6 düzeyi ve antibiyotik direnci ile ilişkisi
ALI MOHAMMED ALI TAQI TAQI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ REMZİ ORKUN AKGÜN
- Virulence factors and antibiotic resistance of H. pylori isolated infection gastric Iraqi patients
Iraklı hastaların mide enfeksiyonundan izole edilen H. pylori'nin virülans faktörleri ve antibiyotik direnci
MOHAMMED ALAA MAHMOOD MAHMOOD
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ NAJEEB MOHAMMED HUSSEIN
- The virulence genes algL and algD in Pseudomonas aeruginosa isolated form skin burn and wound specimens of Iraqi patients
Iraklı hastaların deri yanık ve yara örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa'da algL ve algD virülans genleri
ABBAS HASAN GHLAIM AL-BAYATI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT
DR. ÖĞR. ÜYESİ SHAİMAA YOUSİF ABDULFATTAH
- Study of some bio chemical and oxidative strass parameters in serum of Iraqi leukemic patients
Iraklı lösemi hastaların serumundaki bazı biyokimyasal ve oksidatif stras parametrelerinin incelenmesi
BASMA JAWAD AMEEN AL-AMEEDEE
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU
- Iraklı hastalarda HHEX geni (RS1111875 ve RS7923837) polimorfizmi ile tip 2 Diabetes Mellitus arasındaki ilişki
Association between the HHEX gene (RS1111875 and RS7923837) polymorphism and type 2 Diabetes Mellitus in Iraqi patients
ISRAA TAREQ HASSAN AL-NUAIMI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EBRU ÖZDENİZ