2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi
The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021
- Tez No: 803438
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYFER BAKIR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Yoğun Bakım Ünitesi, SARS-CoV-2, kan dolaşımı enfeksiyonları, alt solunum yolu enfeksiyonları, antimikrobiyal direnç, COVID 19, Retrospektif çalışmalar, SARS virüsü, Sepsis, Solunum yolları enfeksiyonları, Solunum yolları hastalıkları, Yoğun bakım üniteleri, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Yoğun Bakım Ünitesi, SARS-CoV-2, kan dolaşımı enfeksiyonları, alt solunum yolu enfeksiyonları, antimikrobiyal direnç, COVID 19, Retrospective studies, SARS virus, Sepsis, Respiratory tract infections, Respiratory tract diseases, Intensive care units, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bakanlığı
- Enstitü: Ankara Etlik Şehir Hastanesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu tez çalışmasında, Ankara Dışkapı Yıldırım Beyazıt Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinde tedavi gören hastalardan gönderilen kan kültürü/alt solunum yolu örneklerinden izole edilen etkenlerin dağılımını ve gram negatif bakterilerin antimikrobiyal direnç oranlarını incelemek; elde edilen bu verilere pandemi etkisini, COVID-19 tanılı hastaları COVID-19 dışı tanılarla takip edilen hastalarla karşılaştırarak gözlemlemek amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: 1 Ocak 2018 ve 31 Aralık 2021 tarihleri arasındaki dört yıllık dönemde hastanemiz YBÜ'lerde tedavi gören toplam 3880 hastadan Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen 20107 adet kan kültürü ve alt solunum yolu örneği geriye dönük incelendi. Hastaların demografik bilgileri Hastane Bilgi Yönetim Sistemi'nden elde edildi. Kültürde anlamlı olduğu düşünülen etken üremesi saptanan örnekler; Pandemi Öncesi Dönem (PÖD), COVID-19 Pozitif (CP), COVID-19 Negatif (CN) şeklinde ayrılan üç grup arasında karşılaştırmalı olarak değerlendirildi. İzole edilen gram negatif bakterilerin, üç grup arasında antimikrobiyal duyarlılık verilerindeki değişimler tespit edildi. Bulgular: PÖD'den gönderilen 9409, CP'den gönderilen 3831, CN'den gönderilen 6867 adet örnek incelendi. Kültürde üreme saptanmayan alt solunum yolu örnekleri CP grubunda diğer iki gruba göre yüksek; üreme saptanan örnekler ve kontaminasyon düşünülen örnekler ise CP grubunda düşük bulundu. Kan kültürlerinde üreme saptanan örnekler PÖD'de her iki gruba göre, kontaminasyon olarak değerlendirilen örnekler CP ve CN'de PÖD'e göre artmış olduğu tespit edildi. Candida spp. üreme oranları, CP ve CN'de PÖD ile karşılaştırıldığında yüksek olduğu belirlendi. CP grubunda en az bir etken üremesi olan hastalarda ölüm oranı, üreme olmayan hastalara göre belirgin olarak artmıştı. CP'de gram negatif bakteri üremesi olan hastalarda ölüm oranı, gram pozitif bakteri üremesi olan hastalara göre yükselmişti. CP'de A. baumannii izolatlarının oranı PÖD ve CN'ye göre artmıştı. P. aeruginosa izolatlarının oranı ise CP'de azalmış olduğu tespit edildi. K. pneumoniae izolatlarının ertapeneme duyarlılığınında CP'de CN'ye göre düşüş gözlendi. İmipenem duyarlılığı ise CP ve CN'de PÖD'e göre düşüktü. Amikasin ve gentamisin duyarlılığında CP'de diğer iki gruba göre, trimetoprim sülfametoksazol duyarlılığında ise CP'de PÖD'e göre azalma tespit edildi. E. coli izolatlarında amoksisilin klavulonik asitin duyarlılığı CP'de CN'ye göre azalmış bulundu. Enterobacter spp. izolatlarında CP'de levofloksasin duyarlılığı CN'ye göre düşük bulundu. A. baumannii izolatlarında siprofloksasin, trimetoprim sülfametoksazol duyarlılık yüzdesi CP ve CN'de PÖD'e göre düşmüştü. P. aeruginosa izolatlarında seftazidim, sefepim, piperasilin tazobaktam, imipenem, siprofloksasin, levofloksasin duyarlılıkları CN ve CP'de PÖD'e göre azalmıştı. Sonuç: COVID-19 hastalarında hem kan kültürü hem de alt solunum yolu kültüründe üreme oranlarının diğer gruplara kıyasla düştüğü gözlendi. Ancak bu hastalarda ampirik antibiyotik kullanımının sık olması ve hasta başı gönderilen kültür sayısının azalması üreme saptanan örneklerin gerçek insidansını maskelemiş olabilir. CP grubunda üreme oranlarında düşüş gözlense de gram negatif bakterilerin dirençli suşlarında seçilim olması ve anlamlı etken üremesi tespit edilen hastalarda mortalitenin artması, bu hastalara yapılacak terapötik müdahalede dikkatli olunması gerektiğini göstermektedir. Sonuç olarak COVID-19 hastalarında sekonder bakteriyel enfeksiyon gelişiminde risk faktörleri iyi belirlenmeli, antimikrobiyal direnç konusunda YBÜ'lere özel sürveyans çalışmaları yapılmalıdır.
Özet (Çeviri)
Amaç: Bu tez çalışmasında, Ankara Dışkapı Yıldırım Beyazıt Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitelerinde tedavi gören hastalardan gönderilen kan kültürü/alt solunum yolu örneklerinden izole edilen etkenlerin dağılımını ve gram negatif bakterilerin antimikrobiyal direnç oranlarını incelemek; elde edilen bu verilere pandemi etkisini, COVID-19 tanılı hastaları COVID-19 dışı tanılarla takip edilen hastalarla karşılaştırarak gözlemlemek amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: 1 Ocak 2018 ve 31 Aralık 2021 tarihleri arasındaki dört yıllık dönemde hastanemiz YBÜ'lerde tedavi gören toplam 3880 hastadan Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen 20107 adet kan kültürü ve alt solunum yolu örneği geriye dönük incelendi. Hastaların demografik bilgileri Hastane Bilgi Yönetim Sistemi'nden elde edildi. Kültürde anlamlı olduğu düşünülen etken üremesi saptanan örnekler; Pandemi Öncesi Dönem (PÖD), COVID-19 Pozitif (CP), COVID-19 Negatif (CN) şeklinde ayrılan üç grup arasında karşılaştırmalı olarak değerlendirildi. İzole edilen gram negatif bakterilerin, üç grup arasında antimikrobiyal duyarlılık verilerindeki değişimler tespit edildi. Bulgular: PÖD'den gönderilen 9409, CP'den gönderilen 3831, CN'den gönderilen 6867 adet örnek incelendi. Kültürde üreme saptanmayan alt solunum yolu örnekleri CP grubunda diğer iki gruba göre yüksek; üreme saptanan örnekler ve kontaminasyon düşünülen örnekler ise CP grubunda düşük bulundu. Kan kültürlerinde üreme saptanan örnekler PÖD'de her iki gruba göre, kontaminasyon olarak değerlendirilen örnekler CP ve CN'de PÖD'e göre artmış olduğu tespit edildi. Candida spp. üreme oranları, CP ve CN'de PÖD ile karşılaştırıldığında yüksek olduğu belirlendi. CP grubunda en az bir etken üremesi olan hastalarda ölüm oranı, üreme olmayan hastalara göre belirgin olarak artmıştı. CP'de gram negatif bakteri üremesi olan hastalarda ölüm oranı, gram pozitif bakteri üremesi olan hastalara göre yükselmişti. CP'de A. baumannii izolatlarının oranı PÖD ve CN'ye göre artmıştı. P. aeruginosa izolatlarının oranı ise CP'de azalmış olduğu tespit edildi. K. pneumoniae izolatlarının ertapeneme duyarlılığınında CP'de CN'ye göre düşüş gözlendi. İmipenem duyarlılığı ise CP ve CN'de PÖD'e göre düşüktü. Amikasin ve gentamisin duyarlılığında CP'de diğer iki gruba göre, trimetoprim sülfametoksazol duyarlılığında ise CP'de PÖD'e göre azalma tespit edildi. E. coli izolatlarında amoksisilin klavulonik asitin duyarlılığı CP'de CN'ye göre azalmış bulundu. Enterobacter spp. izolatlarında CP'de levofloksasin duyarlılığı CN'ye göre düşük bulundu. A. baumannii izolatlarında siprofloksasin, trimetoprim sülfametoksazol duyarlılık yüzdesi CP ve CN'de PÖD'e göre düşmüştü. P. aeruginosa izolatlarında seftazidim, sefepim, piperasilin tazobaktam, imipenem, siprofloksasin, levofloksasin duyarlılıkları CN ve CP'de PÖD'e göre azalmıştı. Sonuç: COVID-19 hastalarında hem kan kültürü hem de alt solunum yolu kültüründe üreme oranlarının diğer gruplara kıyasla düştüğü gözlendi. Ancak bu hastalarda ampirik antibiyotik kullanımının sık olması ve hasta başı gönderilen kültür sayısının azalması üreme saptanan örneklerin gerçek insidansını maskelemiş olabilir. CP grubunda üreme oranlarında düşüş gözlense de gram negatif bakterilerin dirençli suşlarında seçilim olması ve anlamlı etken üremesi tespit edilen hastalarda mortalitenin artması, bu hastalara yapılacak terapötik müdahalede dikkatli olunması gerektiğini göstermektedir. Sonuç olarak COVID-19 hastalarında sekonder bakteriyel enfeksiyon gelişiminde risk faktörleri iyi belirlenmeli, antimikrobiyal direnç konusunda YBÜ'lere özel sürveyans çalışmaları yapılmalıdır.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen staphylococcus aureus suşlarının antibiyotiklere direnç oranlarının araştırılması
Investigation of antibiotic resistance rates of staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples
ZEHRA VARIŞ KARAKAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA BEHÇET
- 2018-2021 yılları arasında Gazi Üniversitesi Hastanesi İç Hastalıkları Yoğun Bakım Ünitesinde yatarken gastrostomi açılan hastaların genel özellikleri ve klinik sonuçları
General characteristics and clinical results of the patients who underwent gastrostomy while intensive care uni̇t stay in Gazi University Hospital Medical Intensive Care Unit between 2018 and 2021
MELTEM BÜŞRA ERDEMİR GÜLCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
İç HastalıklarıGazi Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞAHENDER GÜLBİN AYGENCEL BIKMAZ
- Gastrointestinal sistem endoskopisi için sedasyon uygulanan pediatrik hastalarda yüksek akımlı nazal kanül oksijen uygulaması ile klasik nazal kanül oksijen uygulamasının etkinliğinin karşılaştırılması
Comparison of the efficiency of high flow nasal cannula oxygen therapy and classical nasal cannula oxygen therapy in pediatric patients undergoing sedation for gastrointestinal system endoscopy
SAMİ OLCAY ÖZBAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Anestezi ve ReanimasyonSağlık Bilimleri ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ
- Sepsis ve septik şoklu çocuklarda hastalık ciddiyeti, kardiyak biyomarkerlar ve D-dimer değişkenliğinin prognoza etkileri
The effects of disease serious, cardiac biomarkers and D-dimer variation on prognos in children with sepsis and septic shock
GÖKSU BAŞARGAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ARGUN
- Çocuk acil servisine 2017 – 2022 yılları arası başvuran zehirlenme olgularının retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of poisoning cases applying to the pediatric emergency service between 2017 and 2022
ÖMER OSMAN DAĞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAKUP YEŞİL