Alzheimer hastalığının farklı düzeylerinin sınıflandırılmasında yapay zeka ve logit regresyon modellerinin karşılaştırılması
Comparison of artificial intelligence and logit regression models in the classification of different levels of alzheimer's disease
- Tez No: 799221
- Danışmanlar: PROF. DR. KEVSER SETENAY ÖNER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoistatistik, Biostatistics
- Anahtar Kelimeler: Alzheimer Hastalığı, Yapay Zeka, Makine Öğrenmesi, Ulusal Alzheimer Koordinasyon Merkezi, Demans, Logit modeli, Regresyon analizi, Sınıflandırma, Alzheimer's Disease, Artificial Intelligence Machine Learning, National Alzheimer's Coordinating Center, Alzheimer disease, Dementia, Logit model, Machine learning, Regression analysis, Classification, Artificial intelligence
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoistatistik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Demans türleri içinde en sık görülen Alzheimer hastalığı (AH) geri dönüşünü olmayan nörodejenaratif bir hastalıktır. Erken evrelerde tedaviye başlamak günlük işleyişin bir süre korunmasına yardımcı olmaktadır. Tanı için klinik bulgular, görüntüleme yöntemleri, laboratuvar incelemeleri, genetik testler ve nöropsikolojik envanterler, yapay zeka modellerinde hastalığın tespit edilmesine yardımcı olmaktadır. Bu amaçla, AH tanısında kullanılan envanter ve ölçümlerle lojit ve farklı makine öğrenmesi algoritmalarıyla hastalık seviyelerini belirlemek içim modeller kuruldu ve performans ölçütlerine göre değerlendirildi. Farklı senaryolu model sonuçlarının, AH düzeylerini sınıflandırması ve literatüre önerilmesi amaçlandı. Yöntem: Ulusal Alzheimer Koordinasyon Merkezi (NACC) veri tabanından hastalara ait demografik, genetik, nörobilişsel envanter sonuçları ve bunlara eklenen MRG tarayıcılarından hesaplanan beyin hacim/kalınlık ölçümleriyle AH'nin 4 farklı sıralı düzeylerini çoklu karşılaştırma için ince ayarlı farklı mimarili Sıralı Lojistik Regresyon, Rastgele Orman, Gaussian Naive Bayes, XGBoost, LightGBM ve Derin Sinir Ağı modelleri kuruldu. Eğitim ve test veri setleri için ayrılan modellerde, MRG ölçümleri için boyut indirgeme yöntemlerinden LLE ve her sınıftaki örnek sayısının dengesiz dağılımı sorununu gidermek için SMOTE teknikleri kullanıldı. Bulgular: Geliştirilen modellerin doğruluk oranı, F1 skoru, AUC değeri ve her bir sınıfa ait duyarlılık, özgüllük, kesinlik performans ölçütleri arasında benzerlikler olsa da AH düzeylerini en yüksek oranda sınıflayan SMOTE uygulanmayan Rastgele Orman modeli olduğu bulundu (F1 skoru: 0,86; doğruluk: 0,86 ve AUC: 0,95). Sonuç: Alzheimer hastalığının farklı düzeylerini tahmin etmek için uygun maliyetli ve yaygın kullanılan invaziv olmayan belirteçlerle erken tedavide riskli şüpheli hastaları belirlemek için NACC veri tabanlı makine öğrenmesi metodolojilerimiz kullanılabilir.
Özet (Çeviri)
Aim: Alzheimer's disease (AD), the most common type of dementia, is an irreversible neurodegenerative disease. Starting treatment in the early stages contributes to the maintenance of daily functioning for a certain period of time. For the diagnosis, clinical findings, imaging methods, laboratory examinations, genetic tests and neuropsychological inventories are used to facilitate the detection of the disease with artificial intelligence models. For this purpose, models were established to determine disease levels with the inventory and measurements used in the diagnosis of AD, logit and different machine learning algorithms, and were evaluated according to performance criteria. The aim of this dissertation is to classify the AD levels of the model results with different scenarios and to suggest them to the literature. Methods: Ordinal Logistics Regression, Random Forest, Gaussian Naive Bayes, XGBoost, LightGBM and Deep Neural Network models were established, with different architectures fine-tuned for multiple comparisons of 4 different sequential levels of AD using demographic, genetic, neurocognitive inventory results of patients in the National Alzheimer's Coordination Center (NACC) database and brain volume/thickness measurements calculated from MRI scanners added to them. In models reserved for training and test datasets, LLE, one of the size reduction methods for MRI measurements, and SMOTE techniques were used to address the problem of the uneven distribution of the number of samples in each class. Results: Although there were similarities between the accuracy rate, F1 score, AUC value, and sensitivity, specificity, and precision performance measures of each class, it was found that the Random Forest model without SMOTE was the highest classification for AD levels (F1 score: 0.86; accuracy: 0.86 and AUC: 0.95). Conclusions: NACC data-based machine learning methodologies can be used to identify suspected patients in early treatment with cost-effective and widely used non-invasive markers to predict different levels of AD.
Benzer Tezler
- Alzheimer hastalığının sınıflandırılmasında farklı makine öğrenmesi algoritma performanslarının incelenmesi
Investigation of different machine learning algorithm performances in the classification of Alzheimer's disease
İREM KÜÇÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyomühendislikDüzce ÜniversitesiElektrik-Elektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR DENİZ TOSUN
- The regulatory role of MiR-711 in amyloid beta induced neuroinflammation mediated by NLRP3 inflammasome complex
NLRP3 ınflamazom kompleksi aracılığıyla düzenlenen amiloid beta kaynaklı nöroinflamasyonda MiR-711'in düzenleyici rolü
ZEYNEP DİLHAN ÜN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Genetikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NAGEHAN ERSOY TUNALI
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- Alzheimer tipi demans ve koroner arter hastalarında asetilkolinesteraz gen ekspresyonu ve bazı biyomarkır düzeylerinin belirlenmesi ve asetilkolinesteraz enzim aktivitesinin belirlenerek bazı fenolik bileşiklerin bu enzim aktivitesi üzerine in vitro etkilerinin incelenmesi
Determination of some biomarker levels and acetylcholinesterase gene expression in patients alzheimer's type dementia and coronary artery, and investigation of the effect in vitro on this enzyme activity of some phenolic compounds, by determining the acetylcholinesterase activity
MESUT IŞIK
- Farklı dejeneratif demans hastalarında oksidatif hasar: Alzheimer hastalığında oksidatif makromolekül hasarının ve onarımının incelenmesi
Oxidative damage in different degenerative dementia patients: Evaluation of the oxidative macromolecular damage and repair in Alzheimer's disease
GAMZE TUNA
Doktora
Türkçe
2013
BiyokimyaDokuz Eylül ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. G. HÜRAY İŞLEKEL
PROF. DR. F. GÜLDAL KIRKALI