Mikrobt solid paternli akciğer tümörlerinin birbirinden ayrımında kullanılabilir mi?
Can microct be used to differantiate solid patterned LUNG tumors?
- Tez No: 798025
- Danışmanlar: PROF. DR. SERPİL SAK
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Patoloji, Pathology
- Anahtar Kelimeler: akciğer karsinomu, histopatoloji, mikro bilgisayarlı tomografi, parafin blok, yapısal parametreler, Akciğer, Akciğer hastalıkları, Akciğer neoplazmları, Karsinoma, Parafin, Tomografi-mikro bilgisayarlı, histopathology, micro computed tomography, paraffin block, pulmonary carcinoma, structural parameters, Lung, Lung diseases, Lung neoplasms, Carcinoma, Paraffin, Tomograph-micro computed
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Akciğer kanseri dünyada ve ülkemizde oldukça sık görülen ölümcül bir kanserdir. Mikroskopik inceleme, diğer tümörlerde olduğu gibi, tanı için altın standarttır. Farklı patternler gösteren akciğer tümörleri arasında bir grup tümör solid organizasyon gösterir. Solid paternli adenokarsinomlar, yassı hücreli karsinomlar ve tipik karsinoid tümörler bunlar arasında bulunmaktadır. Mikro bilgisayarlı tomografi (mikroBT), X-ışınları kullanan bir tomografik yöntemdir. Normal bilgisayarlı tomografiye benzer bir çalışma prensibi vardır; ancak mikroBT'nin voksel boyut hassasiyeti 1-50 mikrometre arasında değişmektedir. Bu da BT'lerde görüntülenebilenlerden çok daha hassas çözünürlüğe ulaşmaya fırsat verir. MikroBT ile histopatolojik görüntülere benzer görüntüler elde edilmesi mümkündür. Bu çalışmada mikroBT ile solid paternli farklı tip akciğer tümörünün birbirinden ayrılıp ayrılamayacağının analizi, tümöral ve non-tümöral akciğer parankiminin ayrılmasının araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada daha önce anabilim dalımızda tanı almış olan solid patern gösteren üç ayrı tip akciğer tümörüne ait birer hematoksilen-eozin kesit 3D HISTECH, Panoramic P250 Flash 3, Version Panoramic Scanner 3.0.2. ile taranarak tüm lam görüntüler (“whole slide image”/WSI) elde edilmiştir. Bu tümörlerin kesitlerine ait parafin bloklardan Bruker Skyscan 1275, (Kontich, Belgium) ile mikroBT görüntüleri elde edilmiştir. Bu görüntüler WSI'ler ile karşılaştırılarak incelenmiştir ve WSI'ler üzerinde seçilen“region of interest”(ROI) alanları ile elde edilen mikroBT görüntüleri üzerine aktarılmıştır. Elde edilen“volume of interest”(VOI) sahaları üzerinde yapılan hesaplamalar ile ortaya çıkan yapısal parametreler (yüzde nesne hacmi, yapısal kalınlık, kesişim yüzeyi, doğrusal yapı yoğunluğu, bağlantılılık, bağlantılılık yoğunluğu, açık gözeneklilik, kapalı gözeneklilik, yapı model indeksi) kullanılarak tümör alanlarının non-tümöral alanlardan ve tümörlerin birbirinden ayırt edilip edilemeyeceği araştırılmıştır. Verilerin analizinde IBM SPSS Statistics for Windows 23 programı kullanılmıştır. Kruskal Wallis testi, Mann-Whitney U testi, kümeleme analizi, Cohen's Kappa katsayısı, receiver operating characteristic (ROC) eğrisi, duyarlılık, seçicilik, 2“univariate”lojistik regresyon analizi, Spearman's rho korelasyon katsayısı analizleri yapılmıştır. P<0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir. Bulgular: Bu yöntemle, parafin blok düzeyinde, tümöral ve non-tümöral sahaların ayırıcı tanısının, mikroBT'den elde edilen sayısal parametreler aracılığıyla güvenle ayrılabileceği bulunmuştur (tüm p değerleri=0.00). Ayrıca solid akciğer adenokarsinomlarının, tipik karsinoid tümörlerden, yüzde nesne hacmi (YNH) parametresi açısından ayrıldığı bulunmuştur (p=0.011). Ayrıca bu çalışmada mikroBT ile hesaplanan yapısal parametreler ile bunların histolojik karşılıkları arasındaki ilişkiler ortaya konmuştur. Sonuç: MikroBT insan tümörlerinin tanısında kullanılma potansiyeli taşıyan bir yöntemdir. Bu yöntem rutin histopatolojik incelemeye yardımcı bir yöntem olarak kullanılabileceği gibi, üç boyutlu bir incelemeyi kısa sürede ve doku bütünlüğünü bozmadan yapabilme yeteneği ile gelecekte bazı alanlarda histopatolojik incelemenin yerine geçebileceği düşünülebilir. Tümörlü alanların tümörsüz alanlardan mikroBT parametreleri aracılığı ile ayrılabildiğini gösteren çalışmalar bulunmakla birlikte, mevcut çalışma literatürde solid paternli akciğer tümörlerinin birbirinden ayrılmasını araştıran ülkemizdeki ve dünyadaki ilk çalışma niteliğindedir. Bu çalışma ile henüz çok az veri bulunan bir alanda bu yeni yöntemin kullanımı ve olası yararına ait bilgi elde edilmiştir. Akciğer kanserinin sıklığı düşünüldüğünde bu yöntem Türkiye'de ve dünyada milyonlarca hasta için kullanılabilecek bir bilgiyi üretme potansiyelini taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
Aim: Lung cancer is a common and fatal cancer. As in other human tumors, microscopic examination is the gold standard for diagnosis of lung tumors. Common pulmonary tumors show various patterns, and there is a group of tumors showing solid organization. These include solid adenocarcinomas (SAc), squamous cell carcinomas (SqCC), and carcinoid tumors (CT). Micro computed tomography (microCT) is a tomographic method using X-rays. It has a working principle similar to conventional computed tomography; however, the voxel size of microCT varies between 1-50 micrometers. This gives the opportunity to reach a much more precise resolution than that can be obtained via conventional computed tomographies. It is possible to obtain images similar to histopathological images with microCT. In the current study, it was aimed to analyze whether different lung tumors with solid pattern can be differentiated from each other with microCT, and to investigate the differentiation of tumoral and non-tumoral lung tissue. Materials and methods: In this study, whole slide hematoxylin and eosin stained images (WSI) of three types of pulmonary tumors (5 SAc, 5 SqCC, 5 CT) were obtained using 3D HISTECH, Panoramic P250 Flash 3, Version Panoramic Scanner 3.0.2. scanner. MicroCT images were obtained from paraffin blocks of these tumors with Bruker Skyscan 1275, (Kontich, Belgium). These microCT images were examined by comparing them with WSIs, and the selected representative regions of interests (ROIs) on WSIs were transferred to the obtained microCT images. Structural parameters (percent object volume, structure thickness, intersection surface, structure linear density, connectivity, connectivity density, open porosity, closed porosity, structure model index) were calculated using the obtained volumes of interest (VOIs) and through these data, the differentiation of tumor types, and tumoral and non-tumoral areas was examined. Kruskal Wallis test, Mann-Whitney U test, cluster analysis, Cohen's kappa, receiver operating characteristic (ROC) curve, sensitivity, specifity,“univariate”logistic regression analysis, Spearman's rho correlation coefficient analyzes were performed using IBM SPSS Statistics for Windows 23. P<0.05 was considered statistically significant. Results: It was found that distinction of tumoral and non-tumoral VOIs at the paraffin blocks can be safely done by all structural parameters (all p values = 0.00). In addition, SAc was found to differ from CT, in terms of“percent object volume”(p=0.011). In addition, in this 4 study, the relationships between the structural microCT parameters and their histological counterparts were revealed. Conclusions: The current study is the first in the literature to investigate the differentiation of solid-patterned lung tumors from each other by microCT. With this study, information on the use and possible benefits of this method in the diagnosis of pulmonary tumors has been obtained. While this method can be used as an auxiliary method for routine histopathological examination in its current form, it can be speculated that it has the potential to replace histopathological examination in some areas, in the future, with its ability to perform a three-dimensional examination without disturbing the tissue integrity. The experience and knowledge of histopathologists on microanatomy of normal and lesional tissues must be used in understanding the possible benefits of this novel technique.
Benzer Tezler
- Üç farkli tam serami̇k restorasyonun i̇nternal ve marji̇nal uyumunun mi̇kro-BT tekni̇ği̇ i̇le değerlendi̇ri̇lmesi̇ ve bağlanma dayanimlarinin karşilaştirilmasi
The evaluation of internal and marginal fit of three different full ceramic restorations by micro-CT technique and the comparison of their tensile bond strength
NECLA DEMİR
Doktora
Türkçe
2014
Diş HekimliğiSelçuk ÜniversitesiProtetik Diş Tedavisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATİYE NİLGÜN ÖZTÜRK
- Posterolateral füzyonda yeni bir biyomalzeme – karbon nanotüp/ hidroksiapatit trikalsiyum fosfat kompoziti:Rat modeli
A novel biomaterial-carbon nanotube/ hydroxyapatite tricalcium phosphate composite for posterolateral fusion: Rat model
İSMAİL DALDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Ortopedi ve TravmatolojiGazi ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPASLAN ŞENKÖYLÜ
- BaTiO3 esaslı seramiklere çeşitli oksit ilavelerinin elektriksel özellikler üzerine etkisi
The effect of various oxides on the electrical properties of BaTiO3 based ceramics
KERİM EMRE ÖKSÜZ
Doktora
Türkçe
2018
Metalurji MühendisliğiSakarya ÜniversitesiMetalurji ve Malzeme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UĞUR ŞEN
- hBN and BaTiO3 reinforced PVDF-HFP matrix piezoelectric nanocomposites for flexible energy storage and harvesting applications
Esnek enerji depolama ve hasadı uygulamaları için hBN ve BaTiO3 takviyeli PVDF-HFP matrisli piezoelektrik nanokompozitler
LEVENT KÖROĞLU
Doktora
İngilizce
2024
Metalurji MühendisliğiEskişehir Teknik ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAN AY
- Ökzetik (auxetic) çok hücreli kiriş yapıların eğilme davranışı
Bending behaviour of auxetic multicellular beam structures
MEHMET FATİH KAHRAMAN
Doktora
Türkçe
2024
Makine MühendisliğiSakarya ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KENAN GENEL